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如何开始 LABCOLLECTOR
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安装
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- Apache 服务器/Web 服务器无法在 Windows 10 上运行
- 手动清理apache日志以提高速度。
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- 升级到Java 7U51+后如何使Java小程序再次工作?
- 如何恢复被覆盖的文档
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- My LabCollector 或附加组件非常慢。为什么以及如何解决它?
- “字段列表”中的未知列“auto_name_mode”:当我想要调整现有记录、创建新记录或导入数据时,会发生错误。我能做些什么?
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一般
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- 我可以用吗 LabCollector 在一台计算机上?我可以将其安装在网络服务器上吗?
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- 我需要购买所有模块吗?我可以只使用引物模块吗?
- 图标含义 (EN/FR) V.6.0
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- 我如何搜索 LabCollector?
- 我可以查看/列出模块中的所有记录吗?
- 如何打印记录?
- 如何向 LabColletor v6.0 添加面板?
- 如何创建带有存储的管子并标记其用途? (v6.0)
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- 如何开始使用 LSM?
- LSM 使用指南 – 从工作请求到结果报告
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- 在您的网站中插入 LSMremote 应用程序
- 如何使用 LSM 进行亲子/亲属关系基因测试?
- HL7简介以及如何在LSM中使用它
- LSM 工作列表图标 - 它们是什么意思?
- LSM:如何按专业对测试结果进行分组?
- LSM 中的批次样品链接用于质量控制
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- LSMRemote (v6.0) 注册、登录和其他选项
- LSMRemote 安装步骤&集成到网站中? (v4.0)
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- 如何配置新字段、在 LSMRemote 中提交作业并在 LSM 中查看它?
- 如何在LSMRemote中搜索?
- 如何使用 LSMRemote 创建用于患者/客户访问报告的令牌?
- 如何生成带有集成标签的CoC Manifest?
- 如何在 LSMRemote 中打印和跟踪多个报告/CoC?
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- 如何在 LSMRemote 中集成约会安排?
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录制的演示文稿
使用我们的 LSM-Add on 可以使亲子鉴定和关系基因检测过程更加高效 ,确保样品/测试准备和分析过程的自动化,并通过提供用户友好的结果分析界面,LSM 使得以更高的准确性、速度和效率进行亲子遗传测试成为可能。
可以使用多种方法对样本进行遗传分析,包括 PCR(聚合酶链式反应)、RFLP(限制性片段长度多态性)或下一代测序 (NGS)。方法的选择将取决于所需的准确度水平以及您实验室内可用的资源,无论您选择哪种方法,我们的 LSM 插件都能满足您的需求,因为它可以 无缝集成 使用您的实验室可能拥有的任何机器/仪器。
在以下知识库中,我们将指导您逐步完成如何使用 LSM 成功执行亲子鉴定/亲属关系测试:
- 在 LSM 中创建作业
- 输入患者记录
- 使用解析器插件输入分析结果
- 下载报告
- 例如:
在 AgileBio,我们了解亲子/亲属关系基因检测可能很复杂。这就是为什么我们开发了 独特的包装 专为这些类型的测试而设计,使用特殊的插件和参数来确保准确性和可靠性。
为了使整个过程尽可能无压力,我们为每一步提供个性化的支持和指导。我们的专家团队随时解答您的任何问题。如果您有兴趣了解有关我们的亲子/亲属关系测试套餐的更多信息,请随时通过以下方式与我们联系: [电子邮件保护].
