Hoe gebruik ik het Plate Normalization Tool in de Tube Sorter-add-on? - LabCollector

Zoek in de kennisbank op trefwoord

U bent hier:
← Alle onderwerpen

De Buizensorteerder aanvulling binnen LabCollector is een veelzijdige tool die een verscheidenheid aan functies biedt om uw laboratoriumworkflow te stroomlijnen. Met deze krachtige add-on kunt u eenvoudig Fludigm-biomarkbestanden maken, waardoor u snel en efficiënt grote hoeveelheden gegevens kunt verwerken. Bovendien kunt u met de functie voor het samenvoegen van platen meerdere platen in één combineren, waardoor u uw monsters eenvoudiger kunt beheren en ordenen. De add-on bevat ook een functie voor het genereren van voorbeeldmanifestbestanden, die een gedetailleerd overzicht biedt van de voorbeelden die in experimenten worden gebruikt. Er is ook de functie voor het in kaart brengen van platen van 96 tot 384, waarmee u eenvoudig verschillende plaatformaten kunt overzetten en creëren, terwijl u met de functie Volume uit monsters verwijderen het volume van uw monsters nauwkeurig kunt aanpassen. Bovendien kunt u met de functie voor het poolen van platen monsters van meerdere platen combineren tot één samengevoegd monster, waardoor u tijd en middelen bespaart. Met de Buizensorteerder add-on kunt u uw monsters eenvoudig en efficiënt beheren, waardoor het een essentieel hulpmiddel is voor elk laboratorium.

Dit alles is ontworpen met een gebruiksvriendelijke en intuïtieve interface en een duidelijke lay-out waardoor u gemakkelijk kunt navigeren.

In de volgende Knowledge Base laten we u zien wat de normalisatie instrument en hoe je het kunt gebruiken. Kortom, deze krachtige tool is ontworpen om onderzoekers te helpen bij het normaliseren van de concentraties en volumes van monsters in hun laboratoriumworkflows.

1. Wat is het Plate Normalization Tool en hoe gebruik je het?

2. Voordelen van het gebruik van de normalisatietool

3. Voorbeeld van gebruiksscenario's

1. Wat is het Plate Normalization Tool en hoe gebruik je het?

  • Plaatnormalisatie is een proces waarbij de concentratie van monsters in een plaat wordt aangepast aan een specifieke doelconcentratie. Dit kan worden gedaan door vloeistof aan de monsters toe te voegen of te verwijderen, of door de monsters te verdunnen met een buffer. Deze stap is vaak cruciaal voor downstream-toepassingen zoals PCR, ELISA en NGS, waarbij consistente monsterconcentraties nodig zijn voor nauwkeurige en betrouwbare resultaten.
  • Met de vernieuwde normalisatietool in de add-on Tube sorter kunnen gebruikers eenvoudig de concentraties en volumes van hun monsters normaliseren. Om deze tool te gebruiken, gaat u eenvoudigweg naar de Tube Sorter-add-on , klik dan op en selecteer Normalisatie in de lijst, of klik eenvoudigweg op het overeenkomstige tabblad, zoals weergegeven in de onderstaande schermafbeelding:

  • Als u klaar bent, wordt u doorgestuurd naar de volgende pagina:

  • Hier kunt u de doos/plaat selecteren waarvan u de lijst met bestaande monsters wilt ophalen, door de naam in te voeren of eenvoudigweg door de barcode te scannen. Nadat u uw bord/doos heeft gekozen, klikt u op , verschijnt er een nieuwe pagina (zoals weergegeven in de onderstaande schermafbeelding).

 

    • 1: Hier ziet u een lijst van alle monsters in uw doos/bord, samen met de bijbehorende gegevens, zoals hun ID-nummer, de buiscode, naam, positie, volume en in welk rek/tray ze zijn gevonden. U heeft ook de mogelijkheid om de boxkaart te visualiseren, door op het volgende icoontje te klikken  (bevindt zich rechts van de tafel).
Tips/hints
U kunt op klikken bevindt zich in de eerste kolom om alle monsters in de doos/plaat te deselecteren/selecteren.
    • 2: Hier kunt u het aantal buizen zien dat in de doos/plaat is gevonden, de buizen die niet zijn gevonden, plus de beschikbare buizen, en het totale aantal buizen.
    • 3: U kunt een werklijst maken op basis van de geselecteerde monsters door op te klikken .
    • 4: U kunt er ook voor kiezen om alle geselecteerde items uit het geheugen te verwijderen door op te klikken .
    • 5: Hier moet u de doelconcentratie invoeren die u wilt dat uw monsters bereiken. U kunt ook kiezen uit 3 verschillende concentratie-eenheden (ng/ul, nM, nmol / L).
    • 6: Selecteer uw doelvolume of het monstervolume dat u wilt overbrengen (ml, ul).
    • 7: U heeft de mogelijkheid om uw monsters te beperken tot de geselecteerde doelvolume + minimumvolume.
    • 8: U kunt het exacte doelveld selecteren waarin u de nieuwe concentratie wilt invoeren.
    • 9: Sorteer ten slotte uw monsters op rij (A1, A2, A3... enz.) of op kolom (A1, B1, C1... enz.). Als u klaar bent, klikt u op .
  • Nadat u uw voorkeursopties heeft geselecteerd en op heeft geklikt , er verschijnt een nieuw tabblad:

    • 1: U kunt het exacte aantal monsters zien dat moet worden bijgewerkt volgens de opties die u eerder hebt geselecteerd, plus de monsters die moeten worden verwijderd. Ook kunt u kiezen of u wel of niet onvoldoende buisjes wilt verwijderen. Zodra u klaar bent, drukt u op “Update huidige plaat'.
    • 2: Hier kunt u een nieuwe plaatnaam, opslaglocatie, lade en positie in lade invoeren. Je kan ook "update de huidige plaat en maak een secundaire plaat met doelvolumes'.
    • 3: U heeft de mogelijkheid om uw bord te exporteren als een CSV bestand of als een Lynx bestand.
    • 4: Hier heeft u een overzichtstabel met een lijst van alle monsters, samen met alle benodigde details, zoals de initiële monsterconcentratie/volume, doelconcentratie/volume, …enz.

2. Voordelen van het gebruik van de normalisatietool

  • Consistente monsterconcentraties: Door de concentraties van monsters in een plaat te normaliseren, kunnen onderzoekers ervoor zorgen dat ze met consistente en betrouwbare monsters werken, wat cruciaal is voor downstream-toepassingen.
  • Tijdbesparend: De normalisatietool automatiseert het proces van het aanpassen van monsterconcentraties, waardoor onderzoekers kostbare tijd en moeite besparen.
  • Verbeterde nauwkeurigheid: Door monsters te normaliseren kunnen onderzoekers de nauwkeurigheid van hun resultaten verbeteren en het risico op experimentele fouten verkleinen.

3. Voorbeelden van gebruiksscenario's

  • PCR: Het normalisatiehulpmiddel kan worden gebruikt om ervoor te zorgen dat alle monsters in een PCR-plaat dezelfde DNA-concentratie hebben, wat nodig is voor nauwkeurige en betrouwbare resultaten.
  • ELISA: Het hulpmiddel kan worden gebruikt om de concentraties van monsters in een ELISA-plaat aan te passen, zodat alle monsters zich binnen het lineaire bereik van de assay bevinden.
  • NGS: De versie 2.5 van de Tube Sorter-add-on bevat een Lynx-exporteur, waardoor deze ideaal is voor NGS-workflows.

    Concluderend: de normalisatietool is essentieel voor onderzoekers die de consistentie en betrouwbaarheid van hun laboratoriumworkflows willen verbeteren. Met zijn gebruiksvriendelijke interface en krachtige functies is deze tool ontworpen om het normalisatieproces snel, eenvoudig en nauwkeurig te maken. Het kan ook worden gebruikt in verschillende toepassingen zoals PCR, ELISA en NGS, en met de nieuwe Lynx-exporteur is het zelfs nog geschikter voor NGS-workflows.

    Gerelateerde onderwerpen: