Importujte svoje údaje (verzia 5.3 a vyššia) - LabCollector

Vyhľadávajte v znalostnej báze podľa kľúčového slova

Nachádzate sa tu:
← Všetky témy
Prístupné pre VŠETKÝCH používateľov okrem povolenia na úrovni používateľa a návštevníka

 Pripravte si LabCollector databázy. Pred importovaním údajov musíte nakonfigurovať modul, ktorý importujete, vytvorením polí, ktoré potrebujete, a pridaním možných hodnôt, ak je to potrebné. Pozrite si naše KB-Vytvoriť vlastné pole 5.2v pre viac informácií o vytváraní vlastných polí.
Uistite sa, že váš PHP má zvýšené limity: max_input_vars = 10000 XNUMX alebo viac (pozri KB-Import veľkých súborov).

Prejsť na: SPRÁVCA > Údaje > Importovať a vyberte modul, do ktorého chcete importovať údaje (jeden súbor na modul).

 Import údajov funguje iba s CSV alebo iného textového súboru s oddelenými údajmi (okrem importu sekvencií a molekúl) a nie priamo z Excelu (predpokladá sa, že svoje údaje skopírujete/prilepíte, pozri bod 2 nižšie), Access alebo iného softvéru. Údaje môžete previesť do textového formátu (textový súbor so zalomením riadkov DOS) s oddeľovačmi polí podľa vášho výberu z Excelu alebo iných typov databáz. V prípade súborov Mac OS ich uložte ako CSV pre formát Windows.

Kmeň a bunky – Vzorky – Činidlá a zásoby – Protilátky – Plazmidy – Priméry – Zvieratá – Vybavenie – Adresár – Vlastné moduly

Vyberte si jeden z modulov vyššie a postupujte podľa týchto krokov.

1. Na import údajov môžete použiť rôzne súbory: ponúka dva takéto súbory LabCollector obsahujúce všetky polia vo vami zvolenom module buď s tagmi názvu legendy alebo tagmi názvu databázy vo formáte CSV; inak si môžete vytvoriť svoj vlastný súbor s názvami vašich polí v poradí, ktoré uprednostňujete. Názvy polí sa však musia zhodovať s presnými názvami, aké sú v jednom z nich LabCollectorsúbory používateľa .
Názov legendy je názov poľa v zázname modulu, formulári alebo v zozname polí v oblastiach predvolených/vlastných polí, ktoré poliu pridelíte. Názov databázy je dostupný v oblastiach predvolených/vlastných polí a je oslobodený od špeciálnych znakov.


Usporiadajte súbor tak, aby obsahoval všetky polia, ktoré chcete importovať. Prvý riadok zodpovedá názvom polí. Jedno pole po stĺpci.

Importované údaje MUSÍ OBSAHOVAŤ oblasti súvisiace s názov (ak ste si nastavili modul s automatickým pomenovaním, nechajte stĺpec prázdny) a majiteľ (pokiaľ nezvolíte prepísanie importovaných vlastníkov v rozšírených možnostiach – pozri nižšie – alebo modul nepoužíva pole vlastníka ako v module Reagent & Supplies).
Uložte tento súbor do txt (Tab) alebo CSV (čiarka alebo bodkočiarka ako oddeľovač).

2. Nahrajte svoj súbor alebo skopírujte/prilepte riadky, ktoré chcete importovať, VŽDY s prvým riadkom zodpovedajúcim názvom polí.
Kopírovanie/vkladanie z excelu je naozaj jednoduché: vyberte bunky, ktoré chcete vložiť, a skopírujte ich do poľa, nezabudnite na hlavičky!

3. Zvoľte oddeľovač polí. Ak kopírujete/vkladáte z Excelu, vyberte oddeľovač TAB.

4. Pred výberom potvrdenia skontrolujte svoje údaje. V prípade chyby môžete import zahodiť.

pokročilé možnosti:
Vpravo hore začiarknutím políčka otvoríte sekciu možností.

Odpoveď: V predvolenom nastavení sú znaky kódované podľa normy ISO-8859-1. To vám umožňuje importovať väčšinu špeciálnych znakov, ako sú písmená s vážnym, akútnym, diaerézou, cirkumflexom... Pre niektoré jazyky (napr. čínštinu, gréčtinu...) sa musí použiť UTF-8, ak používate softvér, ktorý vám umožňuje ukladať vo formáte CSV s UTF- 8 ako kódovanie (napríklad LibreOffice).

B. Ak váš excelový súbor nemá vlastníka/hlavného operátora/zodpovednú osobu/autora (v závislosti od modulu – moduly Reagenty a zásoby a Adresár nemajú polia vlastníka), alebo ak chcete toto pole prepísať, vyberte jedného vlastníka zo zoznamu. Správcovia môžu importovať údaje pod ľubovoľným menom. Zamestnanci môžu importovať iba pod vlastným menom. Poznámka: Ako 5.4 Version pole Owner (Vlastník) je voliteľné pole v časti Reagents & Supplies.

C. Môžete si vybrať import do poradovníka. Pokiaľ ide o používateľa režimu, správca musí overiť údaje v časti ADMIN > Údaje > Zoznam čakateľov. 

D. Ak ste svoje zariadenie nakonfigurovali s možnosťou automatického ukladania, môžete k tomuto úložisku pristupovať priamo tu. Nemáte na výber box/umiestnenie, LabCollector automaticky priradí celý úložný priestor.

Počas kroku 2 máte možnosť skontrolovať výsledok importu pred konečným overením.

  • Ak sa vo vašom súbore nenachádza žiadna chyba, môžete import potvrdiť.

  • Ak ste zabudli stĺpec vlastníka alebo ste zabudli vybrať jedného vlastníka v zozname výberu v časti Rozšírené možnosti, zobrazí sa toto chybové hlásenie

  • Ak použijete vlastníka, ktorý nie je v zozname členov laboratória, alebo sa pomýlite, zobrazí sa toto chybové hlásenie

  • Ak ste zabudli stĺpec s názvom alebo ste vybrali nesprávny oddeľovač polí, zobrazí sa toto chybové hlásenie

  • Ak je váš modul nastavený ako Blokovať duplikáty v časti ADMIN > Predvoľby > Možnosti záznamov a dvakrát importujete rovnaké meno, dostanete túto správu

  • Je možné importovať začiarkavacie políčko a zoznam výberu. Hodnota sa musí zhodovať s presnými hodnotami v LabCollector. Ak je hodnota použitá v súbore importu nesprávna, zobrazí sa táto správa. Ak sa rozhodnete importovať, nesprávna hodnota sa neimportuje.

  • Viacero typov polí zoznamu a začiarkavacích políčok môže obsahovať viacero hodnôt. Hodnota sa musí zhodovať s presnými hodnotami v LabCollector a byť oddelené | (CTRL+ALT+6) alebo dvojbodka (:). Nevkladajte medzeru pred a za oddeľovač. Ak je hodnota použitá v súbore importu nesprávna, zobrazí sa hlásenie nižšie. Ak sa rozhodnete importovať, nesprávna hodnota sa neimportuje.

  • Polia „Odkaz na“ a automatické dopĺňanie možno importovať. V poli „Odkaz na“ sa hodnota vo vašom súbore musí zhodovať s presným názvom záznamu LabCollector a byť oddelené | (CTRL+ALT+6) alebo dvojbodka (:). Nevkladajte medzeru pred a za oddeľovač. Ak je hodnota použitá v súbore importu nesprávna, nesprávna hodnota sa neimportuje. Pole automatického dopĺňania je textové pole, ak existuje názov záznamu, vytvorí sa prepojenie; ak nie, text je k dispozícii

  • Nová verzia 5.41! Systém importu umožňuje zistiť jedinečnosť pre voliteľné pole jedinečného kódu a vlastné pole s aktivovanou možnosťou jedinečnosti.

 Každý importovaný záznam môže mať kód projektu. Každý použitý kód projektu už musí existovať v LabCollector pre správny dovoz.

 Vlastné polia ako napr Nahranie databázy a Nahranie priečinka na disku nie je možné importovať. Použite bezplatný doplnok Nahranie súboru vlastného poľa.

 Dátum musí byť vo formáte rrrr-mm-dd alebo rr-mm-dd, pre viac podrobností si prečítajte KB-Dátum formátovania.


Genotyp

Značky genotypu musia byť oddelené medzerou.

Sekvencie


Svoj súbor .FASTA (nie .fas) môžete nahrať priamo vo formáte:

>FN598458.1 Nekultivovaný parciálny gén 18S rRNA fylofaryngídnych riasiniek, klon GM2_C8
ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGCATATGCTTGTCTTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGTTA
TACAAGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATTTATTTGACGATTGCCTTATATGGATAA
CCGAGGGAAACTTCAGCTAATACATGCTTGTCATTTGACGTATTTATTAGTTCCACCGATGGCTTAGGCC
TTTTGATGATTCATGATAACTGATCGAAGCGATTTCGCTACGTCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTCT
GATTGTAGTGTATTGGACTACAATGGCTATTACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGA
GCCTGAGAAACGGCTACTATGTCTACGGATAGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTGTAAATCACAGAG

a vyberte typ DNA, RNA alebo proteínu. Musíte tiež vybrať vlastníka sekvencií importu (štandardne osoba spojená s prihlásením do účtu).

Keď prejdete na krok 2, získate:

Poznámka: Môžete tiež importovať sekvencie z GenBank cez Sekvencie modul.


Chemické štruktúry
Pre formát súboru MOL a SDF musí byť váš súbor naformátovaný s 3 riadkami hlavičky alebo voliteľnými značkami (uveďte počet značiek)

V prípade formátu súboru CDX môžete nahrať viacero súborov alebo súborov ZIP.

Výsledok kroku 2:


Dokumenty
Nahrajte svoj súbor ako v prípade iných modulov. K záznamom môžete priradiť aj svoje dokumenty.


Pridajte stĺpec pôvodný_názov_súboru obsahujúci presný názov dokumentu, ktorý chcete importovať do importovaného súboru, alebo prilepte riadky ako v príklade nižšie.
Potom nahrajte svoj importovaný súbor A všetky dokumenty, ktoré chcete importovať (viaceré súbory, ako je uvedené nižšie, alebo súbor zip).

V kroku 2 môžete skontrolovať názov svojich dokumentov.

Výsledok v databáze po importe: