LSM을 사용하여 친자관계/관계 유전자 검사를 수행하는 방법은 무엇입니까? - LabCollector

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LSM-Add on을 사용하면 친자관계 및 관계 유전자 검사 과정을 더욱 효율적으로 만들 수 있습니다. , 샘플/검사 준비 및 분석 프로세스를 자동화하고 결과 분석을 위한 사용자 친화적인 인터페이스를 제공함으로써 LSM은 향상된 정확성, 속도 및 효율성으로 친자 유전자 검사를 수행할 수 있게 해줍니다.

검체에 대한 유전자 분석은 PCR(중합효소연쇄반응), RFLP(제한 단편 길이 다형성), 차세대 염기서열분석(NGS) 등 다양한 방법을 사용해 수행할 수 있습니다. 방법 선택은 원하는 정확도 수준과 실험실 내에서 사용할 수 있는 리소스에 따라 달라집니다. 어떤 방법을 선택하든 당사의 LSM 추가 기능이 지원됩니다. 원활하게 통합 귀하의 실험실에 있는 모든 기계/기구를 사용하십시오.

다음 지식 베이스에서는 LSM을 사용하여 친자관계/관계 테스트를 성공적으로 수행하는 방법에 대한 단계별 프로세스를 안내합니다.

  1. LSM에서 작업 생성
  2. 환자 기록 입력
  3. Parser Add-On을 사용하여 분석 결과 입력
  4. 보고서 다운로드
  5. 예
주의 사항

AgileBio에서는 친자관계/관계 유전자 검사가 복잡할 수 있다는 것을 이해합니다. 이것이 바로 우리가 개발한 이유입니다. 독특한 패키지 정확성과 신뢰성을 보장하는 특수 플러그인과 매개변수를 사용하여 이러한 유형의 테스트를 위해 특별히 설계되었습니다.

가능한 한 스트레스 없는 프로세스를 만들기 위해 우리는 모든 단계에서 맞춤형 지원과 지침을 제공합니다. 우리 전문가 팀이 귀하의 모든 질문에 답변해 드립니다. 친자관계/관계 테스트 패키지에 대해 더 자세히 알고 싶으시면 주저하지 말고 다음 주소로 문의해 주세요. [이메일 보호].

1 단계 : LSM에서 작업 생성

 

첫 번째 단계는 LSM에서 작업을 생성하는 것입니다. 그렇게 하려면 아래 단계를 따르십시오.

  • 엽니다 LabCollector LSM 애드온으로 이동하세요.
  • 클릭 "일"를 오른쪽 상단에 찾은 다음 "작업 추가”을 클릭하여 새 작업을 생성하세요.
  • "선택친자관계/관계 테스트“. 원하는 모든 유형의 테스트 전용 모델을 언제든지 만들 수 있습니다. 그렇게 하려면 다음으로 이동하면 됩니다. 관리 -> 기본 설정 -> 모델 (아래 스크린샷에 표시된 대로).

  • 그런 다음 모델 이름, 설명, 기본 샘플 유형을 입력하고 샘플/작업 양식에 표시하려는 샘플/작업 매개변수를 선택할 수 있습니다. 완료되면 '를 클릭하세요.제출"그럼 다음으로 가세요. 관리 -> 설정 -> 작업 요청,를 클릭하십시오 모델 활성화 (아래 그림과 같이).

  • 그러면 생성된 모델이 일 드롭 다운 메뉴.

  • 생성하려는 해당 작업을 선택한 후 작업 번호, 작업 날짜, 설명, 요청자 이름 및 기타 필요한 정보 등 필요한 모든 세부 정보를 입력하기만 하면 됩니다.

 

2 단계 : 환자 기록 입력

 

  • 작업을 생성한 후 다음 단계는 해당 환자 기록을 입력하는 것입니다(작업을 생성하기 전에 이 단계를 수행할 수도 있음). 먼저, 적절한 범위 내에서 각 환자에 대한 기록을 생성했는지 확인하십시오. LabCollector 기준 치수.
  • 예를 들어 다음을 열 수 있습니다. 환자 모듈 버튼을 클릭하여 새 레코드 생성을 진행합니다. 오른쪽 상단에 위치합니다.

  • 그런 다음 이름, 생년월일, 성별 및 기타 관련 데이터와 같은 정보를 포함하여 친자관계/관계 테스트에 관련된 각 환자에 대해 필요한 모든 세부 정보를 입력합니다.
  • LSM으로 돌아가서 방금 생성한 환자 기록을 사례 기록 목록 내에서 선택하여 이전에 1단계에서 추가한 작업에 연결합니다(아래 스크린샷 참조).

주의 사항
다음으로 이동하여 사례 기록 옵션이 활성화되어 있는지 확인하세요. 관리 -> 설정 -> 사례 기록.

 

  • 환자 간의 "주장되는" 관계 유형("아버지", "할아버지", "이모" 등), 인종, 표본 유형 등과 같은 추가 데이터를 미리 선택합니다.

 

3 단계 : Parser Add-on을 사용하여 분석 결과 입력

 

  • 환자 기록을 입력한 후 다음 단계는 파서 추가 기능을 사용하여 분석 결과를 입력하는 것입니다. 파서 추가 기능을 사용하면 분석을 수행한 기계에서 생성된 Excel 또는 CSV 파일을 입력할 수 있습니다. 추가 기능을 사용하려면 다음 단계를 따르세요.
  • 다음에서 파서 추가 기능을 엽니다. LabCollector
  • 해당 폴더를 선택한 후 분석 결과가 포함된 Excel 또는 CSV 파일을 가져옵니다.

  • 그러면 I-Collector는 해당 상자에 매개변수 값을 자동으로 입력합니다. TP (시험 대상자), R1(관련 1)및 R2(관련 2).

  • I-Collector는 작업 프로세스를 검증하고 보고서를 생성하며, 보고서를 PDF 형식으로 다운로드할 수 있습니다.

 

4 단계 : 보고서 다운로드

 

마지막 단계는 관계 비율 및 기타 모든 관련 결과가 포함된 보고서를 다운로드하는 것입니다. 보고서를 다운로드하려면 다음 단계를 따르세요.

  • 보고서를 다운로드하려는 작업 옆에 있는 기어 아이콘을 클릭하세요.
  • "Report" 탭.
  • 다운로드하려는 보고서 유형을 선택하세요.
  • 보고서를 다운로드하여 검토하세요.

예:

LSM을 사용하여 친자관계/친자관계 테스트를 수행하는 방법을 더 잘 설명하기 위해 다음 예를 고려해 보겠습니다.

John과 Mary가 Jack의 부모로 추정되고, 연구실에서 그들 각각으로부터 DNA 샘플을 얻었다고 가정해 보겠습니다. 사용자는 John, Mary, Jack에 대한 레코드를 생성해야 합니다. LabCollector, 이름, 생년월일, 성별 및 기타 관련 정보를 포함합니다. 또한 사용자는 기록을 LSM에 연결하고 가정된 관계 유형(이 경우 아버지와 어머니)을 미리 선택해야 합니다.

다음 단계는 유전자 분석기를 사용하여 DNA 샘플을 분석하고 결과가 포함된 Excel/CSV 파일을 생성하는 것입니다. 그런 다음 사용자는 파일을 Parser에 업로드해야 하며 I-collector 덕분에 데이터가 해당 탭/케이스에 자동으로 삽입됩니다.

실험실에서 15개 유전자좌를 분석하여 다음 대립 유전자를 발견했다고 가정해 보겠습니다.

현장 요한 복음 메리 잭
D3S1358 16,18 16,18 16,20
TH01 8,9 9,9 9,9
D21S11 28,30 28,30 28,29
D18S51 14,15 14,15 15,16
D5S818 11,13 11,13 11,12
D13S317 10,13 11,13 12,13
D7S820 10,11 10,11 10,11
D16S539 10,12 11,12 12,13
CSF1PO 11,12 10,12 10,12
펜타E 14,16 14,16 14,15
펜타D 12,13 12,13 12,13
D8S1179 11,12 11,12 11,14
티폭스 8,12 8,12 8,10
vWA 15,18 17,18 16,18
FGA 21,23 21,23 22,23

 

시스템은 Jack과 John/Mary 간의 관계 확률을 자동으로 계산하고 해당 보고서를 생성합니다.

그런 다음 사용자는 분석된 유전자좌, 발견된 대립유전자, 계산에 사용된 통계 매개변수(예: 대립유전자 빈도, Hardy-유전자)와 같은 기타 관련 정보와 함께 Jack과 John/Mary 간의 관계 비율을 보여주는 보고서를 다운로드할 수 있습니다. 와인버그 평형 등). 보고서에는 사용자가 추가한 추가 메모나 설명도 포함될 수 있습니다.

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