Hur börjar man med Sequences-modulen? - LabCollector

Sök kunskapsbas efter nyckelord

Du är här:
← Alla ämnen
SAMMANFATTNING:

Du kan kolla vår kunskapsbas på hur en modul generellt sett ser ut.

Följ dessa steg för att komma åt modulen Sekvenser:

1. Öppna modulen Sekvenser

2. Öppna en post

1. Öppna modulen Sekvenser

  • 1. Detta område kommer att visa dig namn av modulen, den Sök alternativ och låter dig lägga till en nytt rekord.
      - 1.1 Alternativet "Importera GenBank-data" hjälper dig att lägga till sekvenserna direkt från GenBank-webbplatsen. *Kolla vår KB på hur man importerar data i plasmidmodulen, processen för sekvenser förklaras i KB.
      - 1.2 Alternativet "Springa ny sekvens" hjälper dig att spränga eller Megablasta en sekvens.
    * Kontrollera vår kunskapsbas på hur man söker in LabCollector.
  • 2. De   alternativen låter dig exportera alla dina sökresultat i HTML, CSV, EXCEL, PDF-format. Du kan också välja fältet som du vill exportera.
        Läs vår kunskapsbas om vad som är fält och register.
        Smakämnen alternativet låter dig memorera alla poster som kan användas längre in LabCollector.
  • 3. Uppgifterna kommer vanligtvis inte att visas först. Du måste klicka på sökikonen med ett tomt sökfält och du kommer att kunna se alla poster.

2. Öppna en post

  • När du klickar på en viss post ser du alternativen nedan.

  • A. Postens namn och detaljer kommer att visas här.
  • B. Alternativ för att redigera posten kommer att visas här. Läs vår kunskapsbas redigeringsalternativ för poster.
  • C. Fälten relaterade till posten kommer att visas här. Läs vår kunskapsbas om vad som är fält.
  • D. Denna vertikala stapel ger dig alternativen relaterade till posten.
          

    		 Den här ikonen visar posten som visas i bilden ovan.
    Det här alternativet visar alla relaterade poster. Till exempel om du har en förälder och ett barn prover. Då kommer alla barnprover att visas här. eller om du har skapat en länk för denna post i andra moduler, kommer alla relaterade poster att synas här.
    Det här alternativet visar sekvensen (5′-3′) och linjär karta över sekvensen med alla anteckningar i FASTA-vyn, GB-format och formaterad vy.
    Det här alternativet hjälper dig att hantera sekvenskommentarer. Till exempel, om det är en sekvens av plasmid kan du lägga till kommentarer som vissa restriktionsställen eller promotorregioner. Här kan du se början/slutet och orienteringen (bakåt/framåt) för en specifik anteckning. Det betyder att när du importerar eller skapar en plasmid kan du välja vilka kommentarer du vill se eller ta bort. Om du importerar denna sekvens i plasmidmodulen kommer du att se dessa kommentarer i plasmidkartan.
    Detta alternativ erbjuder dig NCBI Blast-verktyg där du kan utföra en BLAST in LabCollector, externa webbplatser
    Detta alternativ låter dig redigera sekvensen. När du laddar upp en associerad fil kan du redigera sekvensbaserna.

    Du kan se analysfliken här. Detta kan visa dig analysvärdet över dagar eller timmar. Du kan lägga till ditt val av anpassade fält här.
    *Läs vår kunskapsbas på hur man lägger till anpassade fält på analysfliken.
    Du kan länka posten till Electronic Lab Notebook (ELN är ett tillägg i LabCollector). Du kan länka posten till ett visst experiment som har utförts med posten. Detta hjälper dig att ha en länk till var posten användes och resultaten som erhölls därefter.
    Den här ikonen ansluter dig till Workflow (WF)-tillägget LabCollector. WF-tillägget är det där du kan göra ett flödesschema över din process där varje steg kräver handledarvalidering. Om posten används i ett WF-tillägg kommer du att kunna se dess status i WF här.
  • E. Här kan du söka efter primrarna i Primers-modulen som hybridiserar (komplementär parning av DNA/RNA) med den vissa nukleotiden i plasmiden vid 3′-änden. Du kan välja antalet nukleotider som du vill söka efter primrarna. När du klickar på "Gör" kommer webbläsaren att öppna primersmodulen och visa dig listan med komplementära primers.
  • F. Här kan du se alla länkar som du har skapat för protokollet. Dessa länkar är till andra poster i andra moduler i LabCollector. Till exempel om du har en plasmid för en specifik bakteriestam. Sedan kan du koppla plasmidposten från plasmidmodulen till bakterieposten i stammar och celler-modulen. Du kan lägga till en länk från LabCollector genom att klicka på alternativet "Lägg till en länk" och genom att klicka på alternativet "Öppna trädvy" kan du se länkarna som är kopplade till posterna. 

Relaterade ämnen: