Jak začít s modulem Plasmids? - LabCollector

Prohledávejte znalostní bázi podle klíčového slova

Jsi tady:
← Všechna témata
SHRNUTÍ:

Uvnitř LabCollector existují 13 ve výchozím nastavení moduly, mezi nimiž můžete najít Plazmidy modul.

Můžete zkontrolovat naši znalostní databázi na jak modul obecně vypadá.

Pro přístup k modulu Plasmid prosím postupujte takto:

1. Otevřete modul Plasmids

2. Otevřete záznam

1. Otevřete modul Plasmids

  • 1. Tato oblast vám ukáže název modulu, hledat možnosti a umožňují vám provádět více akcí, například: přidání a nový rekord.
     * Zkontrolujte naši znalostní základnu jak hledat v LabCollector.
    - 1.1 Můžete vytvořit nový záznam plazmidu.
    - 1.2 "Importujte data GenBankTato možnost vám pomůže přidat plazmidy přímo ze stránky GenBank. *Zkontrolujte naši KB na jak importovat data do plazmidového modulu.
    - 1.3 "Editor plazmových map“ Tato možnost vám pomůže upravit nebo vytvořit plazmid od začátku.

.............- 1.4 "Nová sekvence” tato možnost vám umožňuje vystřelit plazmid nebo sekvenci. Po kliknutí na tlačítko se objeví nová karta, která vás požádá o zadání sekvence, kterou chcete odpálit (jak je znázorněno na obrázku níže).

  • 2. -   umožňuje exportovat všechny výsledky vyhledávání ve formátu HTML, CSV, EXCEL, PDF. Můžete také vybrat pole, které chcete exportovat.
      *Přečtěte si naši znalostní databázi o tom, co jsou pole a evidence.
    - možnost vám umožní zapamatovat si všechny záznamy, které lze dále použít LabCollector.

.............- Tato možnost vám umožňuje hromadně aktualizovat všechny uložené záznamy, jakmile na ni kliknete, budete muset vybrat pole, která chcete aktualizovat, a zadat změny.

  • 3.  Záznamy se obvykle zpočátku nezobrazí. Pokud jste neaktivovali Počáteční vyhledávání možnost pod Správce -> Nastavení -> Vyhledávání modulu a možnosti formuláře. Pokud ne, budete muset kliknout na ikonu vyhledávání s prázdným vyhledávacím polem, aby se zobrazily všechny záznamy.

2. Otevřete záznam

  • Když kliknete na konkrétní záznam, zobrazí se níže uvedené možnosti.

 

  • A. Zde se zobrazí název záznamu a podrobnosti.
  • B. Zde se zobrazí možnosti úpravy záznamu. Přečtěte si naši znalostní databázi možnosti editace záznamů.
  • C. Zde se zobrazí pole související se záznamem. Přečtěte si naši znalostní databázi o tom, co jsou pole.
  • D. Tento svislý pruh vám poskytne možnosti související se záznamem.

 

Tato ikona zobrazí záznam, jak je vidět na obrázku výše.
Tato volba zobrazí všechny související záznamy. Například pokud máte nadřazené a podřízené vzorky. Poté se zde zobrazí všechny dětské vzorky. nebo pokud jste vytvořili odkaz na tento záznam v jiných modulech, pak zde budou viditelné všechny související záznamy.
Tato možnost vám pomůže spravovat sekvenční anotace. To znamená, že když importujete nebo vytvoříte plazmid, můžete si vybrat, které anotace chcete zobrazit nebo odstranit. Chcete-li například odstranit některé omezující stránky, které nechcete, nebo některý region promotérů. Zde můžete sledovat začátek/konec a orientaci (zpět/vpřed) konkrétní anotace
Tato možnost vám ukáže sekvenci (5′-3′) a mapu plazmidu se všemi anotacemi.
Tato možnost umožňuje odvodit záznam jeho přidáním do jiného modulu a výběrem odpovídajících polí.
Tato možnost vám umožňuje přidat jakoukoli aktivitu prováděnou na záznamu. pomáhá sledovat změny provedené v záznamu a může pomoci při dodržování předpisů.
Tato možnost vám pomůže sledovat, kde je uložena položka záznamu. Nebo můžete vytvořit úložiště pro záznam. Přečtěte si naši znalostní databázi, jak na to upravit úložiště.
Tato ikona zobrazuje informace o činidle a objednávce související se záznamem. Záznam můžete přiřadit k novému nebo již existujícímu činidlu.
Ukázku můžete propojit s elektronickým laboratorním zápisníkem (ELN je doplněk LabCollector). Záznam můžete propojit s konkrétním experimentem, který byl proveden pomocí položky záznamu. To vám pomůže získat odkaz na místo, kde byla položka záznamu použita, a na výsledky získané poté.
Tato ikona vás připojí k doplňku Workflow (WF). LabCollector. Doplněk WF je ten, kde můžete vytvořit vývojový diagram vašeho procesu, kde každý krok vyžaduje ověření správcem. Pokud je záznam používán v doplňku WF, budete zde moci vidět jeho stav ve WF.

 

  • E. Tato možnost vám pomůže zobrazit mapu plazmidu.
  • F. Tato volba vám pomůže zobrazit nebo vytvořit místo uložení položky ve zmíněném záznamu. Přečtěte si naši znalostní databázi, jak na to upravit úložiště.
  • G. Zde můžete hledat primery v modulu Primers, které hybridizují (komplementární párování DNA/RNA) s určitým nukleotidem plazmidu na 3' konci. Můžete si vybrat počet nukleotidů, které chcete hledat pro primery. Když kliknete na „Do“, prohlížeč otevře modul primerů a zobrazí seznam doplňkových primerů.
  • H. Zde můžete vidět všechny odkazy, které jste pro záznam vytvořili. Tyto odkazy jsou na další záznamy v jiných modulech v LabCollector. Můžete přidat odkaz z LabCollector kliknutím na možnost „Přidat odkaz“ a kliknutím na možnost „Otevřít stromový náhled“ uvidíte odkazy spojené se záznamy. Například jako níže.

Související témata: