Як почати роботу з модулем Sequences? - LabCollector

Пошук у базі знань за ключовими словами

Ти тут:
← Усі теми
РЕЗЮМЕ:

Ви можете перевірити нашу базу знань на як загалом виглядає модуль.

Щоб отримати доступ до модуля Sequences, виконайте такі дії:

1. Відкрийте модуль Послідовності

2. Відкрийте запис

1. Відкрийте модуль Послідовності

  • 1. Ця область покаже вам ім'я модуля, в пошук параметри та дозволяють додати a новий запис.
      - 1.1 Опція «Імпорт даних GenBank» допоможе вам додати послідовності безпосередньо з сайту GenBank. *Перевірте наш KB на як імпортувати дані в модуль плазміди, процес для послідовностей пояснюється в KB.
      - 1.2 Опція «Вибухнути нову послідовність» допоможе вам підірвати або Мегавибухнути послідовність.
    * Перевірте нашу базу знань як шукати в LabCollector.
  • 2,   параметри дозволяють експортувати всі результати пошуку у формат HTML, CSV, EXCEL, PDF. Ви також можете вибрати поле, яке потрібно експортувати.
        Прочитайте нашу базу знань про те, що є поля та облік.
        Команда опція дозволяє запам'ятати всі записи, які можна використовувати далі LabCollector.
  • 3. Спочатку записи зазвичай не відображаються. Вам потрібно натиснути на значок пошуку з порожнім полем пошуку, і ви зможете побачити всі записи.

2. Відкрийте запис

  • Коли ви клацнете певний запис, ви побачите наведені нижче параметри.

  • A. Тут з’явиться назва запису та деталі.
  • B. Тут відображатимуться параметри редагування запису. Прочитайте нашу базу знань параметри редагування записів.
  • C. Тут відображатимуться поля, пов’язані із записом. Прочитайте нашу базу знань про те, що є полів.
  • D. Ця вертикальна панель надасть вам параметри, пов’язані із записом.
          

    		 Цей значок відображатиме запис, як показано на зображенні вище.
    Ця опція відобразить усі пов’язані записи. Наприклад, якщо у вас є батьківський і дочірній зразки. Тоді всі дочірні зразки будуть показані тут. або якщо ви створили посилання для цього запису в інших модулях, тоді всі пов’язані записи будуть видимі тут.
    Цей параметр показує вам послідовність (5′-3′) і лінійну карту послідовності з усіма анотаціями в режимі перегляду FASTA, форматі GB і форматованому перегляді.
    Цей параметр допомагає керувати анотаціями послідовності. Наприклад, якщо це послідовність плазміди, ви можете додати анотації, наприклад деякі сайти рестрикції або промоторні області. Тут можна побачити початок/кінець і орієнтацію (назад/вперед) певної анотації. Це означає, що коли ви імпортуєте або створюєте плазміду, ви можете вибрати, які анотації ви хочете переглянути або видалити. Якщо ви імпортуєте цю послідовність у модуль плазміди, ви побачите ці анотації на карті плазміди.
    Ця опція пропонує вам інструменти NCBI Blast, за допомогою яких ви можете виконати BLAST LabCollector, зовнішні сайти
    Цей параметр дозволяє редагувати послідовність. Коли ви завантажуєте пов’язаний файл, ви можете редагувати бази послідовностей.

    Ви можете переглянути вкладку аналізу тут. Це може показати вам значення аналізу протягом днів або годин. Тут ви можете додати власні поля.
    *Прочитайте нашу базу знань як додати спеціальні поля на вкладку аналізу.
    Ви можете прив’язати запис до електронного лабораторного зошита (ELN є надбудовою в LabCollector). Ви можете пов’язати запис із певним експериментом, який було виконано з використанням елемента запису. Це допоможе вам отримати посилання на те, де було використано записаний елемент, і результати, отримані після цього.
    Цей значок підключає вас до надбудови Workflow (WF). LabCollector. Надбудова WF – це те, за допомогою якого ви можете створити блок-схему свого процесу, де кожен крок вимагає перевірки супервізора. Якщо запис використовується в надбудові WF, ви зможете побачити його статус у WF тут.
  • E. Тут ви можете шукати праймери в модулі праймерів, які гібридизуються (комплементарне спарювання ДНК/РНК) з певним нуклеотидом плазміди на 3'-кінці. Ви можете вибрати кількість нуклеотидів, які потрібно шукати для праймерів. Коли ви натиснете «Зробити», браузер відкриє модуль праймерів і покаже вам список додаткових праймерів.
  • F. Тут ви можете побачити всі посилання, які ви створили для запису. Ці посилання є на інші записи в інших модулях у LabCollector. Наприклад, якщо у вас є плазміда для певного бактеріального штаму. Потім ви можете підключити плазмідний запис із плазмідного модуля до бактеріального запису в штамах і клітинному модулі. Ви можете додати посилання з LabCollector клацнувши опцію «Додати посилання» та клацнувши опцію «Відкрити перегляд дерева», ви можете побачити посилання, пов’язані із записами. 

Схожі теми: