איך להתחיל עם מודול רצפים? - LabCollector

חפש את מאגר הידע לפי מילת מפתח

אתה כאן:
← כל הנושאים
סיכום:

אתה יכול לבדוק את מאגר הידע שלנו על איך נראה מודול בדרך כלל.

בצע את השלבים הבאים כדי לגשת למודול הרצפים:

1. פתח את מודול הרצפים

2. פתח רשומה

1. פתח את מודול הרצפים

  • 1. אזור זה יראה לך את שם של המודול, ה search אפשרויות, ומאפשרים לך להוסיף א שיא חדש.
      - 1.1 אפשרות "ייבוא ​​נתוני GenBank" עוזרת לך להוסיף את הרצפים ישירות מאתר GenBank. *בדוק את KB שלנו כיצד לייבא נתונים למודול הפלסמיד, התהליך לרצפים מוסבר ב- KB.
      - 1.2 אפשרות "פיצוץ רצף חדש" עוזרת לך להפיץ רצף או Megablast.
    * בדוק את מאגר הידע שלנו על איך לחפש ב LabCollector.
  • 2. ה   אפשרויות מאפשרות לך לייצא את כל תוצאות החיפוש שלך בפורמט HTML, CSV, EXCEL, PDF. אתה יכול גם לבחור את השדה שברצונך לייצא.
        קרא את מאגר הידע שלנו על מה הם שדות ו רשום.
        השמיים האפשרות מאפשרת לך לשנן את כל הרשומות שניתן להשתמש בהן בהמשך LabCollector.
  • 3. הרשומות בדרך כלל לא יופיעו בהתחלה. עליך ללחוץ על סמל החיפוש עם שדה חיפוש ריק ותוכל לראות את כל הרשומות.

2. פתח רשומה

  • כאשר תלחץ על רשומה מסוימת, תראה את האפשרויות שלהלן.

  • A. שם הרשומה והפרטים יופיעו כאן.
  • B. אפשרויות לעריכת הרשומה יוצגו כאן. קרא את מאגר הידע שלנו אפשרויות עריכת רשומות.
  • C. השדות הקשורים לרשומה יוצגו כאן. קרא את מאגר הידע שלנו על מה הם שדות.
  • D. פס אנכי זה יספק לך את האפשרויות הקשורות לרשומה.
          

    		 סמל זה יציג את הרשומה כפי שניתן לראות בתמונה למעלה.
    אפשרות זו תציג את כל הרשומות הקשורות. לדוגמה, אם יש לך הורה ודוגמאות ילד. אז כל דגימות הילד יוצגו כאן. או אם יצרת קישור לרשומה זו במודולים אחרים, כל הרשומות הקשורות יהיו גלויות כאן.
    אפשרות זו מציגה את הרצף (5′-3′) והמפה ליניארית של הרצף עם כל ההערות בתצוגת FASTA, פורמט GB ותצוגה מעוצבת.
    אפשרות זו עוזרת לך לנהל הערות רצף. לדוגמה, אם זה רצף של פלסמיד אז אתה יכול להוסיף הערות כמו כמה אתרי הגבלה או אזורי מקדם. אתה יכול לראות כאן את ההתחלה/סיום והכיוון (היפוך/קדימה) של הערה ספציפית. המשמעות היא שכאשר אתה מייבא או יוצר פלסמיד, אתה יכול לבחור אילו הערות ברצונך לראות או למחוק. אם תייבא את הרצף הזה למודול הפלסמיד תראה את ההערות האלה במפת הפלסמיד.
    אפשרות זו מציעה לך כלים של NCBI Blast שבהם תוכל לבצע BLAST ב LabCollector, אתרים חיצוניים
    אפשרות זו מאפשרת לך לערוך את הרצף. כאשר אתה מעלה קובץ משויך אתה יכול לערוך את בסיסי הרצף.

    אתה יכול לראות את לשונית הניתוח כאן. זה יכול להראות לך את ערך הניתוח לאורך ימים או שעות. אתה יכול להוסיף את בחירתך של שדות מותאמים אישית כאן.
    *קרא את בסיס הידע שלנו על כיצד להוסיף שדות מותאמים אישית בלשונית הניתוח.
    ניתן לקשר את הרשומה למחברת המעבדה האלקטרונית (ELN הוא תוסף ב LabCollector). ניתן לקשר את הרשומה לניסוי מסוים שבוצע באמצעות פריט הרשומה. זה עוזר לך לקבל קישור למקום שבו נעשה שימוש בפריט הרשומה ולתוצאות שהושגו לאחר מכן.
    סמל זה מחבר אותך לתוסף Workflow (WF). LabCollector. תוסף WF הוא זה שבו אתה יכול ליצור תרשים זרימה של התהליך שלך שבו כל שלב דורש אימות מפקח. אם הרשומה נמצאת בשימוש בתוסף WF, תוכל לראות את הסטטוס שלה ב-WF כאן.
  • E. כאן אתה יכול לחפש את הפריימרים במודול Primers שמכלידים (זיווג משלים של ה-DNA/RNA) עם הנוקלאוטיד המסוים של הפלסמיד בקצה 3′. אתה יכול לבחור את מספר הנוקלאוטידים שאתה רוצה לחפש את הפריימרים. כאשר תלחץ על "עשה", הדפדפן יפתח את מודול הפריימרים ויראה לך את רשימת הפריימרים המשלימים.
  • F. כאן תוכל לראות את כל הקישורים שיצרת לפרוטוקול. קישורים אלה הם לרשומות האחרות במודולים אחרים ב LabCollector. לדוגמה, אם יש לך פלסמיד עבור זן חיידקי ספציפי. לאחר מכן תוכל לחבר את רשומת הפלסמיד ממודול הפלסמיד למודול הרשומה של החיידקים בזנים ותאים. אתה יכול להוסיף קישור מ LabCollector על ידי לחיצה על האפשרות "הוסף קישור" ועל ידי לחיצה על האפשרות "פתח תצוגת עץ" תוכל לראות את הקישורים המחוברים לרשומות. 

נושאים קשורים: