Importa i tuoi dati (versione 5.3 e successive) - LabCollector

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 Prepara il tuo LabCollector Banca dati. Prima di importare i dati, devi configurare il modulo su cui stai importando i dati creando i campi necessari e aggiungendo possibili valori dove richiesto. Vedi il nostro KB-Crea campo personalizzato 5.2v per ulteriori informazioni sulla creazione di campi personalizzati.
Assicurati che il tuo PHP abbia limiti aumentati: max_input_vars = 10000 o più (vedi KB-Importa file di grandi dimensioni).

Vai a: AMMINISTRAZIONE > Dati > Importa e scegli il modulo in cui desideri importare i tuoi dati (un file per modulo).

 L'importazione dei dati funziona solo con CSV o un altro file di testo con dati delimitati (ad eccezione dell'importazione di sequenze e molecole) e non direttamente da Excel (eccetto se copi/incolli i tuoi dati, vedi sotto punto 2), Access o altro software. Puoi convertire i tuoi dati in formato testo (file di testo con interruzione di riga DOS) con delimitatori di campo a tua scelta da Excel o altri tipi di database. Per i file Mac OS, salvali come formato CSV per Windows.

Ceppo e cellule – Campioni – Reagenti e forniture – Anticorpi – Plasmidi – Primer – Animali – Attrezzature – Rubrica – Moduli personalizzati

Scegli uno dei moduli qui sopra e segui questi passaggi.

1. Puoi utilizzare diversi file per importare i tuoi dati: due di questi file sono offerti da LabCollector contenente tutti i campi nel modulo di tua scelta con tag titolo legenda o tag titolo nome database in formato CSV; altrimenti puoi creare il tuo file con i nomi dei tuoi campi nell'ordine che preferisci. Tuttavia, i nomi dei campi devono corrispondere ai nomi esatti presenti in uno dei LabCollectorfile di.
Il nome della legenda è il nome del campo nel record del modulo, nel modulo o nell'elenco dei campi nelle aree dei campi predefiniti/personalizzati che assegni al campo. Il nome del database è disponibile nelle aree dei campi predefiniti/personalizzati ed è esente da caratteri speciali.


Organizza il tuo file per avere tutti i campi che desideri importare. La prima riga corrisponde ai nomi dei campi. Un campo per colonna.

Dati importati DEVE CONTENERE campi relativi a Nome (se hai impostato il tuo modulo con la denominazione automatica, lascia la colonna vuota) e proprietario (a meno che non si scelga di sovrascrivere i proprietari importati nelle opzioni avanzate – vedere di seguito – o il modulo non utilizzi il campo proprietario come nel modulo Reagenti e forniture).
Salva questo file in txt (Tab) o CSV (virgola o punto e virgola come separatore).

2. Carica il tuo file o copia/incolla le righe che desideri importare, SEMPRE con la prima riga corrispondente ai nomi dei campi.
Copiare/incollare da Excel è davvero semplice: seleziona le celle che vuoi incollare e copiale nel campo, non dimenticare le intestazioni!

3. Scegli il separatore di campo. Se copi/incolli da Excel, seleziona il separatore TAB.

4. Controlla i tuoi dati prima di scegliere di confermare. Puoi annullare l'importazione in caso di errori.

Opzioni avanzate:
In alto a destra, seleziona la casella per aprire la sezione delle opzioni.

R. Per impostazione predefinita, i caratteri vengono codificati con ISO-8859-1. Ciò ti consente di importare la maggior parte dei caratteri speciali come lettere gravi, acute, dieresi, circonflesse... UTF-8 deve essere utilizzato per alcune lingue (ad esempio cinese, greco...) se utilizzi un software che ti consente di salvare in CSV con UTF- 8 come codifica (ad esempio LibreOffice).

B. Se il tuo file Excel non ha Proprietario/Operatore principale/Responsabile/Autore (a seconda del modulo: i moduli Reagenti e forniture e Rubrica indirizzi non hanno campi Proprietario) o se desideri sovrascrivere questo campo, seleziona un proprietario nell'elenco. Gli amministratori possono importare dati con qualsiasi nome. Il personale può importare solo con il proprio nome. Nota: Come di Versione 5.4 il campo Proprietario è un campo facoltativo in Reagenti e forniture.

C. Puoi scegliere di importare in una lista d'attesa. Per quanto riguarda la modalità utente, un amministratore deve convalidare i dati in ADMIN > Dati > Lista di attesa. 

D. Se hai configurato la tua attrezzatura con l'opzione di stoccaggio automatico, puoi accedere a questo stoccaggio direttamente qui. Non hai la possibilità di scegliere la casella/ubicazione, LabCollector assegna automaticamente tutta la memoria.

Durante il passaggio 2, hai la possibilità di verificare il risultato dell'importazione prima della convalida finale.

  • Se non ci sono errori nel tuo file, puoi confermare l'importazione.

  • Se hai dimenticato la colonna del proprietario o hai dimenticato di selezionare un proprietario nell'elenco di selezione in Opzioni avanzate, riceverai questo messaggio di errore

  • Se utilizzi un proprietario che non è presente nell'elenco dei membri del lab o commetti un errore, riceverai questo messaggio di errore

  • Se hai dimenticato la colonna del nome o hai scelto il separatore di campo sbagliato, riceverai questo messaggio di errore

  • Se il tuo modulo è configurato come Blocca i duplicati in AMMINISTRAZIONE > Preferenze > Opzioni record e importi lo stesso nome due volte, riceverai questo messaggio

  • La casella di controllo e l'elenco di selezione possono essere importati. Il valore deve corrispondere ai valori esatti in LabCollector. Se il valore utilizzato nel file di importazione è sbagliato, riceverai questo messaggio. Se si sceglie di importare, non verrà importato il valore sbagliato.

  • Più tipi di campi di elenchi di selezione e caselle di controllo possono contenere più valori. Il valore deve corrispondere ai valori esatti in LabCollector ed essere separati da | (CTRL+ALT+6) o due punti (:). Non introdurre spazio prima e dopo il separatore. Se il valore utilizzato nel file di importazione è errato, verrà visualizzato il messaggio seguente. Se si sceglie di importare, non verrà importato il valore sbagliato.

  • È possibile importare i campi "Link a" e di completamento automatico. Per il campo "Collega a", il valore nel file deve corrispondere al nome esatto del record in esso contenuto LabCollector ed essere separati da | (CTRL+ALT+6) o due punti (:). Non introdurre spazio prima e dopo il separatore. Se un valore utilizzato nel file di importazione è errato, il valore errato non verrà importato. Il campo di completamento automatico è un campo di testo, se esiste il nome del record viene creato un collegamento; in caso contrario, il testo è disponibile

  • Nuova versione 5.41! Il sistema di importazione consente di rilevare l'unicità per il campo Codice univoco opzionale e il campo personalizzato con l'opzione di unicità attivata.

 Ogni record importato può avere un codice progetto. Ogni codice di progetto utilizzato deve già esistere in LabCollector per una corretta importazione.

 Campi personalizzati come Caricamento database ed Caricamento cartella disco non può essere importato. Si prega di utilizzare il componente aggiuntivo gratuito Caricamento del file del campo personalizzato.

 La data deve essere formattata come aaaa-mm-gg o aa-mm-gg, per maggiori dettagli leggere la Valore della data di formattazione KB.


Genotipo

I tag del genotipo devono essere separati da uno spazio.

sequenze


Puoi caricare direttamente il tuo file .FASTA (non .fas) formattato come:

>FN598458.1 Gene rRNA 18S parziale ciliato fillofaringide non coltivato, clone GM2_C8
ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGCATATGCTTGTCTTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGTTA
TACAAGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATTTATTTGACGATTGCCTTATATGGATAA
CCGAGGGAAACTTCAGCTAATACATGCTTGTCATTTGACGTATTTATTAGTTCCACCGATGGCTTAGGCC
TTTTGATGATTCATGATAACTGATCGAAGCGATTTCGCTACGTCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTCT
GATTGTAGTGTATTGGACTACAATGGCTATTACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGA
GCCTGAGAAACGGCTACTATGTCTACGGATAGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTGTAAATCACAGAG

e scegli il tipo di DNA, RNA o Proteina. Devi anche scegliere il proprietario delle sequenze di importazione (per impostazione predefinita, la persona associata al login dell'account).

Quando procedi al passaggio 2, ottieni:

Nota: puoi anche importare sequenze da GenBank tramite sequenze modulo.


Strutture chimiche
Per i formati file MOL e SDF, il file deve essere formattato con 3 righe di intestazione o tag opzionali (indicare il numero di tag)

Per il formato file CDX, puoi caricare più file o file ZIP.

Risultato del passaggio 2:


Documenti
Carica il tuo file come per gli altri moduli. Puoi anche associare i tuoi documenti ai record.


Aggiungi la colonna nome_file_originale contenente il nome esatto del documento che desideri importare nel file di importazione o incolla le righe come nell'esempio seguente.
Quindi, carica il file di importazione E tutti i documenti che desideri importare (più file come di seguito o un file zip).

Nel passaggio 2 puoi controllare il nome dei tuoi documenti.

Risultato nel database dopo l'importazione: