כיצד לבצע בדיקה גנטית אבהות/זוגיות באמצעות LSM? - LabCollector

חפש את מאגר הידע לפי מילת מפתח

אתה כאן:
← כל הנושאים

ניתן לייעל את תהליך הבדיקה הגנטית של אבהות ומערכת יחסים באמצעות ה-LSM-Add on שלנו , המבטיח אוטומציה של תהליך ההכנה והניתוח של הדגימה/בדיקה, ובאמצעות מתן ממשק ידידותי למשתמש לניתוח תוצאות, LSM מאפשר לבצע בדיקות גנטיות לאבהות בדיוק, מהירות ויעילות מוגברת.

הניתוח הגנטי על הדגימות יכול להיעשות במגוון שיטות, כולל PCR (תגובת שרשרת פולימראז), RFLP (פולימורפיזם של אורך שברי הגבלת מקטע), או רצף של הדור הבא (NGS). בחירת השיטה תהיה תלויה ברמת הדיוק הרצויה ובמשאבים הזמינים במעבדה שלך, לא משנה מהי שיטת הבחירה שלך, תוסף LSM שלנו מכסה אותך, שכן הוא יכול להשתלב בצורה חלקה עם כל מכונה/מכשיר שיש במעבדה שלך.

במאגר הידע הבא, אנו נדריך אותך בתהליך שלב אחר שלב כיצד לבצע בהצלחה בדיקת אבהות/זוגיות באמצעות LSM:

  1. צור עבודה ב-LSM
  2. הזנת רישומי חולים
  3. השתמש בתוסף מנתח לקלט תוצאות ניתוח
  4. הורד את הדוח
  5. דוגמה
הערות

ב-AgileBio, אנו מבינים שבדיקות גנטיות של אבהות/זוגיות יכולות להיות מורכבות. זו הסיבה שפיתחנו א חבילה ייחודית תוכנן במיוחד עבור בדיקות מסוג זה, תוך שימוש בתוספים ופרמטרים מיוחדים המבטיחים דיוק ואמינות.

כדי להפוך את התהליך ללא מתח ככל האפשר, אנו מציעים תמיכה והכוונה אישית בכל שלב. צוות המומחים שלנו כאן כדי לענות על כל שאלה שיש לך. אם אתה מעוניין ללמוד עוד על חבילת בדיקת האבהות/מערכת היחסים שלנו, אנא אל תהסס לפנות אלינו בכתובת [מוגן בדוא"ל].

שלב 1: צור עבודה ב-LSM

 

הצעד הראשון הוא יצירת עבודה ב- LSM. כדי לעשות זאת, פשוט בצע את השלבים הבאים:

  • להרחיב LabCollector ועבור לתוסף LSM
  • לחץ על "עבודה" ממוקם בפינה הימנית העליונה, ולאחר מכן על "הוסף עבודה" בתפריט הנפתח כדי ליצור עבודה חדשה.
  • בחר באפשרות "מבחן אבהות/זוגיות". שימו לב שתמיד תוכלו ליצור מודל ייעודי לכל סוג של בדיקות שתרצו. כדי לעשות זאת, פשוט נווט אל אדמין -> העדפות -> דגמים (כפי שמוצג בצילום המסך למטה).

  • לאחר מכן תוכל להזין את השם של המודל, את התיאור שלו, את סוג המדגם המוגדר כברירת מחדל ולבחור את הפרמטרים של המדגם/עבודה שברצונך שיופיעו בטופס המדגם/עבודה שלך. לאחר שתסיים, לחץ על "להגיש", ואז פנה אל מנהל -> הגדרה -> בקשות עבודה, ולחץ על אפשר מודלים (כפי שמוצג מטה).

  • המודלים שנוצרו יופיעו לאחר מכן ישירות בתוך עבודה התפריט הנפתח.

  • לאחר בחירת המשרה המתאימה שברצונך ליצור, פשוט מלא את כל הפרטים הדרושים, כגון מספר המשרה, תאריך המשרה, התיאור שלה, שם המבקש וכל מידע נחוץ אחר.

 

שלב 2: הזנת רישומי חולים

 

  • לאחר שיצרת את העבודה, השלב הבא הוא הזנת רישומי המטופלים המתאימים (תוכל גם לבצע שלב זה לפני יצירת העבודה). ראשית, ודא שאתה יוצר את הרשומות עבור כל מטופל במסגרת המתאימה LabCollector מודול.
  • לדוגמה, אתה יכול לפתוח את מודול מטופל והמשך ליצירת רשומה חדשה, על ידי לחיצה על הכפתור ממוקם בפינה הימנית העליונה.

  • לאחר מכן, הזינו את כל הפרטים הדרושים עבור כל אחד מהמטופלים המעורבים בבדיקת אבהות/זוגיות, לרבות מידע כגון שם, תאריך לידה, מין וכל נתון רלוונטי אחר.
  • חזור אל LSM וקשר את רישומי המטופלים שיצרת זה עתה לעבודה שהוספת בעבר בשלב 1, על ידי בחירתם ברשימת רישומי המקרים (כפי שמוצג בצילום המסך למטה).

הערות
ודא כי אפשרות רישום המקרה מופעלת על ידי ניווט אל מנהל מערכת -> הגדרה -> רישום מקרה.

 

  • בחר מראש נתונים נוספים, כגון סוג הקשר "לכאורה" בין המטופלים ("אבא", "סבא", "דודה", ...), מוצאם האתני, סוג המדגם וכו'.

 

שלב 3: השתמש בתוסף מנתח לקלט תוצאות ניתוח

 

  • לאחר שהזנת את רישומי המטופל, השלב הבא הוא להשתמש בתוסף המנתח כדי להזין את תוצאות הניתוח. תוסף מנתח מאפשר לך להזין קבצי Excel או CSV שנוצרו על ידי המחשב שביצעה את הניתוח. כדי להשתמש בתוסף, בצע את השלבים הבאים:
  • פתח את תוסף המנתח LabCollector
  • בחר בתיקייה המתאימה ואז ייבא את קובץ ה- Excel או ה-CSV המכיל את תוצאות הניתוח.

  • לאחר מכן I-Collector יזין אוטומטית את ערכי הפרמטר לתיבות המתאימות להם, TP (אדם נבדק), R1 (קשור 1), ו R2 (קשור 2).

  • I-Collector גם יאמת את תהליך העבודה ויפיק דוח, שאותו תוכל להוריד כפורמט PDF.

 

שלב 4: הורד את הדוח

 

השלב האחרון הוא הורדת הדוח, שיכלול את אחוז הקשר וכל שאר התוצאות הרלוונטיות. כדי להוריד את הדוח, בצע את השלבים הבאים:

  • לחץ על סמל גלגל השיניים שליד העבודה שעבורה ברצונך להוריד את הדוח.
  • הקלק על ה "להגיש תלונה".
  • בחר את סוג הדוח שברצונך להוריד.
  • הורד ועיין בדוח.

דוגמא:

כדי להמחיש טוב יותר כיצד לבצע בדיקת אבהות/זוגיות באמצעות LSM, הבה נשקול דוגמה:

נניח שג'ון ומרי הם הוריו לכאורה של ג'ק, והמעבדה השיגה דגימות DNA מכל אחד מהם. המשתמש צריך ליצור רשומות עבור John, Mary וג'ק אין LabCollector, לרבות שמם, תאריך הלידה, המגדר וכל מידע רלוונטי אחר. על המשתמש גם לקשר את הרשומות ל-LSM ולבחור מראש את סוג הקשר האמור, במקרה זה, אב ואמא.

השלב הבא הוא ניתוח דגימות ה-DNA באמצעות מנתח גנטי ויצירת קובץ Excel/CSV עם התוצאות. לאחר מכן המשתמש צריך להעלות את הקובץ ל-Parser והנתונים יוזרקו אוטומטית ללשוניות/מקרים המתאימים הודות ל-I-collector.

נניח שהמעבדה ניתחה 15 לוקוסים ומצאה את האללים הבאים:

לוקוס ג'ון מרי שקע
D3S1358 16,18 16,18 16,20
TH01 8,9 9,9 9,9
D21S11 28,30 28,30 28,29
D18S51 14,15 14,15 15,16
D5S818 11,13 11,13 11,12
D13S317 10,13 11,13 12,13
D7S820 10,11 10,11 10,11
D16S539 10,12 11,12 12,13
CSF1PO 11,12 10,12 10,12
פנטה אי 14,16 14,16 14,15
פנטה ד 12,13 12,13 12,13
D8S1179 11,12 11,12 11,14
TPOX 8,12 8,12 8,10
vWA 15,18 17,18 16,18
FGA 21,23 21,23 22,23

 

המערכת תחשב אוטומטית את ההסתברות לקשר בין ג'ק וג'ון/מרי ותפיק את הדוח המתאים.

לאחר מכן המשתמש יכול להוריד את הדוח המציג את אחוז הקשר בין ג'ק וג'ון/מרי, יחד עם מידע רלוונטי נוסף כגון הלוקוסים שנותחו, האללים שנמצאו והפרמטרים הסטטיסטיים המשמשים בחישוב (למשל תדרי אללים, הארדי- שיווי משקל וינברג וכו'). הדוח יכול לכלול גם הערות נוספות או הערות נוספות שנוספו על ידי המשתמש.

נושאים קשורים: