Процес генетичного тестування батьківства та спорідненості можна зробити ефективнішим за допомогою нашого додатка LSM , який забезпечує автоматизацію процесу підготовки та аналізу зразків/тестів, а також, надаючи зручний інтерфейс для аналізу результатів, LSM дає змогу проводити генетичне тестування на батьківство з підвищеною точністю, швидкістю та ефективністю.

Генетичний аналіз зразків можна проводити різними методами, включаючи ПЛР (полімеразна ланцюгова реакція), ПДРФ (поліморфізм довжини рестрикційних фрагментів) або секвенування наступного покоління (NGS). Вибір методу залежатиме від бажаного рівня точності та ресурсів, доступних у вашій лабораторії. Який би метод не вибрали, наша надбудова LSM допоможе вам, оскільки вона може плавно інтегрувати з будь-якою машиною/інструментом, який може мати ваша лабораторія.

У наведеній нижче базі знань ми крок за кроком допоможемо вам успішно провести тест на батьківство/спорідненість за допомогою LSM:

1. Створіть роботу в LSM
2. Вхідні записи пацієнтів
3. Використовуйте надбудову Parser для введення результатів аналізу
4. Завантажте звіт
5. Приклад

Крок 1: Створіть роботу в LSM

Першим кроком є ​​створення робочого місця в LSM. Для цього просто виконайте наведені нижче дії.

• відкритий LabCollector і перейдіть до надбудови LSM
• Натисніть на "роботау верхньому правому куті, а потім на «Додати роботу” у спадному меню, щоб створити нову роботу.
• Виберіть "Тест на батьківство/спорідненість“. Зверніть увагу, що ви завжди можете створити модель, призначену для будь-якого типу тестів. Для цього просто перейдіть до Адміністратор -> Налаштування -> Моделі (як показано на скріншоті нижче).

• Потім ви можете ввести назву моделі, її опис, тип зразка за замовчуванням і вибрати параметри зразка/завдання, які потрібно відобразити у формі зразка/завдання. Після завершення натисніть «представляти“, потім вирушайте до Адміністратор -> Налаштування -> Запити на роботу, І натисніть Увімкнути моделі (як показано нижче).

• Створені моделі з’являться безпосередньо всередині робота випадаюче меню.

• Після вибору відповідної роботи, яку ви хочете створити, просто заповніть усі необхідні дані, такі як номер роботи, дата роботи, її опис, ім’я особи, яка запитує, та будь-яку іншу необхідну інформацію.

Крок 2: Вхідні записи пацієнтів

• Після створення завдання наступним кроком є ​​введення відповідних записів пацієнтів (ви також можете виконати цей крок до створення завдання). По-перше, переконайтеся, що ви створюєте записи для кожного пацієнта у відповідних межах LabCollector модуль
• Наприклад, ви можете відкрити модуль пацієнта і перейдіть до створення нового запису, натиснувши на кнопку розташований у верхньому правому куті.

• Потім введіть усі необхідні дані для кожного пацієнта, залученого до тесту на батьківство/спорідненість, включаючи таку інформацію, як ім’я, дата народження, стать та будь-які інші відповідні дані.
• Поверніться до LSM і зв’яжіть записи пацієнтів, які ви щойно створили, із завданням, яке ви попередньо додали на кроці 1, вибравши їх у списку записів випадків (як показано на знімку екрана нижче).

• Попередньо виберіть додаткові дані, такі як тип «передбачуваних» стосунків між пацієнтами («батько», «дідусь», «тітка», …), їх етнічна приналежність, тип вибірки тощо.

Крок 3: Використовуйте надбудову Parser для введення результатів аналізу

• Після того, як ви введете записи пацієнтів, наступним кроком буде використання надбудови аналізатора для введення результатів аналізу. Додатковий модуль аналізатора дозволяє вводити файли Excel або CSV, створені машиною, яка виконувала аналіз. Щоб скористатися доповненням, виконайте такі дії:
• Відкрийте надбудову аналізатора LabCollector
• Виберіть відповідну папку, а потім імпортуйте файл Excel або CSV, що містить результати аналізу.

• Тоді I-Collector автоматично введе значення параметрів у відповідні поля, ТП (тестована особа), R1 (пов'язаний 1) та R2 (пов’язаний 2).

• I-Collector також перевірить процес роботи та створить звіт, який потім можна завантажити у форматі PDF.

Крок 4: Завантажте звіт

Останнім кроком є ​​завантаження звіту, який міститиме відсоток зв’язку та всі інші відповідні результати. Щоб завантажити звіт, виконайте такі дії:

• Натисніть на значок шестірні поруч із завданням, для якого ви хочете завантажити звіт.
• Натисніть на "доповідь"Табл.
• Виберіть тип звіту, який потрібно завантажити.
• Завантажте та перегляньте звіт.

приклад:

Щоб краще проілюструвати, як проводити тестування батьківства/спорідненості за допомогою LSM, розглянемо приклад:

Припустімо, що Джон і Мері ймовірні батьки Джека, і лабораторія отримала зразки ДНК від кожного з них. Користувач повинен створити записи для Джона, Мері та Джека LabCollector, включаючи їх ім’я, дату народження, стать та будь-яку іншу відповідну інформацію. Користувач також повинен прив’язати записи до LSM і попередньо вибрати тип передбачуваного зв’язку, у даному випадку батько та мати.

Наступним кроком є ​​аналіз зразків ДНК за допомогою генетичного аналізатора та створення файлу Excel/CSV із результатами. Після цього користувач має завантажити файл до аналізатора, і дані автоматично додадуться до відповідних вкладок/кейсів завдяки I-collector.

Припустимо, що лабораторія проаналізувала 15 локусів і виявила такі алелі:

Система автоматично розрахує ймовірність спорідненості між Джеком та Джоном/Мері та сформує відповідний звіт.

Після цього користувач може завантажити звіт, який показує відсоток спорідненості між Джеком та Джоном/Мері, а також іншу відповідну інформацію, таку як проаналізовані локуси, знайдені алелі та статистичні параметри, використані в розрахунках (наприклад, частоти алелів, Харді- рівновагу Вайнберга тощо). Звіт також може містити будь-які додаткові примітки або коментарі, додані користувачем.