如何使用 LSM 进行亲子/亲属关系基因测试? - LabCollector

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使用我们的 LSM-Add on 可以使亲子鉴定和关系基因检测过程更加高效 ,确保样品/测试准备和分析过程的自动化,并通过提供用户友好的结果分析界面,LSM 使得以更高的准确性、速度和效率进行亲子遗传测试成为可能。

可以使用多种方法对样本进行遗传分析,包括 PCR(聚合酶链式反应)、RFLP(限制性片段长度多态性)或下一代测序 (NGS)。方法的选择将取决于所需的准确度水平以及您实验室内可用的资源,无论您选择哪种方法,我们的 LSM 插件都能满足您的需求,因为它可以 无缝集成 使用您的实验室可能拥有的任何机器/仪器。

在以下知识库中,我们将指导您逐步完成如何使用 LSM 成功执行亲子鉴定/亲属关系测试:

  1. 在 LSM 中创建作业
  2. 输入患者记录
  3. 使用解析器插件输入分析结果
  4. 下载报告
  5. 例如:
备注

在 AgileBio,我们了解亲子/亲属关系基因检测可能很复杂。这就是为什么我们开发了 独特的包装 专为这些类型的测试而设计,使用特殊的插件和参数来确保准确性和可靠性。

为了使整个过程尽可能无压力,我们为每一步提供个性化的支持和指导。我们的专家团队随时解答您的任何问题。如果您有兴趣了解有关我们的亲子/亲属关系测试套餐的更多信息,请随时通过以下方式与我们联系: [电子邮件保护].

步骤1: 在 LSM 中创建作业

 

第一步是在 LSM 中创建一个作业。为此,只需执行以下步骤:

  • 可选 LabCollector 并转到 LSM 附加组件
  • 点击 ”工作”位于右上角,然后在“添加工作” 在下拉菜单中以创建新作业。
  • 选择“亲子鉴定/亲属关系测试”。请注意,您始终可以创建专用于您想要的任何类型测试的模型。为此,只需导航至 管理 -> 首选项 -> 模型 (如下图所示)。

  • 然后,您可以输入模型的名称、其描述、默认样品类型,并选择要在样品/作业表单中显示的样品/作业参数。完成后,点击“提交“,然后前往 管理 -> 设置 -> 职位请求,然后点击 启用模型 (如下所示)。

  • 创建的模型将直接出现在 工作 下拉式菜单。

  • 选择要创建的相应职位后,只需填写所有必要的详细信息,例如职位编号、职位日期、职位描述、请求者姓名以及任何其他必要信息。

 

步骤2: 输入患者记录

 

  • 创建作业后,下一步是输入相应的患者记录(您也可以在创建作业之前执行此步骤)。首先,确保在适当的时间内为每位患者创建记录 LabCollector 模块。
  • 例如,您可以打开 病人模块 并通过单击按钮继续创建新记录 位于右上角。

  • 然后,输入参与亲子鉴定/关系测试的每位患者的所有必要详细信息,包括姓名、出生日期、性别和任何其他相关数据等信息。
  • 返回 LSM 并将您刚刚创建的患者记录链接到您之前在步骤 1 中添加的作业,方法是在病例记录列表中选择它们(如下面的屏幕截图所示)。

备注
确保通过导航至启用案例记录选项 管理->设置->案例记录.

 

  • 预先选择其他数据,例如患者之间“据称”关系的类型(“父亲”、“祖父”、“阿姨”……)、种族、样本类型等。

 

步骤3: 使用解析器插件输入分析结果

 

  • 输入患者记录后,下一步是使用解析器插件输入分析结果。解析器插件允许您输入执行分析的机器生成的 Excel 或 CSV 文件。要使用该附加组件,请按照下列步骤操作:
  • 打开解析器插件 LabCollector
  • 选择适当的文件夹,然后导入包含分析结果的 Excel 或 CSV 文件。

  • 然后,I-Collector 会自动将参数值输入到相应的框中, TP(测试者), R1(相关1)R2(相关2)。

  • I-Collector 还将验证作业流程并生成报告,然后您可以下载 PDF 格式的报告。

 

步骤4: 下载报告

 

最后一步是下载报告,其中包括关系百分比和所有其他相关结果。要下载报告,请按照下列步骤操作:

  • 单击要下载其报告的作业旁边的齿轮图标。
  • 点击“报告进展“ 标签。
  • 选择您要下载的报告类型。
  • 下载并查看报告。

示例:

为了更好地说明如何使用 LSM 执行亲子/关系测试,让我们考虑一个示例:

假设约翰和玛丽是杰克的所谓父母,并且实验室已从他们每个人身上获取了 DNA 样本。用户应该为 John、Mary 和 Jack 创建记录 LabCollector,包括他们的姓名、出生日期、性别和任何其他相关信息。用户还应该将记录链接到 LSM 并预先选择假定关系的类型,在本例中为父亲和母亲。

下一步是使用遗传分析仪分析 DNA 样本,并生成包含结果的 Excel/CSV 文件。然后,用户应该将文件上传到解析器,并且借助 I-collector,数据将自动注入到相应的选项卡/案例中。

假设实验室分析了 15 个基因座并发现了以下等位基因:

轨迹 John 玛丽 插口
D3S1358 16,18 16,18 16,20
TH01 8,9 9,9 9,9
D21S11 28,30 28,30 28,29
D18S51 14,15 14,15 15,16
D5S818 11,13 11,13 11,12
D13S317 10,13 11,13 12,13
D7S820 10,11 10,11 10,11
D16S539 10,12 11,12 12,13
脑脊液1PO 11,12 10,12 10,12
五角E 14,16 14,16 14,15
潘达D 12,13 12,13 12,13
D8S1179 11,12 11,12 11,14
TPOX 8,12 8,12 8,10
虚拟WA 15,18 17,18 16,18
FGA 21,23 21,23 22,23

 

系统会自动计算Jack和John/Mary之间的关系概率并生成相应的报告。

然后,用户可以下载显示杰克和约翰/玛丽之间关系百分比的报告,以及其他相关信息,例如分析的基因座、发现的等位基因以及计算中使用的统计参数(例如等位基因频率、Hardy-温伯格平衡等)。该报告还可以包括用户添加的任何附加注释或评论。

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