步骤1: 在 LSM 中创建作业
第一步是在 LSM 中创建一个作业。为此,只需执行以下步骤:
- 可选 LabCollector 并转到 LSM 附加组件
- 点击 ”工作”位于右上角,然后在“添加工作” 在下拉菜单中以创建新作业。
- 选择“亲子鉴定/亲属关系测试”。请注意,您始终可以创建专用于您想要的任何类型测试的模型。为此,只需导航至 管理 -> 首选项 -> 模型 (如下图所示)。
- 然后,您可以输入模型的名称、其描述、默认样品类型,并选择要在样品/作业表单中显示的样品/作业参数。完成后,点击“提交“,然后前往 管理 -> 设置 -> 职位请求,然后点击 启用模型 (如下所示)。
- 创建的模型将直接出现在 工作 下拉式菜单。
- 选择要创建的相应职位后,只需填写所有必要的详细信息,例如职位编号、职位日期、职位描述、请求者姓名以及任何其他必要信息。
步骤2: 输入患者记录
- 创建作业后,下一步是输入相应的患者记录(您也可以在创建作业之前执行此步骤)。首先,确保在适当的时间内为每位患者创建记录 LabCollector 模块。
- 例如,您可以打开 病人模块 并通过单击按钮继续创建新记录 位于右上角。
- 然后,输入参与亲子鉴定/关系测试的每位患者的所有必要详细信息,包括姓名、出生日期、性别和任何其他相关数据等信息。
- 返回 LSM 并将您刚刚创建的患者记录链接到您之前在步骤 1 中添加的作业,方法是在病例记录列表中选择它们(如下面的屏幕截图所示)。
- 预先选择其他数据,例如患者之间“据称”关系的类型(“父亲”、“祖父”、“阿姨”……)、种族、样本类型等。
步骤3: 使用解析器插件输入分析结果
- 输入患者记录后,下一步是使用解析器插件输入分析结果。解析器插件允许您输入执行分析的机器生成的 Excel 或 CSV 文件。要使用该附加组件,请按照下列步骤操作:
- 打开解析器插件 LabCollector
- 选择适当的文件夹,然后导入包含分析结果的 Excel 或 CSV 文件。
- 然后,I-Collector 会自动将参数值输入到相应的框中, TP(测试者), R1(相关1)及 R2(相关2)。
- I-Collector 还将验证作业流程并生成报告,然后您可以下载 PDF 格式的报告。
步骤4: 下载报告
最后一步是下载报告,其中包括关系百分比和所有其他相关结果。要下载报告,请按照下列步骤操作:
- 单击要下载其报告的作业旁边的齿轮图标。
- 点击“报告进展“ 标签。
- 选择您要下载的报告类型。
- 下载并查看报告。
示例:
为了更好地说明如何使用 LSM 执行亲子/关系测试,让我们考虑一个示例:
假设约翰和玛丽是杰克的所谓父母,并且实验室已从他们每个人身上获取了 DNA 样本。用户应该为 John、Mary 和 Jack 创建记录 LabCollector,包括他们的姓名、出生日期、性别和任何其他相关信息。用户还应该将记录链接到 LSM 并预先选择假定关系的类型,在本例中为父亲和母亲。
下一步是使用遗传分析仪分析 DNA 样本,并生成包含结果的 Excel/CSV 文件。然后,用户应该将文件上传到解析器,并且借助 I-collector,数据将自动注入到相应的选项卡/案例中。
假设实验室分析了 15 个基因座并发现了以下等位基因:
轨迹 | John | 玛丽 | 插口 |
D3S1358 | 16,18 | 16,18 | 16,20 |
TH01 | 8,9 | 9,9 | 9,9 |
D21S11 | 28,30 | 28,30 | 28,29 |
D18S51 | 14,15 | 14,15 | 15,16 |
D5S818 | 11,13 | 11,13 | 11,12 |
D13S317 | 10,13 | 11,13 | 12,13 |
D7S820 | 10,11 | 10,11 | 10,11 |
D16S539 | 10,12 | 11,12 | 12,13 |
脑脊液1PO | 11,12 | 10,12 | 10,12 |
五角E | 14,16 | 14,16 | 14,15 |
潘达D | 12,13 | 12,13 | 12,13 |
D8S1179 | 11,12 | 11,12 | 11,14 |
TPOX | 8,12 | 8,12 | 8,10 |
虚拟WA | 15,18 | 17,18 | 16,18 |
FGA | 21,23 | 21,23 | 22,23 |
系统会自动计算Jack和John/Mary之间的关系概率并生成相应的报告。
然后,用户可以下载显示杰克和约翰/玛丽之间关系百分比的报告,以及其他相关信息,例如分析的基因座、发现的等位基因以及计算中使用的统计参数(例如等位基因频率、Hardy-温伯格平衡等)。该报告还可以包括用户添加的任何附加注释或评论。
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- 单向阀 如何开始使用 LSM.
- 阅读我们的知识库 LSM使用指南.
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