كيف تبدأ مع وحدة التسلسلات؟ - LabCollector

البحث في قاعدة المعرفة عن طريق الكلمات الرئيسية

أنت هنا:
← جميع المواضيع
ملخص:

يمكنك التحقق من قاعدة المعرفة لدينا على كيف تبدو الوحدة بشكل عام.

اتبع هذه الخطوات للوصول إلى وحدة التسلسلات:

1. افتح وحدة التسلسلات

2. افتح سجلا

1. افتح وحدة التسلسلات

  • 1. سوف تظهر لك هذه المنطقة الاسم من الوحدة، . الخيارات، وتسمح لك بإضافة رقم قياسي جديد.
      - 1.1 يساعدك خيار "استيراد بيانات GenBank" على إضافة التسلسلات مباشرة من موقع GenBank. *تحقق من قاعدة المعارف لدينا كيفية استيراد البيانات في وحدة البلازميد، يتم شرح عملية التسلسل في قاعدة المعارف.
      - 1.2 يساعدك خيار "تفجير تسلسل جديد" على انفجار تسلسل أو Megablast.
    * تحقق من قاعدة المعرفة لدينا على كيفية البحث في LabCollector.
  • 2.   تتيح لك الخيارات تصدير جميع نتائج البحث بتنسيق HTML وCSV وEXCEL وPDF. يمكنك أيضًا تحديد الحقل الذي تريد تصديره.
        اقرأ قاعدة المعرفة الخاصة بنا حول ما هي الحقول و تسجيل.
        • يتيح لك الخيار حفظ كافة السجلات التي يمكن استخدامها بشكل أكبر في LabCollector.
  • 3. لن تظهر السجلات بشكل عام في البداية. تحتاج إلى النقر على أيقونة البحث مع حقل بحث فارغ وستتمكن من رؤية جميع السجلات.

2. افتح سجلا

  • عند النقر على سجل معين، سترى الخيارات أدناه.

  • A. سيظهر اسم السجل وتفاصيله هنا.
  • B. سيتم عرض خيارات تحرير السجل هنا. اقرأ قاعدة المعرفة لدينا خيارات تحرير السجلات.
  • C. سيتم عرض الحقول المتعلقة بالسجل هنا. اقرأ قاعدة المعرفة الخاصة بنا حول ما هي الحقول.
  • D. سيوفر لك هذا الشريط الرأسي الخيارات المتعلقة بالسجل.
          

    		 سيعرض هذا الرمز السجل كما هو موضح في الصورة أعلاه.
    سيعرض هذا الخيار جميع السجلات ذات الصلة. على سبيل المثال، إذا كان لديك عينات من أحد الوالدين والطفل. ثم سيتم عرض جميع العينات الفرعية هنا. أو إذا قمت بإنشاء رابط لهذا السجل في وحدات أخرى، فستكون جميع السجلات ذات الصلة مرئية هنا.
    يعرض لك هذا الخيار التسلسل (5′-3′) والخريطة الخطية للتسلسل مع جميع التعليقات التوضيحية في عرض FASTA وتنسيق GB والعرض المنسق.
    يساعدك هذا الخيار على إدارة التعليقات التوضيحية للتسلسل. على سبيل المثال، إذا كان عبارة عن تسلسل بلازميد، فيمكنك إضافة تعليقات توضيحية مثل بعض مواقع التقييد أو مناطق المروج. يمكنك هنا ملاحظة البداية/النهاية والاتجاه (للخلف/للأمام) لتعليق توضيحي محدد. وهذا يعني أنه عند استيراد أو إنشاء بلازميد، يمكنك اختيار التعليقات التوضيحية التي تريد رؤيتها أو حذفها. إذا قمت باستيراد هذا التسلسل في وحدة البلازميد، فسترى هذه التعليقات التوضيحية في خريطة البلازميد.
    يوفر لك هذا الخيار أدوات NCBI Blast حيث يمكنك إجراء انفجار فيها LabCollector, مواقع خارجية
    يتيح لك هذا الخيار تحرير التسلسل. عندما تقوم بتحميل ملف مرتبط، يمكنك تحرير قواعد التسلسل.

    يمكنك رؤية علامة التبويب التحليل هنا. يمكن أن يوضح لك هذا قيمة التحليل على مدار أيام أو ساعات. يمكنك إضافة اختيارك من الحقول المخصصة هنا.
    * اقرأ قاعدة المعرفة لدينا على كيفية إضافة حقول مخصصة في علامة تبويب التحليل.
    يمكنك ربط السجل بدفتر المختبر الإلكتروني (ELN هي وظيفة إضافية في LabCollector). يمكنك ربط السجل بتجربة معينة تم إجراؤها باستخدام عنصر السجل. يساعدك هذا في الحصول على رابط للمكان الذي تم فيه استخدام عنصر السجل والنتائج التي تم الحصول عليها بعد ذلك.
    يوصلك هذا الرمز إلى الوظيفة الإضافية Workflow (WF). LabCollector. الوظيفة الإضافية WF هي الوظيفة التي يمكنك من خلالها إنشاء مخطط انسيابي للعملية الخاصة بك حيث تتطلب كل خطوة التحقق من صحة المشرف. إذا كان السجل قيد الاستخدام في وظيفة WF الإضافية، فستتمكن من رؤية حالته في WF هنا.
  • E. هنا يمكنك البحث عن الاشعال في وحدة الاشعال التي تهجين (الاقتران التكميلي للحمض النووي الريبي النووي/الحمض النووي الريبي) مع نيوكليوتيدات معينة من البلازميد عند النهاية 3′. يمكنك اختيار عدد النيوكليوتيدات التي تريد البحث عنها عن الاشعال. عندما تنقر على "فعل"، سيفتح المتصفح وحدة البادئات ويعرض لك قائمة البادئات التكميلية.
  • F. هنا يمكنك رؤية جميع الروابط التي قمت بإنشائها للسجل. هذه الروابط مخصصة للسجلات الأخرى في الوحدات الأخرى في LabCollector. على سبيل المثال، إذا كان لديك بلازميد لسلالة بكتيرية معينة. ثم يمكنك توصيل سجل البلازميد من وحدة البلازميد بالسجل البكتيري في وحدة السلالات والخلايا. يمكنك إضافة رابط من LabCollector من خلال النقر على خيار "إضافة رابط" ومن خلال النقر على خيار "فتح Treeview" يمكنك رؤية الروابط المرتبطة بالسجلات. 

مواضيع ذات صلة: