如何使用化学编辑器？ - LabCollector

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概要：

分子编辑器存在于化学模块和 ELN.

化学编辑器可用于创建化学结构并将其保存为记录。它还为您提供了编辑化学模块中已存在的化学分子结构的可能性。

在 ELN （电子实验室笔记本）附加组件，可用于制作2D化学结构，可轻松插入 ELN 'content' 或者它也可以保存为化学模板 ELN.

要使用化学分子编辑器，请按照以下步骤操作：

1.化学编辑

1.1.化学模块

1.2. ELN

2.化学编辑器中的工具

1.化学编辑

  • 如简介中所述，化学编辑器可以在化学模块和化学模块中找到。 ELN 添加在。

  • 1.1.化学模块

    • 有两种方法可以在化学模块中使用化学编辑器。
      • 第一种方法是去 化学模块 -> 新纪录 -> 分子数据 -> 结构 -> 画出分子。
        – 化学编辑器将打开下面的页面，该页面在第 2 节中有详细描述。

      • 第二种方法是去 化学模块 -> 编辑记录 （已经存在） -> 分子数据 -> 画出分子。
        – 化学编辑器将打开下面的页面，该页面在第 2 节中有详细描述。

  • 1.2. ELN

    • 要检查每个模块的默认字段，请转到 首页 -> 书籍/实验或页面（您选择的） -> 内容 -> 编辑.

    • 单击“添加分子和反应”图标后，它将打开一个页面，其中包含以下选项。

    • 您需要单击“新建”选项来打开如下所述的化学编辑器。

2. 化学编辑器中的工具

  • 选项 A：中心画布

    • 这是画布，您将在其中看到您正在创建的分子。

  • 选项B： 顶部工具栏

  • 这里的各种选项是：
    • 用于回溯操作的撤消和重做选项。
    • 将您的分子带到/调整画布的中心。 
    • 切换 R/S 标签。 （S和R用于命名手性化合物的对映体。它是指分子的左旋性-S或右旋性-R。）
      – 例如，想象一个带有手性中心的碳原子，连接着 4 个原子。
      – 连接到手性原子 C 的每个原子都具有优先级，其中 1 最高，4 最低。
      – 根据原子序数给出优先级，原子序数越高优先级越高。

    • 此选项用于清除画布上的所有内容。
    • 此选项为分子创建 Mol 和 Smiles 格式。您可以复制并保存以供将来使用。

      – 进口 按钮允许您粘贴分子的 MOL、SMILES 或 InChI 文件。 
      – 出口 按钮允许您复制生成的分子的 MOL 或 SMILES 格式。
      – InChI（国际化学标识符）； SMILES（简化分子输入行输入规范是分子的线性表示法）； MOL（MDL Molfile 保存有关分子的原子、键、连接性和坐标的信息。）例如，下图显示了苯分子以及可以表示它的不同格式。

    • 此选项告诉您有关软件及其版本的信息。
    • 此 2D 描述/清理选项允许您更改分子的方向。

    • 此化学词典搜索选项可帮助您导入分子结构。 
      – 您还可以编辑已导入的结构。

  • 选项C：右 工具栏

  • 这里的不同选项是：
    • 矩形和套索选择。这些是不同类型的选择工具。
      – 矩形选择： 使用矩形选择区域选择原子和键
      – 套索选择： 通过徒手绘制选择区域来选择原子和键
    • 您可以使用删除选择 ， 键或使用橡皮擦工具 .
    •  此电荷选项允许增加 (+) 或减少 (-) 原子的电荷。
    • 它允许您将同位素添加到分子结构中。
    • 这些片段可以让您预先准备好苯的结构 , 环戊烷 , 环丙烷 , 环丁烷 , 环己烷 , 环庚烷 .
    • 这允许创建碳原子链。

  • 选项 D：左 工具栏

    • 此工具栏还允许您从多个元素中进行选择，您可以使用这些元素来创建新元素或修改现有元素。
    • 存在的原子有氢、硫、磷、氟、氧、氮和碳。
    • 您可以在此处添加自定义元素。未定义的元素，以及氢原子、重原子数 (D) 或环原子数 (R)。
      – 重原子例如：C、N、O、S、F、Cl、Br 等。
      – 环原子是构成环一部分的原子。
    • 工具栏提供不同类型的单键、双键、三键、上键。

  • 选项 E：添加

    • 创建完化合物后，您可以添加它并将其包含在您的反应中，然后将其插入到您的内容中 ELN 书籍、实验或化学。
    • 您还可以将其另存为模板，如下面的视频所示。
      * 访问化学模板 ELN 你可以去 ADMIN -> 模板 -> 查看/编辑反应模板。
      * 请记住，您可以根据超级管理员或管理员授予您的权限查看和编辑反应模板。请查看我们的知识库以了解更多信息 ELN 权限。
       

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