كيفية إنشاء ملف بيان عينة PCR باستخدام الوظيفة الإضافية لفرز الأنبوب؟ - LabCollector

البحث في قاعدة المعرفة عن طريق الكلمات الرئيسية

أنت هنا:
← جميع المواضيع
ملخص:

على جهاز PCR الخاص بك، تحتاج إلى تحديد خريطة اللوحة للتأكد من تحديد مكان العينات بشكل صحيح. اعتمادا على هذا، بعد تشغيل PCR سيتم إنشاء ملف النتيجة لكل عينة. لتبسيط هذه العملية، يمكنك إنشاء ملف بيان نموذجي يحتوي على خريطة اللوحة لعينات PCR المراد تشغيلها، وذلك باستخدام الوظيفة الإضافية لفرز الأنبوب.

يرجى اتباع الخطوة التالية لإنشاء ملف البيان النموذجي:

1. قم بتحميل ملف القالب النموذجي

2. إنشاء ملف البيان النموذجي

  • أ. استخدام خريطة الصندوق/اللوحة في التخزين.
  • ب. استخدام تلقي العينات

1. قم بتحميل ملف القالب النموذجي

  • في الوظيفة الإضافية لفرز الأنبوب، يتعين عليك الانتقال إلى "الإعداد" ثم "إدارة القوالب".
  • هنا يمكنك تحميل ملف CSV أو TXT للقالب الخاص بك. 

  • نصائح / تلميحات
    سوف تجد القالب للتشغيل من جهاز PCR الخاص بك. إذا لزم الأمر، يمكننا مساعدتك في تعديل القالب وفقًا لمتطلباتك.
  • يمكنك أيضًا النقر فوق خيار "البحث عن مساعدة" لرؤية الخيارات لإنشاء ملف بيان نموذجي. ستظهر لك نافذة منبثقة تسمح لك بمعرفة العلامات التي يمكنك استخدامها في نموذج ملف البيان الخاص بك.
  • سيحتوي هذا الملف الذي تم تحميله على معلومات مثل المثال الموجود في الصورة أدناه. سيحدد عمود الموضع موضع العينات في اللوحة. ستعتمد الأعمدة المتبقية على بروتوكول PCR ومتطلبات جهازك.
    يمكنك فتح الملف بتنسيق CSV إذا أردت، ولكنك تحتاج إلى تحديد ملف CSV إذا كنت تريد رؤيته بالتنسيق أدناه.
    *يرجى قراءة قاعدة المعرفة الخاصة بنا على كيفية تحديد CSV.

  • عندما يكون لديك نسخ مكررة، يمكنك تكرار موضع البئر. كما تلاحظ في الصورة المثال أعلاه. 
  • سيتم أخذ الموضع في علامات التجزئة هذه تلقائيًا من LabCollector نظام التخزين. سيتم شرح هذا الجزء في القسم التالي.
  • بمجرد قيامك بتحديث القالب وتحميله في فارز الأنبوب، يمكنك بسهولة استخدام هذا القالب لجميع عينات التشغيل التي تقوم بها في PCR الخاص بك.
  • يمكنك تحميل عدة قوالب وأحجام مختلفة من PCR مثل 96 أو 384، وكذلك دمج اللوحات باستخدام فارز الأنبوب.

2. إنشاء ملف البيان النموذجي

أ. استخدام خريطة الصندوق/اللوحة في التخزين

  • In LabCollector تخزين يمكنك إنشاء صناديق أو لوحات تحتوي على عينات في مواضع محددة ويمكنك استخدامها لإنشاء نماذج ملفات البيان. يمكنك إنشاء لوحات أو صناديق وإضافة عينات محددة في المواضع المعنية. 
    *من أجل إنشاء الصناديق أو اللوحات الخاصة بك، يرجى قراءة قاعدة المعرفة الموجودة على الموقع كيفيه التنصيب LabCollector تخزين.
    * يرجى الرجوع إلى قاعدة المعرفة لدينا على كيفية إنشاء صناديق النموذج.
  • نصائح / تلميحات
    يمكنك تسمية اللوحة وفقًا للتاريخ، لإبقائها منفصلة أو إنشاء موقع مزيف في المختبر لتخزين جميع اللوحات التي ستقوم بالبحث عنها، بحيث يمكنك حذفها بعد ذلك. 
    يمكن أن تحتوي الصناديق، على الرغم من وجودها في متصفح التخزين، على صناديق أو لوحات وهمية، فقط لإنشاء نماذج لملفات البيان. 
    يمكنك إنشاء نماذج لملفات البيان باستخدام نموذج الاستلام الإضافي أيضًا. يتم شرح العملية نفسها أدناه في القسم 2 الجزء ب.
  • بمجرد إنشاء الصندوق/اللوحة لـ PCR الخاص بك مع عينات في مواضع محددة، يمكنك أيضًا سد الآبار لعينات التحكم. بهذه الطريقة لن يتم تخزين أي عينات حتى ولو عن طريق الخطأ في تلك المواضع.
  • تحذير
    عندما تقوم بإنشاء نموذج للوحة PCR وتريد حظر الآبار، فسيكون هذا ممكنًا فقط مع نموذج BOX و ليس نموذج اللوحة.
  • لحظر الموضع، ما عليك سوى تحديد الخلايا من خلال النقر على + تسجيل وتحديث المربع مثل الخطوات الموضحة أدناه.
    إذا كنت تريد إزالة المناصب المحظورة، يمكنك أيضًا النقر فوق 3مسح جميع المناصب المحظورة وتحديث النموذج.
  • لإنشاء ملف بيان نموذجي باستخدام فارز الأنبوب، انتقل إلى الوظيفة الإضافية وفي الصفحة الرئيسية انقر على "إنشاء ملف بيان نموذجي". 
  • سترى الصفحة أدناه، حيث تحتاج إلى العثور على اسم الصندوق/اللوحة الذي قمت بإنشائه من قبل؛ يمكنك أيضًا إضافة عدة لوحات معًا من خلال النقر على علامة + الصغيرة. بمجرد تحديد المربع/اللوحة 
  • بمجرد النقر فوق التالي، سوف ترى المعلومات حول العينات داخل الصندوق أو اللوحة؛
    1. يمكنك تحديد نموذج ملف البيان باستخدام القائمة المنسدلة (التي قمت بتحميلها في القسم 1 أعلاه)،
    2. تسمح لك لوحات الخلط باختيار عدة لوحات ومزج موضع العينات فيها باستخدام فاصل من اختيارك. على سبيل المثال، عندما تخلط، سوف ترى
      Plate_1 الموضع A1 مع Plate_2 الموضع A1 أو 
      اللوحة_1 الموضع A2 مع اللوحة_2 الموضع A2، إلخ.
    3. يمكن أن يكون لديك رأس متوسط، أي إذا قمت بتحديد عدة لوحات دون خلطها، فسيتم تكرار اللوحات في القالب. تتيح هذه الخيارات وجود الرؤوس بين كل لوحة لفصلها عن بعضها البعض. إذا لم تقم بتحديد هذا الخيار، فلن تظهر رؤوس كل لوحة بين القوالب.
    4. وانقر على إنشاء ملف البيان.
      *ستبدو الأماكن الفارغة في الأطباق فارغة وسيكون هناك تعليق "لم يتم العثور عليه" أسفل رف/صينية العمود.
      سيتم ملء موضع علامة التصنيف بالاسم النموذجي في نموذج البيان النموذجي.
  • عند النقر فوق زر إنشاء ملف البيان، ستظهر لك نافذة منبثقة لحفظ الملف بتنسيق txt. يمكنك أيضًا فتح ملف txt أو تغيير اسم ملفك عن طريق تغيير الامتداد من .txt إلى .csv أثناء حفظ الملف.
  • هذا هو الملف الذي تحتاج إلى نقله يدويًا إلى جهاز PCR للتشغيل.

ب. استخدام تلقي العينات

  • يمكنك إنشاء صناديق/لوحات مباشرة داخل الوظيفة الإضافية لاستلام العينة.
  • في نموذج الاستلام، يمكنك تكوين الإعدادات لمشروعك. هنا يمكنك اختيار مربع النموذج الذي تقوم بإنشائه مشرف -> STORAGE -> ادارة المساحة-> عارضات ازياء.
    * يرجى قراءة قاعدة المعرفة لدينا على كيفية تكوين تلقي العينات.
  • يمكنك إنشاء حزمة يمكنك من خلالها إنشاء لوحة.
    *يرجى قراءة قاعدة المعرفة الخاصة بنا على  كيفية إنشاء الحزمة ومعالجتها.
    *يرجى قراءة قاعدة المعرفة الخاصة بنا على كيفية معالجة اللوحات في استقبال العينات.
  • يمكنك مسح عينات الباركود ضوئيًا لإضافة عينات في موضع البئر المختلف الذي تريده.
    *إذا كان لديك صندوق، أثناء إنشاء النموذج، يمكنك حظر مواضع عينات التحكم، إذا تم وضعها دائمًا في نفس المكان. تم شرحه في القسم 2 أعلاه.
  • يمكنك حفظ هذا الصندوق في غرفة ومعدات وهمية أو وهمية واستخدامه لإنشاء ملف البيان النموذجي. مثل العملية الموضحة في القسم 3 أ.
  • يجب بعد ذلك نقل نموذج ملف البيان الذي قمت بإنشائه إلى الجهاز يدويًا.

مواضيع ذات صلة: