Как да създадете файл с манифест на проба за PCR с помощта на добавка за сортиране на епруветки? - LabCollector

Търсене в базата знания по ключова дума

Ти си тук:
← Всички теми
РЕЗЮМЕ:

На вашата PCR машина трябва да посочите картата на плаката, за да сте сигурни, че назовавате правилно къде се намират пробите. В зависимост от това, след провеждането на PCR, файлът с резултатите ще бъде генериран за всяка проба. За да опростите този процес, можете да генерирате примерен манифестен файл, който съдържа картата на плаките за PCR пробите, които трябва да бъдат изпълнени, като използвате нашата добавка за сортиране на епруветки.

Моля, следвайте стъпката по-долу, за да създадете примерния манифестен файл:

1. Качете примерен шаблонен файл

2. Генерирайте примерен манифестен файл

  • A. Използване на карта на кутия/плоча в Storage.
  • Б. Използване на получаване на проба

1. Качете примерен шаблонен файл

  • В добавката за сортиране на тръби трябва да отидете на „Настройка“ и след това на „Управление на шаблони“.
  • Тук можете да качите CSV или TXT файл за вашия шаблон. 

  • Съвети/подсказки
    Ще намерите шаблона за цикъла от вашата PCR машина. Ако е необходимо, можем да ви помогнем да коригирате шаблона според вашите изисквания.
  • Можете също да щракнете върху опцията „намиране на помощ“, за да видите опциите за генериране на примерен манифестен файл. Ще ви покаже изскачащ прозорец, който ще ви позволи да видите кои тагове можете да използвате във вашия примерен манифестен файл.
  • Този качен файл ще съдържа информация като примера в изображението по-долу. Колоната за позиция ще определи позицията на пробите в плаката. Останалите колони ще зависят от PCR протокола и изискванията на вашата МАШИНА.
    Можете да отворите файла в CSV, ако желаете, но трябва да ограничите CSV, ако искате да го видите във формата по-долу.
    *Моля, прочетете нашата база знания на как да разгранича CSV.

  • Когато имате дубликати, можете да копирате позицията на кладенеца. Както виждате в горното примерно изображение. 
  • Позицията в тези хеш тагове автоматично ще бъде взета от LabCollector система за съхранение. Тази част е обяснена в следващия раздел.
  • След като актуализирате шаблона и го качите в сортировач на епруветки, можете лесно да използвате този шаблон за всички проби, които извършвате във вашия PCR.
  • Можете да качите няколко шаблона и различни размери на PCR като 96 или 384, а също и да обедините плаките с помощта на сортировач на епруветки.

2. Генерирайте примерен манифестен файл

A. Използване на карта на кутия/плоча в Storage

  • In LabCollector съхранение можете да създадете кутии или плочи с мостри в определени позиции и можете да ги използвате, за да създадете мострени манифестни файлове. Можете да създавате плочи или кутии и да добавяте конкретни проби на съответните позиции. 
    *За да създадете вашите кутии или чинии, моля, прочетете базата знания на как да настроите LabCollector съхранение.
    *Моля, вижте нашата база от знания на как да генерирате кутии с модели.
  • Съвети/подсказки
    Можете да наименувате плочата според датата, за да ги държите разделени или да създадете фалшиво място в лабораторията, за да съхранявате всички плочи, за които ще направите тест, така че след това да можете да ги изтриете. 
    Кутиите, въпреки че в браузъра за съхранение могат да имат въображаеми кутии или плочи, само за създаване на примерни манифестни файлове. 
    Можете да създадете примерни манифестни файлове, като използвате и примерна добавка за получаване. Процесът за същото е обяснен по-долу в раздел 2, част Б.
  • След като създадете кутията/плаката за вашия PCR с проби в определени позиции, вие също блокирате ямките за контролните проби. По този начин никакви проби няма да бъдат съхранявани дори случайно на тези позиции.
  • предупреждение
    Когато създадете модел за плаката за PCR и искате да блокирате ямките, тогава това ще бъде възможно само с модела BOX и не моделът на плочата.
  • За да блокирате позицията, просто трябва да изберете клетките, като щракнете върху знака + и актуализирате полето, както са обяснени по-долу.
    Ако искате да премахнете блокираните позиции, можете също да щракнете върху 3Изчистване на всички блокирани позиции и актуализиране на модела.
  • За да създадете примерен файл с манифест с помощта на сортировач на тръби, отидете на добавката и на началната страница щракнете върху „Генериране на примерен файл с манифест“. 
  • Ще видите страницата по-долу, където трябва да намерите името на кутията/плочата, която сте създали преди; Можете дори да добавите няколко чинии заедно, като щракнете върху малкия знак +. След като сте избрали кутията/плочата 
  • След като щракнете върху Напред, ще видите информация за пробите в кутията или чинията;
    1. можете да изберете примерния манифестен файл, като използвате падащия списък (този, който сте качили в раздел 1 по-горе),
    2. Mix plates ви позволява да изберете няколко плочи и да смесите позицията на пробите в тях със сепаратор по ваш избор. Например, когато смесите, ще видите
      Plate_1 Позиция A1 с Plate_2 Позиция A1 или 
      Plate_1 Позиция A2 с Plate_2 Позиция A2 и т.н.
    3. Можете да имате междинен хедър, което означава, че ако изберете няколко плочи, без да ги смесвате, тогава плочите се повтарят в шаблона. Тези опции позволяват заглавките да присъстват между всяка плоча, за да ги отделят една от друга. Ако не изберете тази опция, заглавките за всяка плоча няма да се показват между шаблоните.
    4. и щракнете върху генериране на манифестен файл.
      *Празните места в чиниите ще изглеждат празни и ще имат коментар „Не е намерено“ под стелажа/тавата на колоната.
      Позицията на хаштага ще бъде запълнена с примерното име в примерния шаблон на манифеста.
  • Когато щракнете върху бутона за генериране на манифестен файл, ще видите изскачащ прозорец за запазване на файла в txt формат. Можете също да отворите txt или да промените името на вашия файл, като промените разширението от .txt на .csv, докато запазвате файла.
  • Това е файлът, който трябва да прехвърлите ръчно в PCR машината за изпълнение.

Б. Използване на получаване на проба

  • Можете да създавате кутии/плочи директно в добавката за получаване на проби.
  • При получаване на проба можете да конфигурирате настройките за вашия проект. Тук можете да изберете моделна кутия, в която да създавате ADMIN -> СЪХРАНЕНИЕ -> УПРАВЛЯВАЙТЕ СЪХРАНЕНИЕТО-> МОДЕЛИ.
    *Моля, прочетете нашата база от знания на как да конфигурирате получаване на проби.
  • Можете да създадете пакет, в който можете да създадете чиния.
    *Моля, прочетете нашата база знания на  как да създадете пакет и да го обработите.
    *Моля, прочетете нашата база знания на как да обработваме плаките при получаване на проби.
  • Можете да сканирате баркода на вашите проби, за да добавите проби в различната позиция на гнездото, която желаете.
    *Ако имате кутия, тогава докато правите модел, можете да блокирате позиции за контролните проби, ако винаги се поставят на едно и също място. Обяснено в раздел 2 по-горе.
  • Можете да запишете тази кутия във въображаема или фалшива стая и оборудване и да я използвате, за да създадете примерния файл на манифеста. Подобно на процеса, обяснен в раздел 3 A.
  • Примерният манифестен файл, който сте генерирали, трябва да бъде прехвърлен ръчно в машината.

Свързани теми: