如何开始使用序列模块? - LabCollector

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概要:

您可以查看我们的知识库 模块通常是什么样子的。

请按照以下步骤访问序列模块:

1. 打开序列模块

2.打开记录

1. 打开序列模块

  • 1。该区域将向您展示 姓名 该模块的 搜索、 选项,并允许您添加 新纪录.
      1.1 “导入 GenBank 数据”选项可帮助您直接从 GenBank 站点添加序列。 *检查我们的知识库 如何在质粒模块中导入数据,序列的过程在知识库中进行了解释。
      – 1.2 “爆炸新序列”选项可帮助您爆炸或巨型爆炸序列。
    * 检查我们的知识库 如何搜索 LabCollector.
  • 2。 该   选项允许您以 HTML、CSV、EXCEL、PDF 格式导出所有搜索结果。您还可以选择要导出的字段。
        阅读我们的知识库了解哪些内容 领域记录.
        选项允许您记住所有可以进一步使用的记录 LabCollector.
  • 3。这些记录一开始通常不会显示。您需要单击带有空搜索字段的搜索图标,您将能够看到所有记录。

2.打开记录

  • 当您单击特定记录时,您将看到以下选项。

  • A。记录名称和详细信息将显示在此处。
  • B。此处将显示编辑记录的选项。 阅读我们的知识库 记录编辑选项.
  • C。此处将显示与记录相关的字段。 阅读我们的知识库了解哪些内容 领域。
  • D。该竖条将为您提供与记录相关的选项。
          

    该图标将显示记录,如上图所示。
    该选项将显示所有相关记录。例如,如果您有父样本和子样本。然后所有子样本将显示在这里。或者,如果您在其他模块中为此记录创建了链接,则所有相关记录都将在此处可见。
    此选项显示序列 (5′-3′) 和序列的线性图,以及 FASTA 视图、GB 格式和格式化视图中的所有注释。
    此选项可帮助您管理序列注释。例如,如果它是质粒序列,那么您可以添加注释,例如一些限制性位点或启动子区域。您可以在此处观察特定注释的开始/结束和方向(反向/正向)。这意味着当您导入或创建质粒时,您可以选择要查看或删除的注释。如果您将此序列导入质粒模块,您将在质粒图谱中看到这些注释。
    此选项为您提供 NCBI Blast 工具,您可以在其中执行 BLAST LabCollector, 外部网站
    此选项允许您编辑序列。当您上传关联文件时,您可以编辑序列碱基。

    您可以在此处查看分析选项卡。这可以向您显示数天或数小时内的分析值。您可以在此处添加您选择的自定义字段。
    *阅读我们的知识库 如何在分析选项卡中添加自定义字段。

    您可以将记录链接到电子实验室笔记本(ELN 是一个附加组件 LabCollector)。您可以将记录链接到已使用记录项执行的特定实验。这可以帮助您链接到记录项的使用位置以及此后获得的结果。
    此图标将您连接到工作流程 (WF) 插件 LabCollector。 WF 插件是您可以制作流程流程图的插件,其中每个步骤都需要主管验证。如果该记录正在 WF 插件中使用,那么您将能够在此处查看其在 WF 中的状态。
  • E. 在这里,您可以在引物模块中搜索与质粒 3' 端的特定核苷酸杂交(DNA/RNA 互补配对)的引物。您可以选择要搜索引物的核苷酸数量。当您单击“Do”时,浏览器将打开引物模块并显示互补引物列表。
  • F. 在这里您可以看到您为记录创建的所有链接。这些链接指向其他模块中的其他记录 LabCollector。例如,如果您有特定菌株的质粒。然后,您可以将质粒模块中的质粒记录连接到菌株和细胞模块中的细菌记录。您可以添加一个链接 LabCollector 通过单击“添加链接”选项并单击“打开树视图”选项,您可以看到连接到记录的链接。 

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