Импортирайте вашите данни (версия 5.3 и по-нова) - LabCollector

Търсене в базата знания по ключова дума

Ти си тук:
← Всички теми
Достъпно за ВСИЧКИ потребители, с изключение на разрешение на ниво потребител и посетител

 Подгответе си LabCollector база данни. Преди да импортирате данни, трябва да конфигурирате модула, който импортирате, като създадете полетата, от които се нуждаете, и добавите възможни стойности, където е необходимо. Вижте нашите KB-Създаване на потребителско поле 5.2v за повече информация относно създаването на персонализирани полета.
Уверете се, че вашият PHP има увеличени ограничения: max_input_vars = 10000 или повече (виж KB-Импортиране на големи файлове).

Отиди на: АДМИНИСТРАТОР > Данни > Импортиране и изберете модула, където искате да импортирате вашите данни (един файл на модул).

 Импортирането на данни работи само с CSV или друг текстов файл с разграничени данни (с изключение на последователности и импортиране на молекули), а не директно от Excel (освен ако копирате/поставите вашите данни, вижте по-долу точка 2), Access или друг софтуер. Можете да преобразувате вашите данни в текстов формат (текстов файл с DOS прекъсване на ред) с разделители на полета по ваш избор от Excel или други типове бази данни. За Mac OS файлове, запишете ги като CSV за Windows формат.

Щамове и клетки – Проби – Реагент и консумативи – Антитела – Плазмиди – Праймери – Животни – Оборудване – Адресна книга – Персонализирани модули

Изберете един от модулите по-горе и следвайте тези стъпки.

1. Можете да използвате различни файлове, за да импортирате вашите данни: два такива файла се предлагат от LabCollector съдържащ всички полета в модула по ваш избор или с етикети за заглавие на легенда, или етикети за заглавие на име на база данни във формат CSV; в противен случай можете да създадете свой собствен файл с имената на вашите полета в реда, който предпочитате. Имената на полетата обаче трябва да съвпадат с точните имена, както са в едно от LabCollectorфайлове на
Името на легендата е името на полето в записа на модула, формуляра или в списъка с полета в областите за полета по подразбиране/по избор, които давате на полето. Името на базата данни е налично в областите на полетата по подразбиране/по избор и е освободено от специални знаци.


Организирайте файла си, за да имате всички полета, които искате да импортирате. Първият ред отговаря на имената на полетата. Едно поле по колона.

Импортирани данни ТРЯБВА ДА СЪДЪРЖА полета, свързани с име (ако сте настроили вашия модул с автоматично именуване, оставете колоната празна) и собственик (освен ако не изберете да замените импортираните собственици в разширените опции – вижте по-долу – или модулът не използва полето за собственик, както в модула „Реагент и консумативи“).
Запазете този файл в txt (Tab) или CSV (запетая или точка и запетая като разделител).

2. Качете вашия файл или копирайте/поставете редовете, които искате да импортирате, ВИНАГИ с първия ред, съответстващ на имената на полетата.
Копирането/поставянето от excel е много лесно: изберете клетките, които искате да поставите, и ги копирайте в полето, не забравяйте заглавките!

3. Изберете разделителя на полето. Ако копирате/поставите от Excel, изберете разделителя TAB.

4. Проверете данните си, преди да изберете да потвърдите. Можете да отхвърлите импортирането, ако има грешка.

Разширени опции:
Горе вдясно поставете отметка в квадратчето, за да отворите секцията с опции.

О. По подразбиране знаците са кодирани с ISO-8859-1. Това ви позволява да импортирате повечето специални знаци, като например букви с надписи, акути, диареза, циркумфлекс... UTF-8 трябва да се използва за някои езици (напр. китайски, гръцки...), ако използвате софтуер, който ви позволява да записвате в CSV с UTF- 8 като кодиране (например LibreOffice).

B. Ако вашият excel файл няма собственик/главен оператор/отговорник/автор (в зависимост от модула – модулите Reagents & Supplies и Address Book нямат полета за собственик), или ако искате да презапишете това поле, изберете един собственик в списъка. Администраторите могат да импортират данни под всяко име. Персоналът може да импортира само под собственото си име. Забележка: Към версия 5.4 полето Собственик е незадължително поле в Реактиви и консумативи.

C. Можете да изберете да импортирате в списък с чакащи. Що се отнася до потребителя на режима, администраторът трябва да потвърди данните в ADMIN > Data > Waiting list. 

D. Ако сте конфигурирали вашето оборудване с опцията за автоматично съхранение, можете да получите достъп до това хранилище директно тук. Нямате избор на кутия/локация, LabCollector присвоява цялото хранилище автоматично.

По време на стъпка 2 имате възможност да проверите резултата от импортирането преди окончателното валидиране.

  • Ако няма грешка във вашия файл, можете да потвърдите импортирането.

  • Ако сте забравили колоната собственик или сте забравили да изберете един собственик в списъка за избор под Разширени опции, ще получите това съобщение за грешка

  • Ако използвате собственик, който не е в списъка с членове на лабораторията, или направите грешка, ще получите това съобщение за грешка

  • Ако сте забравили колоната с име или сте избрали грешен разделител на полето, ще получите това съобщение за грешка

  • Ако вашият модул е ​​настроен като Блокиране на дубликати под АДМИНИСТРАТОР > Предпочитания > Опции за записи и импортирате едно и също име два пъти, ще получите това съобщение

  • Квадратчето за отметка и списъкът за избор могат да бъдат импортирани. Стойността трябва да съответства на точните стойности в LabCollector. Ако стойността, използвана във файла за импортиране, е грешна, ще получите това съобщение. Ако изберете да импортирате, грешната стойност няма да бъде импортирана.

  • Множество типове полета за списък и поле за отметка могат да съдържат множество стойности. Стойността трябва да съответства на точните стойности в LabCollector и да бъдат разделени с | (CTRL+ALT+6) или двоеточие (:). Не въвеждайте интервал преди и след разделителя. Ако стойността, използвана във файла за импортиране, е грешна, ще получите съобщението по-долу. Ако изберете да импортирате, грешната стойност няма да бъде импортирана.

  • „Връзка към“ и полета за автоматично попълване могат да бъдат импортирани. За полето „Връзка към“ стойността във вашия файл трябва да съответства на точното име на записа в LabCollector и да бъдат разделени с | (CTRL+ALT+6) или двоеточие (:). Не въвеждайте интервал преди и след разделителя. Ако дадена стойност, използвана във файла за импортиране, е грешна, грешната стойност няма да бъде импортирана. Полето за автоматично попълване е текстово поле, ако името на записа съществува, се създава връзка; ако не, текстът е наличен

  • Нова версия 5.41! Системата за импортиране позволява откриване на уникалност за незадължително поле за уникален код и потребителско поле с активирана опция за уникалност.

 Всеки импортиран запис може да има код на проекта. Всеки използван проектен код трябва вече да съществува в LabCollector за правилен внос.

 Персонализирани полета като Качване на база данни намлява Качване на папка на диск не може да се импортира. Моля, използвайте безплатната добавка Качване на файл с персонализирано поле.

 Датата трябва да бъде форматирана като гггг-мм-дд или гг-мм-дд, за повече подробности, моля, прочетете Стойност на датата на KB-форматиране.


генотип

Етикетите за генотип трябва да бъдат разделени с интервал.

Последователност


Можете да качите директно вашия .FASTA файл (не .fas), форматиран като:

>FN598458.1 Некултивиран частичен 18S рРНК ген на филофарингидни ресничести, клонинг GM2_C8
ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGCATATGCTTGTCTTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGTTA
TACAAGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATTTATTTGACGATTGCCTTATATGGATAA
CCGAGGGAAACTTCAGCTAATACATGCTTGTCATTTGACGTATTTATTAGTTCCACCGATGGCTTAGGCC
TTTTGATGATTCATGATAACTGATCGAAGCGATTTCGCTACGTCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTCT
GATTGTAGTGTATTGGACTACAATGGCTATTACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGA
GCCTGAGAAACGGCTACTATGTCTACGGATAGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTGTAAATCACAGAG

и изберете тип ДНК, РНК или протеин. Трябва също така да изберете собственика на последователностите за импортиране (по подразбиране, лицето, свързано с влизането в акаунта).

Когато преминете към стъпка 2, получавате:

Забележка: Можете също да импортирате последователности от GenBank чрез Последователност модул.


Химически структури
За файлов формат MOL и SDF вашият файл трябва да бъде форматиран с 3 заглавни реда или незадължителни тагове (посочете броя на таговете)

За файлов формат CDX можете да качите множество файлове или ZIP файлове.

Резултат от стъпка 2:


Документи
Качете вашия файл, както при другите модули. Можете също така да свържете вашите документи със записите.


Добавете колоната оригинално_име_на_файл съдържащ точното име на документа, който искате да импортирате във вашия файл за импортиране, или поставете редове, както в примера по-долу.
След това качете вашия файл за импортиране И всички документи, които искате да импортирате (няколко файла, както е показано по-долу, или zip).

В стъпка 2 можете да проверите името на вашите документи.

Резултат в базата данни след импортиране: