RESUMEN:

Dentro de LabCollector  existen 13 módulos por defecto, entre los que se encuentran los Plásmidos módulo

Este módulo no sólo le ofrece la posibilidad de importar plásmidos, sino también crear los suyos propios con la ayuda del Editor de mapas de plásmidos. Pero para acceder a esta función y poder crear sus plásmidos, deberá seguir los pasos a continuación.

In Editor de mapas de plásmidos, tiene dos opciones para generar un plásmido, o crea uno modificando un diseño base (para usar esta función, todo lo que necesita hacer es hacer clic en ), o crear uno desde cero importando su secuencia de ADN correspondiente (para utilizar esta función, debe hacer clic en ).

1. Modo de diseño

• Ve a MÓDULO DE PLASMIDOS -> EDITOR DE MAPAS DE PLASMIDOS

• También puede editar un registro de plásmido ya existente haciendo clic en él y luego seleccionando el botón 'Secuencia y mapa' opción.

• Una vez hecho esto, verá la página siguiente.

• 1. Aquí puede ingresar el plásmido. nombre y su tamaño en pares de bases (pb). También puede acercar y alejar el plásmido con el botón 'radius' opción.
• 2. Esta área le brinda una vista previa de cómo se verá su plásmido mientras lo edita.
• 3. Caracteristicas La sección le permite agregar, por ejemplo, un ORF (Marco de lectura abierto), un ORI (Origen de Replicación) o un antibiótico (tetraciclina, ampicilina, etc.). A continuación se muestra una captura de pantalla con un ejemplo de algunas funciones que puede agregar.

No podrá visualizar la función a menos que haga clic en del botón.

• 4. Aquí puedes ingresar “Anotaciones adicionales“, como las secuencias codificantes (CDS) o sitios de unión de cebadores. También puedes agregar cualquier otra anotación adicional que necesites. A continuación se muestra una captura de pantalla con un ejemplo de algunas anotaciones que puede agregar.
  
• 5. Anotaciones de GenBank le permite agregar anotaciones directamente desde GenBank. Por ejemplo, digamos que descargó un archivo de plásmido de GenBank y lo cargó en el módulo de plásmido. Si desea agregar las mismas anotaciones que las presentes en GenBank, puede optar por visualizarlas y agregarlas a su plásmido marcando la casilla "Incluir anotaciones de GenBank" caja.
• 6. También puede añadir Sitios de restricción a su plásmido. Vea la captura de pantalla a continuación para ver un ejemplo.

• 7. Una vez terminado, puede guardar su plásmido haciendo clic en el botón Guardar después de darle un nombre, y se agregará automáticamente al módulo de plásmidos.

2. Dibujar a partir de una secuencia

• Una vez dentro del Editor de mapas de plásmidos, haga clic en ubicado en la parte superior. Luego verá la página siguiente.

• 1. Aquí puede copiar y pegar la secuencia de ADN que corresponde al plásmido que desea generar (como se muestra en la captura de pantalla anterior).

• 2. Aquí tienes una lista de todas las enzimas disponibles (a la izquierda) y otra pestaña ubicada a la derecha para el enzimas de restricción que vas a utilizar al importar su secuencia de ADN.
  • Puede seleccionar una enzima en la pestaña de la izquierda y hacer clic en el Añadir botón para agregarlo a la lista de enzimas que está dispuesto a usar, y también puede eliminar las que están listas para usar, seleccionándolas y luego haciendo clic en el botón eliminar , luego se transferirán automáticamente a la lista de enzimas disponibles.
• 3. Aquí tienes una tabla con una lista de diferentes códigos genéticos que puedes seleccionar, dependiendo de la tabla de codones y del tipo de especie con la que estés trabajando. (Consulte la captura de pantalla a continuación para obtener la lista completa de tablas de codones que puede usar).

• 4. Una vez terminado, haga clic en “¡Importa y dibuja!”para ver su plásmido (a continuación se muestra un ejemplo de un plásmido generado en función de su secuencia de ADN).

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