Si të filloni me modulin Sekuenca? - LabCollector

Kërkoni bazën e njohurive me fjalë kyçe

Ti je ketu:
← Të gjitha temat
PËRMBLEDHJE:

Ju mund të kontrolloni bazën tonë të njohurive si duket në përgjithësi një modul.

Ndiqni këto hapa për të hyrë në modulin Sekuenca:

1. Hapni modulin Sekuenca

2. Hapni një procesverbal

1. Hapni modulin Sekuenca

  • 1. Kjo zonë do t'ju tregojë emër të modulit, të kërkim opsionet dhe ju lejojnë të shtoni një rekord i ri.
      - 1.1 Opsioni "Import GenBank Data" ju ndihmon të shtoni sekuencat direkt nga faqja e GenBank. *Kontrolloni KB-në tonë në si të importoni të dhëna në modulin plazmid, procesi për sekuencat shpjegohet në KB.
      - 1.2 Opsioni "Blast new sequence" ju ndihmon të Blast ose Megablast një sekuencë.
    * Kontrolloni bazën e njohurive tona si të kërkoni në LabCollector.
  • 2.   opsionet ju lejojnë të eksportoni të gjitha rezultatet tuaja të kërkimit në formatin HTML, CSV, EXCEL, PDF. Ju gjithashtu mund të zgjidhni fushën që dëshironi të eksportoni.
        Lexoni bazën tonë të njohurive se çfarë janë Fushat të dhëna.
        La opsioni ju lejon të mbani mend të gjitha regjistrimet që mund të përdoren më tej LabCollector.
  • 3. Të dhënat në përgjithësi nuk do të shfaqen në fillim. Duhet të klikoni në ikonën e kërkimit me një fushë kërkimi të zbrazët dhe do të mund të shihni të gjitha të dhënat.

2. Hapni një procesverbal

  • Kur klikoni në një rekord të caktuar, do të shihni opsionet e mëposhtme.

  • A. Emri i regjistrimit dhe detajet do të shfaqen këtu.
  • B. Opsionet për modifikimin e regjistrimit do të shfaqen këtu. Lexoni bazën tonë të njohurive opsionet e redaktimit të të dhënave.
  • C. Fushat që lidhen me regjistrimin do të shfaqen këtu. Lexoni bazën tonë të njohurive se çfarë janë fusha.
  • D. Ky shirit vertikal do t'ju ofrojë opsionet që lidhen me regjistrimin.
          

    		 Kjo ikonë do të shfaqë rekordin siç shihet në imazhin e mësipërm.
    Ky opsion do të shfaqë të gjitha të dhënat përkatëse. Për shembull, nëse keni mostra nga prindi dhe fëmija. Pastaj të gjitha mostrat e fëmijëve do të shfaqen këtu. ose nëse keni krijuar një lidhje për këtë regjistrim në module të tjera, atëherë të gjitha regjistrimet përkatëse do të jenë të dukshme këtu.
    Ky opsion ju tregon sekuencën (5′-3′) dhe hartën lineare të sekuencës me të gjitha shënimet në pamjen FASTA, formatin GB dhe pamjen e formatuar.
    Ky opsion ju ndihmon të menaxhoni shënimet e sekuencës. Për shembull, nëse është një sekuencë plazmidi, atëherë mund të shtoni shënime si disa vende kufizuese ose rajone promotore. Këtu mund të vëzhgoni fillimin/mbarimin dhe orientimin (mbrapa/përpara) të një shënimi specifik. Kjo do të thotë që kur importoni ose krijoni një plazmid, mund të zgjidhni cilat shënime dëshironi të shihni ose fshini. Nëse e importoni këtë sekuencë në modulin plazmid, do t'i shihni këto shënime në hartën plazmide.
    Ky opsion ju ofron mjete NCBI Blast ku mund të kryeni një BLAST në LabCollector, faqet e jashtme
    Ky opsion ju lejon të redaktoni sekuencën. Kur ngarkoni një skedar të lidhur, mund të modifikoni bazat e sekuencës.

    Ju mund të shihni skedën e analizës këtu. Kjo mund t'ju tregojë vlerën e analizës për ditë ose orë. Ju mund të shtoni zgjedhjen tuaj të fushave të personalizuara këtu.
    *Lexoni bazën tonë të njohurive si të shtoni fusha të personalizuara në skedën e analizës.
    Ju mund ta lidhni regjistrimin me fletoren elektronike të laboratorit (ELN është një shtesë në LabCollector). Ju mund ta lidhni regjistrimin me një eksperiment të veçantë që është kryer duke përdorur artikullin e regjistrimit. Kjo ju ndihmon të keni një lidhje me vendin ku është përdorur artikulli i regjistrimit dhe rezultatet e marra më pas.
    Kjo ikonë ju lidh me shtesën Workflow (WF). LabCollector. Shtesa WF është ajo ku mund të bëni një diagram të rrjedhës së procesit tuaj ku çdo hap kërkon vërtetimin e mbikëqyrësit. Nëse rekordi po përdoret në një shtesë WF, atëherë do të mund të shihni statusin e tij në WF këtu.
  • E. Këtu mund të kërkoni për primerët në modulin Primers që hibridizohen (çiftimi plotësues i ADN/ARN-së) me nukleotidin e caktuar të plazmidit në fundin 3'. Ju mund të zgjidhni numrin e nukleotideve që dëshironi të kërkoni për abetaret. Kur klikoni në "Do", shfletuesi do të hapë modulin e primerëve dhe do t'ju tregojë listën e primerëve plotësues.
  • F. Këtu mund të shihni të gjitha lidhjet që keni krijuar për regjistrim. Këto lidhje janë me regjistrimet e tjera në module të tjera në LabCollector. Për shembull, nëse keni një plazmid për një lloj specifik bakterial. Pastaj mund të lidhni rekordin e plazmidit nga moduli i plazmidit me rekordin bakterial në modulin e shtameve dhe qelizave. Mund të shtoni një lidhje nga LabCollector duke klikuar në opsionin "Shto një lidhje" dhe duke klikuar opsionin "Open Treeview" mund të shihni lidhjet e lidhura me të dhënat. 

Temat e ndërlidhura: