튜브 분류기 추가 기능을 사용하여 PCR 샘플 매니페스트 파일을 만드는 방법은 무엇입니까? - LabCollector

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개요:

PCR 기계에서는 샘플이 있는 위치를 올바르게 지정하기 위해 플레이트 맵을 지정해야 합니다. 이에 따라 PCR 실행 후 각 샘플에 대한 결과 파일이 생성됩니다. 이 프로세스를 단순화하려면 튜브 분류기 추가 기능을 사용하여 실행할 PCR 샘플에 대한 플레이트 맵이 있는 샘플 매니페스트 파일을 생성할 수 있습니다.

아래 단계에 따라 샘플 매니페스트 파일을 생성하세요.

1. 샘플 템플릿 파일 업로드

2. 샘플 매니페스트 파일 생성

  • A. 저장소에서 상자/플레이트 맵을 사용합니다.
  • B. 샘플 수신 사용

1. 샘플 템플릿 파일 업로드

  • 튜브 분류기 추가 기능에서는 "설정"으로 이동한 다음 "템플릿 관리"로 이동해야 합니다.
  • 여기에서 템플릿에 대한 CSV 또는 TXT 파일을 업로드할 수 있습니다. 

  • 팁/힌트
    PCR 기계에서 실행을 위한 템플릿을 찾을 수 있습니다. 필요한 경우 귀하의 요구 사항에 따라 템플릿을 조정하는 데 도움을 드릴 수 있습니다.
  • 또한 "도움말 찾기" 옵션을 클릭하여 샘플 매니페스트 파일을 생성하는 옵션을 볼 수도 있습니다. 샘플 매니페스트 파일에서 사용할 수 있는 태그를 확인할 수 있는 팝업이 표시됩니다.
  • 업로드된 파일에는 아래 이미지의 예와 같은 정보가 포함됩니다. 위치 열은 플레이트 내 샘플의 위치를 ​​정의합니다. 나머지 열은 PCR 프로토콜과 기계 요구 사항에 따라 달라집니다.
    원하는 경우 CSV로 파일을 열 수 있지만, 아래 형식으로 보려면 CSV를 구분해야 합니다.
    *다음에 대한 지식 베이스를 읽어 보십시오. CSV를 구분하는 방법.

  • 복제본이 있는 경우 우물의 위치를 ​​복제할 수 있습니다. 위의 예시 이미지에서 볼 수 있듯이. 
  • 이 해시 태그의 위치는 다음에서 자동으로 가져옵니다. LabCollector 저장 시스템. 이 부분은 다음 섹션에서 설명합니다.
  • 템플릿을 업데이트하고 튜브 분류기에 업로드한 후에는 PCR에서 수행하는 모든 샘플 실행에 이 템플릿을 쉽게 사용할 수 있습니다.
  • 여러 템플릿과 96 또는 384와 같은 다양한 크기의 PCR을 업로드할 수 있으며 튜브 분류기를 사용하여 플레이트를 병합할 수도 있습니다.

2. 샘플 매니페스트 파일 생성

A. Storage에서 상자/플레이트 맵 사용

  • In LabCollector 저장소를 사용하면 특정 위치에 샘플이 포함된 상자나 플레이트를 만들 수 있고 이를 사용하여 샘플 매니페스트 파일을 만들 수 있습니다. 플레이트나 상자를 생성하고 각 위치에 특정 샘플을 추가할 수 있습니다. 
    *박스나 플레이트를 만들려면 다음의 지식베이스를 읽어보세요. 설정 방법 LabCollector 저장.
    * 당사의 지식 베이스를 참조하십시오. 모델 상자를 생성하는 방법.
  • 팁/힌트
    날짜에 따라 플레이트 이름을 지정하여 분리된 상태로 유지하거나 실험실에 가짜 위치를 만들어 실행하려는 모든 플레이트를 저장한 후 삭제할 수 있습니다. 
    저장소 브라우저에 있는 상자에도 샘플 매니페스트 파일을 생성하기 위한 가상의 상자나 플레이트가 있을 수 있습니다. 
    샘플 수신 추가 기능을 사용하여 샘플 매니페스트 파일을 생성할 수도 있습니다. 이에 대한 프로세스는 아래 섹션 2 파트 B에 설명되어 있습니다.
  • 특정 위치에 샘플이 포함된 PCR용 상자/플레이트를 만든 후에는 대조 샘플용 웰도 차단합니다. 이렇게 하면 실수로 해당 위치에 샘플이 저장되지 않습니다.
  • 경고
    PCR용 플레이트 모델을 생성하고 웰을 차단하려는 경우 이는 BOX 모델에서만 가능하며 지원 플레이트 모델.
  • 위치를 차단하려면 + 기호를 클릭하여 셀을 선택하고 아래 설명된 단계와 같이 상자를 업데이트하면 됩니다.
    차단된 위치를 제거하려면 3차단된 위치 모두 지우기 및 모델 업데이트를 클릭할 수도 있습니다.
  • 튜브 분류기를 사용하여 샘플 매니페스트 파일을 생성하려면 추가 기능으로 이동하여 홈 페이지에서 "샘플 매니페스트 파일 생성"을 클릭하세요. 
  • 이전에 생성한 상자/플레이트 이름을 찾아야 하는 아래 페이지가 표시됩니다. 작은 + 기호를 클릭하면 여러 개의 플레이트를 함께 추가할 수도 있습니다. 상자/접시를 선택하고 나면 
  • 다음을 클릭하면 상자나 플레이트 내부의 샘플에 대한 정보가 표시됩니다.
    1. 드롭다운 목록(위 섹션 1에서 업로드한 파일)을 사용하여 샘플 매니페스트 파일을 선택할 수 있습니다.
    2. Mix plate를 사용하면 여러 개의 plate를 선택하고 그 안에 있는 샘플의 위치를 ​​원하는 분리기를 사용하여 혼합할 수 있습니다. 예를 들어 혼합하면 다음과 같은 결과가 나타납니다.
      Plate_1 위치 A1 및 Plate_2 위치 A1 또는 
      Plate_1 위치 A2, Plate_2 위치 A2 등
    3. 중간 헤더를 가질 수 있습니다. 즉, 여러 플레이트를 혼합하지 않고 선택하면 플레이트가 템플릿에서 반복됩니다. 이 옵션을 사용하면 헤더가 각 플레이트 사이에 존재하여 서로 분리될 수 있습니다. 이 옵션을 선택하지 않으면 각 플레이트의 헤더가 템플릿 사이에 표시되지 않습니다.
    4. 매니페스트 파일 생성을 클릭하세요.
      *플레이트의 빈 공간은 비어 있는 것처럼 보이며 컬럼 랙/트레이 아래에 "찾을 수 없음"이라는 설명이 표시됩니다.
      해시태그 위치는 샘플 매니페스트 템플릿의 샘플 이름으로 채워집니다.
  • 매니페스트 파일 생성 버튼을 클릭하면 파일을 txt 형식으로 저장하라는 팝업이 표시됩니다. 파일을 저장하는 동안 확장자를 .txt에서 .csv로 변경하여 txt를 열거나 파일 이름을 변경할 수도 있습니다.
  • 이는 실행을 위해 PCR 기계로 수동으로 전송해야 하는 파일입니다.

B. 샘플 수신 사용

  • 샘플 수신 추가 기능 내에서 직접 상자/플레이트를 만들 수 있습니다.
  • 샘플 수신에서는 프로젝트에 대한 설정을 구성할 수 있습니다. 여기에서 생성한 모델 상자를 선택할 수 있습니다. 관리자 -> STORAG​​E -> 스토리지 관리-> 모델.
    *다음에서 당사의 지식 베이스를 읽어 보십시오. 샘플 수신을 구성하는 방법.
  • 플레이트를 생성할 수 있는 패키지를 생성할 수 있습니다.
    *다음에 대한 지식 베이스를 읽어 보십시오.  패키지를 생성하고 처리하는 방법.
    *다음에 대한 지식 베이스를 읽어 보십시오. 샘플 접수 시 플레이트를 처리하는 방법.
  • 샘플 바코드를 스캔하여 원하는 다른 웰 위치에 샘플을 추가할 수 있습니다.
    *상자가 있는 경우 모델을 만드는 동안 항상 같은 위치에 배치되는 대조 샘플의 위치를 ​​차단할 수 있습니다. 위의 섹션 2에서 설명했습니다.
  • 이 상자를 가상 또는 가짜 방과 장비에 저장하고 이를 사용하여 샘플 매니페스트 파일을 생성할 수 있습니다. 섹션 3A에 설명된 프로세스와 같습니다.
  • 그런 다음 생성한 샘플 매니페스트 파일을 머신에 수동으로 전송해야 합니다.

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