סיכום:

במכשיר ה-PCR שלך, עליך לציין את המפה של הצלחת כדי לוודא שאתה שם נכון היכן נמצאות הדגימות. בהתאם לכך, לאחר הפעלת PCR יווצר קובץ התוצאה עבור כל דגימה. כדי לפשט את התהליך הזה, אתה יכול ליצור קובץ מניפסט לדוגמה הכולל את מפת הלוח עבור דגימות ה-PCR שיופעלו, באמצעות תוסף סדרן הצינורות שלנו.

אנא בצע את השלב הבא כדי ליצור את קובץ המניפסט לדוגמה:

1. העלה קובץ תבנית לדוגמה

2. צור קובץ מניפסט לדוגמה

• א. שימוש במפת קופסה/צלחת באחסון.
• ב. שימוש בקבלת מדגם

1. העלה קובץ תבנית לדוגמה

• בתוסף סדרן שפופרות אתה צריך ללכת ל"הגדרה" ואז "לנהל תבניות".
• כאן תוכל להעלות קובץ CSV או TXT עבור התבנית שלך. 
  

• טיפים/עצות

  אתה תמצא את התבנית לריצה ממכונת ה-PCR שלך. במידת הצורך נוכל לסייע לך בהתאמת התבנית בהתאם לדרישותיך.
• אתה יכול גם ללחוץ על האפשרות "מצא עזרה" כדי לראות את האפשרויות ליצור קובץ מניפסט לדוגמה. זה יראה לך חלון קופץ שיאפשר לך לראות באילו תגים אתה יכול להשתמש בקובץ המניפסט לדוגמה שלך.
  
• הקובץ שהועלה זה יכיל מידע כמו הדוגמה בתמונה למטה. עמודת המיקום תגדיר את מיקום הדגימות בצלחת. שאר העמודות יהיו תלויות בפרוטוקול PCR ובדרישות של המכונה שלך.
  אתה יכול לפתוח את הקובץ ב-CSV אם תרצה, אבל אתה צריך לתחום את ה-CSV אם אתה רוצה לראות אותו בפורמט שלהלן.
  *אנא קרא את מאגר הידע שלנו בנושא כיצד לתחום CSV.
  

• כאשר יש לך כפילויות אתה יכול לשכפל את מיקום הבאר. כפי שאתה רואה בתמונה לדוגמה לעיל. 
• המיקום בתגי הגיבוב הללו יילקח אוטומטית מה- LabCollector מערכת אחסון. חלק זה מוסבר בחלק הבא.
• לאחר שעדכנת את התבנית והעלית אותה לסדרן שפופרות, תוכל להשתמש בתבנית זו בקלות עבור כל ריצות הדוגמאות שאתה מבצע ב-PCR שלך.
• אתה יכול להעלות מספר תבניות וגדלים שונים של PCR כמו 96 או 384, וגם למזג צלחות באמצעות סדרן שפופרות.

2. צור קובץ מניפסט לדוגמה

א. שימוש במפת קופסה/צלחת באחסון

• In LabCollector אחסון אתה יכול ליצור קופסאות או צלחות עם דוגמאות במיקומים ספציפיים ותוכל להשתמש בהם כדי ליצור לך קובצי מניפסט לדוגמה. אתה יכול ליצור צלחות או קופסאות ולהוסיף דוגמאות ספציפיות במקומות המתאימים. 
  *על מנת ליצור את הקופסאות או הצלחות שלך אנא קרא את מאגר הידע על איך להציב LabCollector אִחסוּן.
  *אנא עיין במאגר הידע שלנו בנושא כיצד ליצור קופסאות מודל.
  
• טיפים/עצות

  אתה יכול לתת שם לצלחת לפי התאריך, כדי לשמור אותן מופרדות או ליצור מיקום מזויף במעבדה כדי לאחסן את כל הצלחות שאתה הולך לעשות עבורן ריצה, כדי שאחרי תוכל למחוק אותן. 
  הקופסאות למרות שבדפדפן האחסון יכולות לכלול קופסאות או לוחות דמיוניים, רק ליצירת קובצי מניפסט לדוגמה. 
  אתה יכול ליצור קובצי מניפסט לדוגמה באמצעות תוסף קבלה לדוגמה. התהליך עבור אותו מוסבר להלן בסעיף 2 חלק ב'.
  
• לאחר שיצרת את הקופסה/צלחת עבור ה-PCR שלך עם דגימות במיקומים ספציפיים, אתה גם חוסם את הבארות עבור דגימות הבקרה. כך לא יאוחסנו דגימות אפילו בטעות בעמדות אלו.
• אזהרה

  כאשר אתה יוצר מודל לצלחת עבור PCR ואתה רוצה לחסום את הבארות, אז זה יהיה אפשרי רק עם מודל BOX ו לֹא דגם הפלייט.
  
• כדי לחסום את המיקום אתה רק צריך לבחור את התאים על ידי לחיצה על סימן + ולעדכן את התיבה כמו השלבים המפורטים להלן.
  אם תרצו להסיר את העמדות החסומות תוכלו גם ללחוץ על 3נקה את כל העמדות החסומות ולעדכן את המודל.
  
• כדי ליצור קובץ מניפסט לדוגמא באמצעות סדרן שפופרות, עבור לתוסף ובדף הבית לחץ על "צור קובץ מניפסט לדוגמה". 
  
• תראה את הדף למטה, שבו אתה צריך למצוא את שם הקופסה/צלחת שיצרת קודם לכן; אתה יכול אפילו להוסיף כמה צלחות יחד על ידי לחיצה על הסימן + הקטן. לאחר שבחרתם את הקופסה/צלחת 
  
• ברגע שתלחץ על הבא, תראה את המידע על דוגמאות בתוך הקופסה או הצלחת;
  1. אתה יכול לבחור את קובץ המניפסט לדוגמה באמצעות הרשימה הנפתחת (זו שהעלית בסעיף 1 לעיל),
  2. צלחות מיקס מאפשרות לבחור מספר צלחות ולערבב בהן את מיקום הדוגמאות עם מפריד לבחירתכם. לדוגמה, כאשר אתה מערבב, אתה תראה
     מיקום צלחת_1 A1 עם מיקום צלחת_2 A1 או 
     מיקום צלחת_1 A2 עם מיקום צלחת_2 A2 וכו'.
  3. אתה יכול לקבל כותרת ביניים, כלומר אם אתה בוחר מספר צלחות מבלי לערבב אותן, אז הלוחות חוזרים על עצמם בתבנית. אפשרויות אלה מאפשרות לכותרות להיות נוכחות בין כל צלחת כדי להפריד אותן זו מזו. אם לא תבחר באפשרות זו, הכותרות של כל צלחת לא יופיעו בין התבניות.
  4. ולחץ על צור קובץ מניפסט.
     *המקומות הריקים בצלחות ייראו ריקים ויופיעו ההערה "לא נמצא" מתחת למדף/מגש העמודה.
     מיקום ההאשטאג יתמלא בשם המדגם בתבנית המניפסט לדוגמה.
     
• כאשר תלחץ על כפתור צור קובץ מניפסט, תראה חלון קופץ לשמירת הקובץ בפורמט txt. אתה יכול גם לפתוח את ה-txt או לשנות את שם הקובץ שלך על ידי שינוי הסיומת מ-.txt ל-.csv בזמן שמירת הקובץ.
• זה הקובץ שאתה צריך להעביר ידנית למכונת ה-PCR לצורך ההרצה.

ב. שימוש בקבלת מדגם

• אתה יכול ליצור קופסאות/צלחות ישירות בתוך תוסף קבלת הדוגמא.
• בקבלה לדוגמה תוכל להגדיר את ההגדרות עבור הפרויקט שלך. כאן אתה יכול לבחור קופסת דגם שאתה יוצר בה אדמין -> אחסון -> ניהול אחסון-> מודלים.
  *אנא קרא את מאגר הידע שלנו על כיצד להגדיר קבלת דוגמאות.
• ניתן ליצור חבילה בה ניתן ליצור צלחת.
  *אנא קרא את מאגר הידע שלנו בנושא  כיצד ליצור חבילה ולעבד אותה.
  *אנא קרא את מאגר הידע שלנו בנושא כיצד לעבד צלחות בקבלת דוגמאות.
• אתה יכול לסרוק את ברקוד הדגימות שלך כדי להוסיף דגימות במיקום הבאר השונה שאתה רוצה.
  *אם יש לך קופסה אז בזמן הכנת דגם אתה יכול לחסום עמדות עבור דגימות הבקרה, אם הן תמיד מונחות באותו מקום. הוסבר בסעיף 2 לעיל.
• אתה יכול לשמור את הקופסה הזו בחדר וציוד דמיוניים או מזויפים ולהשתמש בו כדי ליצור את קובץ המניפסט לדוגמה. כמו התהליך שהוסבר בסעיף 3 א.
• לאחר מכן יש להעביר את קובץ המניפסט לדוגמה שיצרת למכונה באופן ידני.

נושאים קשורים:

• אנא בדוק את KB שלנו כיצד ליצור ולעבד חבילות בתוספת קבלה לדוגמה.
• קראו עוד על כיצד לאחסן אוטומטית דוגמאות מהדגימה המקבלת במודול.
• קרא את KB שלנו על איך לעבד צלחות
• קראו עוד על כיצד לחבר ולשלוח דוגמאות מ'קבלת דגימות' כדי לעשות בדיקות ב'LSM'.