خلاصه:

در دستگاه PCR خود، باید نقشه پلیت را مشخص کنید تا مطمئن شوید که نمونه ها را به درستی نام می برید. بسته به این، پس از اجرای PCR، فایل نتیجه برای هر نمونه تولید می شود. برای ساده‌سازی این فرآیند، می‌توانید با استفاده از افزونه Tube Sorter ما، یک فایل مانیفست نمونه تولید کنید که دارای نقشه صفحه برای نمونه‌های PCR باشد.

لطفاً مرحله زیر را دنبال کنید تا نمونه فایل مانیفست را بسازید:

1. نمونه فایل قالب را آپلود کنید

2. نمونه فایل مانیفست را ایجاد کنید

• الف. استفاده از نقشه جعبه/صفحه در Storage.
• ب. استفاده از دریافت نمونه

1. نمونه فایل قالب را آپلود کنید

• در افزونه Tube Sorter باید به «Setup» و سپس «Manage Templates» بروید.
• در اینجا می توانید فایل CSV یا TXT را برای قالب خود آپلود کنید. 
  

• نکات / نکات

  شما الگوی اجرا را از دستگاه PCR خود خواهید یافت. در صورت نیاز می توانیم به شما در تنظیم الگو بر اساس نیازهای خود کمک کنیم.
• همچنین می‌توانید روی گزینه «یافتن کمک» کلیک کنید تا گزینه‌های تولید نمونه فایل مانیفست را ببینید. یک پاپ آپ به شما نشان می دهد که به شما امکان می دهد ببینید از چه برچسب هایی می توانید در فایل مانیفست نمونه خود استفاده کنید.
  
• این فایل آپلود شده حاوی اطلاعاتی مانند مثال در تصویر زیر خواهد بود. ستون موقعیت موقعیت نمونه ها را در صفحه مشخص می کند. بقیه ستون ها به پروتکل PCR و الزامات MACHINE شما بستگی دارد.
  در صورت تمایل می‌توانید فایل را در CSV باز کنید، اما اگر می‌خواهید آن را در قالب زیر ببینید باید CSV را محدود کنید.
  *لطفاً پایگاه دانش ما را بخوانید نحوه جداسازی CSV
  

• وقتی موارد تکراری دارید می توانید موقعیت چاه را تکرار کنید. همانطور که در تصویر مثال بالا مشاهده می کنید. 
• موقعیت در این تگ های هش به طور خودکار از آن گرفته می شود LabCollector سیستم ذخیره سازی. این قسمت در قسمت بعدی توضیح داده شده است.
• هنگامی که قالب را به روز کردید و آن را در مرتب کننده لوله آپلود کردید، می توانید به راحتی از این الگو برای تمام نمونه هایی که در PCR خود انجام می دهید استفاده کنید.
• شما می توانید چندین الگو و اندازه های مختلف PCR مانند 96 یا 384 را آپلود کنید و همچنین صفحات را با استفاده از مرتب کننده لوله ادغام کنید.

2. نمونه فایل مانیفست را ایجاد کنید

الف. استفاده از نقشه جعبه/صفحه در Storage

• In LabCollector فضای ذخیره سازی می توانید جعبه ها یا صفحاتی را با نمونه هایی در موقعیت های خاص ایجاد کنید و می توانید از آنها برای ایجاد نمونه فایل های مانیفست خود استفاده کنید. می توانید بشقاب ها یا جعبه هایی ایجاد کنید و نمونه های خاصی را در موقعیت های مربوطه اضافه کنید. 
  *به منظور ایجاد جعبه یا بشقاب های خود لطفاً پایگاه دانش را بخوانید چگونه تنظیم شود LabCollector ذخیره سازی.
  *لطفاً به پایگاه دانش ما مراجعه کنید نحوه تولید جعبه های مدل
  
• نکات / نکات

  می‌توانید صفحه را بر اساس تاریخ نامگذاری کنید، تا آنها را جدا نگه دارید یا یک مکان جعلی در آزمایشگاه ایجاد کنید تا همه صفحاتی را که قرار است اجرا کنید، ذخیره کنید تا بعد از آن بتوانید آنها را حذف کنید. 
  این جعبه ها حتی در مرورگر ذخیره سازی می توانند جعبه ها یا صفحات خیالی داشته باشند، فقط برای ایجاد نمونه فایل های مانیفست. 
  همچنین می‌توانید فایل‌های مانیفست نمونه را با استفاده از افزونه دریافت نمونه ایجاد کنید. فرآیند مشابه در زیر در بخش 2 قسمت B توضیح داده شده است.
  
• هنگامی که جعبه/صفحه PCR خود را با نمونه هایی در موقعیت های خاص ایجاد کردید، چاه های نمونه های کنترل را نیز مسدود می کنید. به این ترتیب هیچ نمونه ای حتی به طور تصادفی در آن موقعیت ها ذخیره نمی شود.
• هشدار

  زمانی که شما یک مدل برای پلیت برای PCR ایجاد می کنید و می خواهید چاه ها را مسدود کنید، این کار فقط با مدل BOX امکان پذیر خواهد بود و نه مدل بشقاب
  
• برای مسدود کردن موقعیت فقط باید سلول ها را با کلیک بر روی علامت + انتخاب کنید و کادر را مانند مراحل توضیح داده شده در زیر به روز کنید.
  اگر می خواهید موقعیت های مسدود شده را حذف کنید، می توانید روی 3Clear all blocked positions and update model نیز کلیک کنید.
  
• برای ایجاد یک فایل مانیفست نمونه با استفاده از مرتب‌کننده لوله، به افزونه بروید و در صفحه اصلی روی «ایجاد فایل مانیفست نمونه» کلیک کنید. 
  
• صفحه زیر را مشاهده خواهید کرد، جایی که باید نام جعبه/پلیتی را که قبلا ایجاد کرده اید پیدا کنید. حتی می توانید با کلیک بر روی علامت + کوچک، چندین صفحه را با هم اضافه کنید. پس از انتخاب جعبه / صفحه 
  
• پس از کلیک بر روی Next، اطلاعات مربوط به نمونه ها را در داخل جعبه یا صفحه مشاهده خواهید کرد.
  1. می توانید نمونه فایل مانیفست را با استفاده از لیست کشویی (کسی که در بخش 1 در بالا آپلود کردید) انتخاب کنید.
  2. میکس پلیت ها به شما این امکان را می دهد که چندین صفحه را انتخاب کنید و موقعیت نمونه ها را در آنها با جداکننده دلخواه مخلوط کنید. مثلا وقتی میکس کنید میبینید
     Plate_1 Position A1 with Plate_2 Position A1 or 
     Plate_1 Position A2 با Plate_2 Position A2 و غیره.
  3. شما می توانید یک هدر میانی داشته باشید، به این معنی که اگر چندین صفحه را بدون مخلوط کردن آنها انتخاب کنید، سپس صفحات در قالب تکرار می شوند. این گزینه به هدرها اجازه می دهد تا بین هر صفحه وجود داشته باشد تا آنها را از یکدیگر جدا کند. اگر این گزینه را انتخاب نکنید، سرصفحه های هر صفحه در بین قالب ها ظاهر نمی شوند.
  4. و روی ایجاد فایل مانیفست کلیک کنید.
     *مکان های خالی صفحات خالی به نظر می رسند و در زیر قفسه/سینی ستون، نظر "یافت نشد".
     موقعیت هشتگ با نام نمونه در الگوی مانیفست نمونه پر می شود.
     
• هنگامی که بر روی دکمه ایجاد فایل مانیفست کلیک می کنید، یک پاپ آپ برای ذخیره فایل در فرمت txt مشاهده خواهید کرد. همچنین می‌توانید با تغییر پسوند از txt به .csv هنگام ذخیره فایل، txt را باز کنید یا نام فایل خود را تغییر دهید.
• این فایلی است که باید برای اجرا به صورت دستی به دستگاه PCR منتقل کنید.

ب. استفاده از دریافت نمونه

• می‌توانید جعبه‌ها/صفحه‌ها را مستقیماً در داخل افزونه دریافت نمونه ایجاد کنید.
• در دریافت نمونه می توانید تنظیمات پروژه خود را پیکربندی کنید. در اینجا می توانید جعبه مدلی را که در آن ایجاد می کنید انتخاب کنید مدیر -> ذخیره سازی -> مدیریت ذخیره سازی-> مدل ها.
  *لطفاً پایگاه دانش ما را بخوانید نحوه پیکربندی دریافت نمونه
• شما می توانید بسته ای ایجاد کنید که در آن می توانید یک بشقاب ایجاد کنید.
  *لطفاً پایگاه دانش ما را بخوانید  نحوه ایجاد بسته و پردازش آن
  *لطفاً پایگاه دانش ما را بخوانید نحوه پردازش صفحات در دریافت نمونه
• می‌توانید بارکد نمونه‌های خود را اسکن کنید تا نمونه‌ها را در موقعیت چاه متفاوتی که می‌خواهید اضافه کنید.
  *اگر جعبه دارید، در حین ساخت مدل، می توانید موقعیت های نمونه های کنترل را مسدود کنید، اگر آنها همیشه در یک مکان قرار گیرند. در بخش 2 در بالا توضیح داده شده است.
• شما می توانید این جعبه را در یک اتاق و تجهیزات خیالی یا جعلی ذخیره کنید و از آن برای ایجاد فایل نمونه مانیفست استفاده کنید. مانند فرآیند توضیح داده شده در بخش 3 A.
• فایل مانیفست نمونه ای که ایجاد کرده اید باید به صورت دستی به دستگاه منتقل شود.

مطالب مرتبط:

• لطفاً KB ما را بررسی کنید نحوه ایجاد و پردازش بسته ها در افزونه دریافت نمونه.
• خوانده شده در بیشتر نحوه ذخیره خودکار نمونه ها از دریافت نمونه در یک ماژول.
• KB ما را در نحوه پردازش صفحات
• خوانده شده در بیشتر نحوه اتصال و ارسال نمونه از «دریافت نمونه» برای انجام آزمایشات در «LSM».