is een toonaangevende leverancier van geautomatiseerde genotyperingsoplossingen voor onderzoekers. Door gebruik te maken van hun eigen genotyperingstechnologie biedt Transnetyx snelle, betrouwbare en kosteneffectieve genotyperingsdiensten. Het elimineert de noodzaak van handmatige processen, waardoor kostbare tijd en moeite in het laboratorium wordt bespaard. Hun genotyperingsdiensten zijn beschikbaar voor muizen, zebravissen, ratten en meer. U kunt hun website bezoeken door op het volgende te klikken link.

De volgende Knowledge Base behandelt alle essentiële stappen die nodig zijn om een ​​bestelling in te vullen en naar Transnetyx te sturen, hoe u de ontvangen resultaten kunt bekijken en controleren, uw soorten kunt beheren en nog veel meer!

Transnetyx is toegankelijk via de Tube Sorter-add-on

OVERZICHT:

1. Inleiding tot Transnetyx

2. Integratievoordelen

3. Bestellingen invullen en verzenden

4. Ontvangen resultaten controleren

5. Omgaan met spanningen

6. instellingen

1. Inleiding tot Transnetyx:

zorgt voor een revolutie in genetische analyse met geautomatiseerde genotyperingsoplossingen. Hun geavanceerde technologie levert snelle, nauwkeurige en kosteneffectieve resultaten op, waardoor onderzoek wordt vereenvoudigd en tijd wordt bespaard. Met Transnetyx kunnen onderzoekers zich concentreren op hun doelstellingen en tegelijkertijd betrouwbare genotyperingsgegevens verkrijgen.

Genotypering speelt een cruciale rol bij het begrijpen van genetische variaties, genexpressie en ziektegevoeligheid. Traditioneel omvat genotypering complexe laboratoriumtechnieken en vereiste er veel tijd en middelen. Transnetyx heeft dit proces echter vereenvoudigd door een uitgebreide, end-to-end oplossing aan te bieden die geavanceerde technologie combineert met uitzonderlijke gegevensnauwkeurigheid.

2. Integratievoordelen:

Door samen te werken met Transnetyx, LabCollector gebruikers krijgen toegang tot een zeer betrouwbaar genotyperingsplatform dat resultaten levert met uitzonderlijke snelheid en nauwkeurigheid. Deze integratie verbetert de efficiëntie van de genotyperingsworkflow verder, waardoor een naadloze gegevensoverdracht en het ophalen van resultaten mogelijk wordt.

3. Bestellingen invullen en verzenden:

Om bestellingen in te vullen en te verzenden LabCollector naar Transnetyx, volg deze stappen:

a. Inloggen LabCollector en navigeer naar de Tube Sorter-add-on . Zoek de Transnetyx-tool, die toegankelijk is via de intuïtieve interface (zoals weergegeven in de onderstaande schermafbeelding).

b. U kunt de lijst met bestellingen bekijken door op te klikken (zoals weergegeven in de onderstaande schermafbeelding). Hiermee krijgt u een overzicht van alle eerdere bestellingen, de interface biedt verschillende filtermogelijkheden op basis van de bestelstatus. U kunt bestellingen sorteren op basis van voltooiing, annulering, voortgang, onvolledigheid, ontvangststatus (nog niet ontvangen, gedeeltelijk voltooid, ontvangen maar in afwachting van onderzoek, ontvangen maar de bestelling was gedeeltelijk, enz.) en meer.

Voor meer gemak kunt u ervoor kiezen om bestellingen uit specifieke tijdsbestekken te bekijken, zoals de afgelopen dagen, weken, maanden of zelfs jaren. Dankzij deze flexibiliteit kunt u zich concentreren op het relevante tijdsbestek voor uw analyse.

Om specifieke bestellingen snel te vinden, kunt u de zoekbalk rechts van de interface gebruiken. Voer eenvoudig relevante trefwoorden of bestelgegevens in om uw zoekresultaten te verfijnen.

.

Wanneer u op het pictogram met de drie stippen klikt , verschijnt er een handige pop-uppagina met verschillende details, zoals: bestelinformatie, inclusief het bestel-ID en de status. Bovendien heeft u binnen de bestelling toegang tot de details van elk afzonderlijk monster.

• • Op de pop-uppagina presenteert het gedeelte met algemene informatie cruciale details, zoals de naam van de putplaat, de locatie van de putplaat en de bijbehorende stamnaam. Deze informatie helpt onderzoekers om snel specifieke monsters te identificeren en te lokaliseren binnen hun genotyperingsworkflow.

• • In de onderstaande schermafbeelding ziet u de aanwezigheid van een speciaal resultatengedeelte op de pop-uppagina. In deze sectie kunt u direct alle resultaten bekijken die aan het geselecteerde monster zijn gekoppeld. De resultaten omvatten essentiële gegevenspunten zoals het probe-ID-nummer, de probe-naam, het probe-resultaat en de bijbehorende ordinale waarde.

c. Om een ​​nieuwe bestelling aan te maken, volgt u de onderstaande stappen:

• Klik op de aangewezen knop om de creatie van een nieuwe orde te initiëren. Er verschijnt een formulier waarin u de relevante informatie voor de bestelling kunt invoeren.
• De eerste stap bestaat uit het invullen van het hoofdinformatiegedeelte, dat het volgende omvat:
  • Serviceniveau: Kies tussen 24-uurs (prioriteit) of 72-uurs (standaard) serviceopties.
  • Betaalmethode: kies uit opties zoals inkooporder, creditcard, factuur zonder inkoopordernummer, of markeer als niet beschikbaar als er geen betaalmethode vereist is.
  • E-mailadres: Geef uw e-mailadres op voor bestelmeldingen.
  • Trackingnummer: Voer een trackingnummer in dat bestaat uit 3 tot 15 cijfers.

• Ga naar de tweede stap Door op de knop te klikken knop. Hier geef je details over je soorten:
  • Selecteer stammen: Kies de stammen die u wilt analyseren.
  • Sondes: specificeer de gewenste genotyperingsmarkers.
  • Aantal monsters: geef het aantal monsters voor elke stam aan.
  • Aanvullende opmerkingen: Voeg alle relevante informatie over uw stammen toe waarvan u wilt dat Transnetyx dit weet vóór de analyse.
  • Controlemonsters: Vink het bijbehorende selectievakje aan als de geleverde monsters controlemonsters zijn.
  • Klik op om snel de gewenste soorten in de bestelling in te voeren.
  • U hebt ook de mogelijkheid om Hiermee kunt u snel de gewenste soorten aan de bestelling toevoegen, zonder ze één voor één te hoeven selecteren.
  • Nadat u al uw soorten heeft toegevoegd, kunt u ze indien nodig bewerken of verwijderen voordat u doorgaat naar de volgende stap.

• In het derde stap, wijs een naam toe aan uw putplaten. Elke plaat bestaat uit 92 putjes en de naam moet beginnen met de letters T, E of B en moet tussen de 3 en 15 tekens lang zijn.

• Verhuizen naar de vierde en laatste stap, schrijf elke stam toe aan een put. U kunt individuele etiketten scannen en afhankelijk van uw keuze worden deze automatisch verticaal of horizontaal aan de plaat toegevoegd. Als alternatief kunt u gebruik maken van de functie om snel uw reeds opgeslagen samples in te voeren.

• Het is belangrijk om alle monsters in te voeren die nodig zijn om de bestelling succesvol te kunnen verwerken. Zodra alle monsters zijn toegevoegd, wordt de wellplate automatisch grijs weergegeven, wat aangeeft dat deze voltooid is.

d. Om het aanmaken van de bestelling te voltooien, klikt u eenvoudigweg op de knop. Nadat u heeft geklikt, ontvangt u een bevestigingsbericht waarin wordt aangegeven dat uw bestelling succesvol is verzonden (zoals weergegeven in de onderstaande schermafbeelding).

e. LabCollector genereert automatisch een uniek order-ID voor elke aangemaakte bestelling. Deze bestel-ID dient als referentie voor tracking en stelt u in staat uw bestellingen gemakkelijk te identificeren en te beheren. Je kunt het toegewezen order-ID vinden in het bevestigingsbericht, zoals weergegeven in de bovenstaande schermafbeelding.

4. Ontvangen resultaten controleren:

Zodra Transnetyx de genotyperingsanalyse heeft voltooid, kunnen de resultaten naadloos worden geïntegreerd in LabCollector voor gemakkelijke toegang. Zo kunt u de ontvangen resultaten controleren en bekijken:

a. Navigeer naar de pagina.

b. Lokaliseer de relevante bestelling met behulp van de unieke bestel-ID of zoekfunctionaliteit (u kunt er ook naar zoeken door de periode te selecteren waarin ze zijn voltooid, bijvoorbeeld: 10 dagen, 3 maanden, 5 jaar… enz.).

c. U kunt de resultaten groeperen op basis van verschillende criteria. Of u ze nu wilt groeperen op basis van de datum waarop ze zijn voltooid, hun stamnaam, locatie van de putplaat, monsternaam en nog veel meer, klik eenvoudigweg op de overeenkomstige optie in de bovenste regel.

d. Bekijk en analyseer de genotyperingsresultaten direct binnen LabCollector.

5. Omgaan met soorten:

LabCollector biedt robuuste mogelijkheden voor stambeheer in samenwerking met Transnetyx. Met deze functie kunt u verschillende soorten effectief organiseren en volgen, samen met de bijbehorende genotyperingsgegevens.
In het sectie vindt u:

• Transnetyx-soorten: Hier vind je alle soorten die in Transnetyx zijn gemaakt:
  • Om deze stammen te beheren, selecteert u de overeenkomstige probes die relevant zijn voor elke stam.
  • Je hebt ook de mogelijkheid om specifieke kleuren toe te wijzen om onderscheid te maken tussen verschillende soorten.
  • Als er soorten zijn die niet langer nodig zijn, kunt u deze eenvoudig uit deze sectie verwijderen.

• LabCollector stammen: In deze sectie kun je de soorten bekijken en beheren die erin zijn gemaakt LabCollector:
  • Elke soort gaat vergezeld van een synchronisatiepictogram rechts van de ingang.
  • Een groen synchronisatiepictogramgeeft aan dat de stammen met succes zijn gesynchroniseerd tussen LabCollector en Transnetyx.
  • Als het synchronisatiepictogram verschijnt als , geeft dit aan dat de stammen niet gesynchroniseerd zijn LabCollector en Transnetyx.

6. Instellingen:

Volg deze gedetailleerde stappen om uw Transnetyx-instellingen te configureren:

• Navigeer naar de pagina.
• Hier vindt u bepaalde velden, zoals:
  • Token vernieuwen: Voer uw Transnetyx-vernieuwingstoken in. Dit token is een unieke identificatie die dit mogelijk maakt LabCollector om uw Transnetyx-account veilig te authenticeren en toegang te krijgen.
  • klant-ID: Geef uw Transnetyx-client-ID op. Deze ID dient als referentie LabCollector gebruikt om verbinding te maken met uw Transnetyx-account.
  • Cliëntgeheim: Voer uw Transnetyx-clientgeheim in. Het fungeert als een wachtwoord voor authenticatie en autorisatie LabCollector's toegang tot uw Transnetyx-account.
  • E-mailadres: Voer het e-mailadres in dat aan uw Transnetyx-account is gekoppeld. Dit zorgt voor een goede communicatie en synchronisatie tussen LabCollector en Transnetyx.

• Sla ten slotte de ingevoerde instellingen op om de configuratiewijzigingen toe te passen.

De integratie van in LabCollector biedt u een krachtige oplossing voor het automatiseren van genotyperingsprocessen en het verbeteren van laboratoriumgegevensbeheer. Door de hierboven beschreven stappen te volgen, kunt u efficiënt bestellingen invullen en verzenden, ontvangen resultaten bekijken en analyseren, en spanningen effectief beheren. Deze integratie bespaart niet alleen tijd, maar zorgt ook voor een naadloze gegevensoverdracht, waardoor onderzoekers zich kunnen concentreren op hun belangrijkste wetenschappelijke doelstellingen.

Gerelateerde onderwerpen:

• Kijk in onze KB op LabCollector's Linux-vereisten en installatie.
• Bekijk onze  Inleiding tot LabCollector API.
• Lees onze KB verder LabCollector installatievereisten voor AWS.