Kuinka aloittaa Sequences-moduuli? - LabCollector

Hae tietokannasta avainsanan mukaan

Sinä olet täällä:
← Kaikki aiheet
YHTEENVETO:

Voit tarkistaa tietokantaamme osoitteessa miltä moduuli yleensä näyttää.

Siirry Sequences-moduuliin noudattamalla näitä ohjeita:

1. Avaa Sequences-moduuli

2. Avaa tietue

1. Avaa Sequences-moduuli

  • 1. Tämä alue näyttää sinulle nimi moduulista, haku vaihtoehtoja ja voit lisätä a uusi ennätys.
      - 1.1 "Import GenBank Data" -vaihtoehto auttaa sinua lisäämään sekvenssit suoraan GenBank-sivustolta. *Tarkista KB:stämme kuinka tuodaan tietoja plasmidimoduuliin, sekvenssien prosessi on selitetty KB:ssä.
      - 1.2 "Blast uusi sekvenssi" -vaihtoehto auttaa sinua Blast tai Megablast sekvenssin.
    * Tarkista tietopohjamme kuinka etsiä LabCollector.
  • 2.   vaihtoehtojen avulla voit viedä kaikki hakutulokset HTML-, CSV-, EXCEL- tai PDF-muodossa. Voit myös valita kentän, jonka haluat viedä.
        Lue KnowledgeBase-tietokannastamme, mitä ne ovat kentät ja asiakirjat.
        - -vaihtoehdon avulla voit tallentaa kaikki tietueet, joita voidaan käyttää myöhemmin LabCollector.
  • 3. Tietueet eivät yleensä näy aluksi. Sinun on napsautettava hakukuvaketta, jossa on tyhjä hakukenttä, ja näet kaikki tietueet.

2. Avaa tietue

  • Kun napsautat tiettyä tietuetta, näet alla olevat vaihtoehdot.

  • A. Tietueen nimi ja tiedot näkyvät täällä.
  • B. Tietueen muokkausvaihtoehdot näkyvät tässä. Lue tietokantaamme tallenteiden muokkausvaihtoehdot.
  • C. Tietueeseen liittyvät kentät näkyvät tässä. Lue KnowledgeBase-tietokannastamme, mitä ne ovat kentät.
  • D. Tämä pystypalkki tarjoaa sinulle tietueeseen liittyvät vaihtoehdot.
          

    Tämä kuvake näyttää tietueen yllä olevan kuvan mukaisesti.
    Tämä vaihtoehto näyttää kaikki asiaan liittyvät tietueet. Jos sinulla on esimerkiksi vanhemman ja lapsen näytteitä. Sitten kaikki lapsinäytteet näytetään täällä. tai jos olet luonut linkin tälle tietueelle muissa moduuleissa, kaikki siihen liittyvät tietueet näkyvät täällä.
    Tämä vaihtoehto näyttää sekvenssin (5′-3′) ja sekvenssin lineaarisen kartan kaikkine huomautuksineen FASTA-näkymässä, GB-muodossa ja muotoillussa näkymässä.
    Tämä vaihtoehto auttaa hallitsemaan sarjamerkintöjä. Esimerkiksi, jos se on plasmidisekvenssi, voit lisätä huomautuksia, kuten joitain restriktiokohtia tai promoottorialueita. Tässä voit tarkkailla tietyn merkinnän alkua/loppua ja suuntaa (taakse/eteenpäin). Tämä tarkoittaa, että kun tuot tai luot plasmidin, voit valita, mitkä merkinnät haluat nähdä tai poistaa. Jos tuot tämän sekvenssin plasmidimoduuliin, näet nämä huomautukset plasmidikartassa.
    Tämä vaihtoehto tarjoaa sinulle NCBI Blast -työkalut, joissa voit suorittaa BLASTin LabCollector, ulkoiset sivustot
    Tämän vaihtoehdon avulla voit muokata sarjaa. Kun lataat liitetyn tiedoston, voit muokata sekvenssipohjaa.

    Analyysi-välilehden näet täältä. Tämä voi näyttää sinulle analyysiarvon päivinä tai tunteina. Voit lisätä valitsemasi mukautetut kentät tähän.
    *Lue tietokantaamme kuinka lisätä mukautettuja kenttiä analyysivälilehdelle.

    Voit linkittää tietueen Electronic Lab Notebookiin (ELN on lisäosa LabCollector). Voit linkittää tietueen tiettyyn kokeeseen, joka on suoritettu tietuekohteen avulla. Tämä auttaa sinua saamaan linkin, missä tietuekohdetta hyödynnettiin ja sen jälkeen saadut tulokset.
    Tämä kuvake yhdistää sinut Workflow (WF) -lisäosaan LabCollector. WF-lisäosa on se, jossa voit tehdä prosessistasi vuokaavion, jossa jokainen vaihe vaatii valvojan vahvistuksen. Jos tietuetta käytetään WF-lisäosassa, voit nähdä sen tilan WF:ssä täältä.
  • E. Täältä voit etsiä alukkeita alukkeet-moduulista, jotka hybridisoituvat (DNA/RNA:n komplementaarinen pariutuminen) plasmidin tietyn nukleotidin kanssa 3'-päässä. Voit valita nukleotidien määrän, joista haluat etsiä alukkeita. Kun napsautat "Tee", selain avaa alukkeiden moduulin ja näyttää luettelon täydentävistä alukkeista.
  • F. Täältä näet kaikki tietueelle luomasi linkit. Nämä linkit ovat muiden moduulien muihin tietueisiin LabCollector. Esimerkiksi jos sinulla on plasmidi tietylle bakteerikannalle. Sitten voit yhdistää plasmiditietueen plasmidimoduulista kantojen ja solujen bakteeritietueeseen. Voit lisätä linkin osoitteesta LabCollector klikkaamalla vaihtoehtoa "Lisää linkki" ja napsauttamalla "Avaa puunäkymä" -vaihtoehtoa näet tietueisiin liittyvät linkit. 

Aiheeseen liittyviä aiheita: