Pretražite bazu znanja po ključnoj riječi
SAŽETAK:
Pripremite svoj LabCollector baza podataka. Prije uvoza podataka morate konfigurirati modul iz kojeg uvozite podatke stvaranjem polja koja su vam potrebna i dodavanjem mogućih vrijednosti gdje je potrebno. Pogledajte naše KB-Stvori prilagođeno polje 5.2v za više informacija o stvaranju prilagođenih polja.
Osigurajte da vaš PHP ima povećana ograničenja: max_input_vars = 10000 ili više (vidi KB-Uvoz velikih datoteka).
Za uvoz podataka slijedite korake u nastavku:-
1. Kreiranje CSV polja za uvoz podataka
- Metoda 1: Dohvaćanje naziva polja
- Metoda 2: Dohvaćanje naziva zadanih i prilagođenih polja
2. Uvezite podatke u module
- A) Uvoz prilagođenog polja koje se povezuje s drugim modulima
- B) Uvoz podataka za oznaku genotipa
- C) Uvoz podataka za sekvence
- D) Uvoz podataka za kemijske strukture
- E) Uvoz podataka za dokumente i R&S
- F) Uvoz podataka za reagens i potrošni materijal
3. Pogreške prilikom uvoza podataka i njihovo rješenje
- Uvoz podataka radi samo sa CSV ili drugu tekstualnu datoteku s razdvojenim podacima (kliknite vezu da provjerite našu KB u razgraničiti podatke)
- Spremite CSV datoteku u txt (Tab) ili CSV (zarez ili točka-zarez kao razdjelnik). (Kliknite vezu da provjerite našu KB o tome kako uštedjeti CSV format)
- Možete pretvoriti svoje podatke u tekstualni format (tekstualna datoteka s DOS prijelomom retka) s graničnicima polja po vašem izboru iz programa Excel ili drugih vrsta baza podataka.
- Za Mac OS datoteke, spremite ih kao CSV za Windows format.
- Sva obavezna polja (sa *) prisutan u modulu u LabCollector treba uključiti. (Pogledajte sliku ispod pod Naziv polja–>Metoda 1)
- Nemojte spajati ćelije u CSV. One će se smatrati zasebnim ćelijama i stvarat će pogrešku
- U vašoj CSV datoteci, naslovi stupaca (nazivi stupaca) trebaju biti isti kao nazivi polja (ADMIN->PODACI->POLJA naručite i odaberite modul koji želite vidjeti ili promijenite redoslijed polja za). [Provjera/uređivanje Imena polja je opisan u nastavku] *Provjerite našu KB da vidite u čemu su polja LabCollector.
- Možete preuzeti nazive polja kako biste ih kopirali i zalijepili u svoju CSV datoteku (kao naslove stupaca) za uvoz. (prikazano u Odjeljak 2-Uvoz podataka u module u nastavku).
- Jedno ime polja treba biti jedan stupac.
- Minimalni zahtjevi za uvoz: Uvezeni podaci MORA SADRŽAVATI polja povezana s ime (ako ste svoj modul postavili s automatskim imenovanjem, ostavite stupac prazan) i Vlasnik (osim ako odaberete brisanje uvezenih vlasnika u naprednim opcijama – pogledajte drugu sliku u odjeljku A – ili ako modul ne koristi polje vlasnika kao u modulu Reagensi i potrošni materijal).
* za odlazak na Automatsko imenovanje idite na ADMIN ->OSTALO->OPCIJE SNIMANJA - Svaki uvezeni zapis može imati šifru projekta. Svaki projektni kod koji se koristi mora već postojati LabCollector za ispravan uvoz. (za upravljanje projektnim kodovima idite na ALATI->UPRAVLJAJTE KODOVIMA PROJEKTA)
- Prilagođena polja kao što su Prijenos baze podataka i Prijenos mape na disk ne može se uvesti. Koristite besplatni dodatak Prijenos datoteke prilagođenog polja.
- Datum mora biti oblikovan kao gggg-mm-dd ili yy-mm-dd, za više detalja pročitajte KB-vrijednost datuma oblikovanja.
1. Izrada CSV polja za uvoz podataka
- Za uvoz podataka prvo morate izraditi CSV datoteku.
- bilješke: Možete izraditi excel datoteku, a zatim je pretvoriti u CSV tako da je razgraničite.
*Pročitajte našu KB da biste saznali više kako razgraničiti vaš CSV za uvoz podataka. - Za izradu CSV-a potrebni su vam svi nazivi polja unutar vašeg modula. *Provjerite našu KB da vidite u čemu su polja LabCollector.
- Postoje 2 vrste polja LabCollector- zadano i prilagođeno.
- Zadana polja prisutna su prema zadanim postavkama u svim modulima.
- Prilagođena polja su ona koja možete izraditi prema svojim zahtjevima.
- Za uvoz podataka naziv stupca u CSV-u (ili excelu) trebao bi biti isti kao naziv polja za uvoz kako biste provjerili i promijenili redoslijed naziva polja, postoje tri metode. Svi su oni detaljno objašnjeni u nastavku.
-
Metoda 1: Dobivanje naziva polja
- Idite na modul po svom izboru i kliknite na "Dodaj novi zapis".
- Na primjer: – U prilagođenom modulu PCR kliknite na.
- Vidjet ćete sva imena polja. Ovo možete koristiti kao nazive stupaca u CSV-u kao što je prikazano u nastavku.
*Zapamtite da su obavezna polja važna za uvoz.
-
-
-
Metoda 2: Dohvaćanje naziva zadanih i prilagođenih polja
-
a) Možete pronaći Zadana imena polja odlaskom na ADMIN -> PODACI -> ZADANA POLJA za modul po vašem izboru.
-
b) Možete pronaći Nazivi prilagođenih polja odlaskom na ADMIN -> PODACI -> PRILAGODLJIVA POLJA za modul po vašem izboru.
- Prilagođena polja može kreirati bilo koji korisnik. Ispod je slika već kreiranih prilagođenih polja.
* Pogledajte našu KB da biste saznali više o tome kako stvoriti prilagođena polja.
-
2. Uvoz podataka u module
- Podatke općenito možete uvesti stvaranjem CSV-a s ispravnim nazivima polja modula i korištenjem funkcije uvoza podataka.
- U nastavku smo objasnili primjer s prilagođenim modulom pod nazivom "PCR".
*Provjerite našu KB na kako stvoriti prilagođeni modul. - Nakon što ste izradili svoj CSV sa svim detaljima (u donjem primjeru detalji za PCR modul), sada možete ići na LabCollector ADMIN->PODACI->UVOZ
- Prikazat će se donja stranica s nekoliko opcija.
Ne zaboravite kliknuti na "Napredne opcije” ako želite urediti posebne značajke. (zelena strelice)
- Ova vam opcija omogućuje preuzimanje naziva polja prisutnih u bazi podataka ili u LabCollector sustav.
– Možete preuzeti imena legendi ili imena baza podataka. Nazivi legendi i baza podataka prikazani su na slikama pod metodom 2.
- Naziv legende je naziv polja u zapisu modula, obrascu ili na popisu polja u područjima zadanih/prilagođenih polja koja dajete polju.
- Naziv baze podatakae je dostupno u područjima zadanih/prilagođenih polja i izuzeto je od posebnih znakova. - Možete prenijeti CSV datoteku ili kopirati i zalijepiti podatke iz CSV datoteke.
- Učitaj: Moraš razgraničiti podatke u svom CSV-u još jedan KB sa 'zarezom' (,) ili točkom i zarezom (;). Za engleski Microsoft office to je zarez (,), a za francuski Microsoft office točka i zarez (;).
- Kopiraj lijepljenje: Kopirajte područje CSV-a zajedno s naslovima stupaca i zalijepite ga. - U ovu opciju možete zalijepiti sadržaj CSV-a.
- Odaberite razdjelnik polja. To je znak koji koristimo za odvajanje (razgraničenje) vrijednosti jedne od druge.
– Ako kopirate/lijepite iz Excela, odaberite separator TAB.
– Ako ste učitali, onda je to zarez (za CSV na engleskom jeziku) i točka-zarez (za CSV na francuskom jeziku).
*Napredne opcije bit će prikazane ako je u gornjem desnom kutu označen okvir pored opcije "Napredna opcija". (zelene strelice na gornjoj slici) - Prema zadanim postavkama, znakovi su kodirani s ISO-8859-1. To vam omogućuje uvoz većine posebnih znakova kao što su slova s akutom, dijarezom, cirkumfleksom itd.
UTF-8 mora se koristiti za neki jezik (npr. kineski, grčki...) ako koristite softver koji vam omogućuje spremanje u CSV s UTF-8 kao kodiranjem (na primjer LibreOffice). - Možete odabrati jeste li stupce odvojili dvotočkom (:) ili tabulatorom (│)
- Ako vaša excel datoteka nema Vlasnika/Glavnog operatera/Odgovornu osobu/Autora (ovisno o modulu – moduli Reagensi i potrošni materijal i Adresar nemaju polja vlasnika), ili ako želite prebrisati ovo polje, odaberite jedno vlasnik na listi.
bilješke:*Administratori mogu uvoziti podatke pod bilo kojim imenom.
bilješke:*Osoblje može uvoziti samo pod svojim imenom.
* Pogledajte našu KB na različite dozvole na razini korisnika u LabCollector.
- .Na predlošku koji ste preuzeli u koraku 1, imat ćete pozvane stupce ID kutije/naziv kutije, položaj u kutiji, volumen.
bilješke:* U naslovu/zaglavlju stupca BOX ID/BOX naziv, korisnik treba odabrati da li će dodati informacije SAMO za jedan od njih, a NE za oba.
bilješke:*Ovo radi SAMO na glavnoj pohrani. Stoga neće raditi za modul reagensa i potrošnog materijala.- ID kutije: predstavlja ID kutije za pohranu i
- Naziv kutije: Predstavlja naziv kutije za pohranu.
- Pozicija u kutiji: predstavlja položaj cijevi u vašoj kutiji (koristeći koordinate ili numeričke položaje)
– Ako odaberete brojčane položaje 1,2,3, itd. za određivanje lokacija vaše kutije za pohranu, tada trebate označiti okvir kao ispod.
– Ako odaberete A1, B1, itd. za određivanje lokacija vaše kutije za pohranu, ostavite okvir neoznačen.
bilješke:* Ako trebate dodati više cijevi za odvajanje lokacija zarezom, pripazite da odaberete ispravan razdjelnik CSV-a tijekom uvoza datoteke. (korak 4 iznad)
- Ovdje možete označiti kako biste odabrali automatsko otkrivanje svih već popunjenih skladišnih pozicija, kako ne biste stavljali dvostruke unose.
- bilješke:* Ova se postavka također može aktivirati odlaskom na LABCOLLECTOR -> ADMIN -> OSTALO -> POSTAVITE OPĆE POSTAVKE, LOGO, NAZIVE MODULA ITD PODATKE -> VERIFIKACIJA UVOZNOG SKLADIŠTA
- Možete ga uvesti na listu čekanja. Što se tiče razine USER za uvoz podataka, administrator mora potvrditi podatke pod ADMIN -> PODACI -> LISTA ČEKANJA prije nego što se može učitati.
* Pogledajte našu KB na različite dozvole na razini korisnika u LabCollector. - Ako ste svoju opremu konfigurirali s opcijom automatskog pohranjivanja, ovom pohranjivanju možete pristupiti izravno ovdje. Nemate izbor kutije/lokacije, LabCollector automatski dodjeljuje svu pohranu.
- Ako je sve u redu kliknite na prijeđi na korak 2 i kliknite na potvrdu.
A) Uvoz prilagođenog polja koje se povezuje s drugim modulima
- Ako imate prilagođeno polje koje vam omogućuje umetanje veze na bilo koji modul, a želite uvesti podatke iz CSV-a i navesti modul koji trebate povezati sa svojim zapisom.
* Pogledajte našu KB da biste saznali više o tome kako stvoriti prilagođena polja.
*Provjerite našu KB da vidite u čemu su polja LabCollector.
*Provjerite našu KB da vidite u čemu su zapisi LabCollector. - Kada stvorite prilagođeno polje u modulu po svom izboru i želite da se poveže s drugim modulom. Da damo konkretan primjer, recimo da imate prilagođeni modul pod nazivom 'Pacijent' i želite povezati podatke o pacijentu s njegovim uzorcima u modulu 'Uzorak'.
- U gornjim scenarijima idite na ADMIN -> PODACI -> PRILAGODLJIVA POLJA -> NOVI TEREN & imat ćete 2 opcije za stvaranje takvog prilagođenog polja s vrstom polja
– 1) Veza: gdje možete povezati bilo koji zapis
– 2) Polje za automatsko dovršavanje: ovdje se možete povezati s modulom koristeći određeni naziv zapisa.
- Da bismo vam dali primjer, stvorili smo obje vrste polja i htjeli smo da se poveže s uzorkom pod nazivom "mBRS10000000_C015", što je specifični naziv zapisa.
– Dakle ili možeš (1-veza) dodajte poveznicu odabirom zapisa ili možete jednostavno (2-Polje za automatsko dovršavanje) upišite određeni naziv zapisa i on će automatski stvoriti vezu za vas.
- Recimo kada želite uvesti podatke za takvo polje.
- (1-veza) U svoj CSV možete dodati naziv zapisa koji će automatski povezati vašu uvezenu stavku s odgovarajućim modulom.
– Na primjer, ako želite povezati svoje zapise Primera s određenim zapisom u modulu uzorka. - (2-Polje za automatsko dovršavanje) U svoj CSV možete dodati naziv određenog zapisa.
B) Uvoz podataka za oznaku genotipa
- Moduli kao što su sojevi i stanice, životinje imaju standardno polje pod nazivom "genotip".
- Ovo se polje općenito aktivira odlaskom na ZADANA POLJA -> OPĆE OPCIJE -> SUSTAV OZNAKA GENOTIPOVA
- Samo trebate zapamtiti da oznake genotipa moraju biti odvojene razmakom.
C) Uvoz podataka za sekvence
- Možete uvesti datoteku sekvenci u formatu fasta. Na primjer kao ispod:
- >FN598458.1 Nekultivirani filofaringidni parcijalni gen 18S rRNA, klon GM2_C8
ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGCATATGCTTGTCTTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGTTA
TACAAGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATTTATTTGACGATTGCCTTATATGGATAA
CCGAGGGAAACTTCAGCTAATACATGCTTGTCATTTGACGTATTTATTAGTTCCACCGATGGCTTAGGCC
TTTTGATGATTCATGATAACTGATCGAAGCGATTTCGCTACGTCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTCT
GATTGTAGTGTATTGGACTACAATGGCTATTACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGA
GCCTGAGAAACGGCTACTATGTCTACGGATAGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTGTAAATCACAGAG - Nakon što se datoteka učita, odabirete vrstu DNA, RNA ili proteina. Također morate odabrati vlasnika nizova uvoza (prema zadanim postavkama, osoba povezana s prijavom na račun).
- Odaberite za nastavak na korak 2 kada sve bude u redu.
D) Uvoz podataka za kemijske strukture
- Da biste uvezli kemijske datoteke, možete ih uvesti u formatu MOL, SDF i CDX datoteke.
- Za MOL i SDF format datoteke, vaša datoteka može se formatirati s redovima zaglavlja. Također možete dodati oznake ako ih trebate.
- Za CDX datoteku možete učitati više datoteka ili ZIP datoteku.
E) Uvoz podataka za dokumente
- Dokumente možete učitati i koristeći CSV.
- Možete prenijeti CSV ili kopirati i zalijepiti stavke u CSV datoteku.
- Za kopiranje i lijepljenje ne zaboravite dodati stupac originalni_ime_datoteke koji sadrži točan naziv dokumenta koji želite uvesti u datoteku za uvoz ili zalijepite retke kao u donjem primjeru.
- Ne zaboravite dodati datotečni nastavak također pod original_file_name kao što se vidi na donjoj slici (npr. ako je pdf napišite pod originalnim nazivom IF_Microtubule. PDF).
- Zatim prenesite svoju datoteku za uvoz I sve dokumente koje želite uvesti (više datoteka kao u nastavku ili zip).
- Kada je sve u redu, možete prijeći na korak 2:
- Rezultat u modulu dokumenta nakon uvoza.
F) Uvoz podataka za reagense i potrošni materijal
- Modul reagensa i zaliha vrlo je koristan za izradu inventara za laboratorijske potrepštine i kemikalije ili stvaranje pufera itd.
- Pročitajte KB dalje kako uvesti podatke u modul reagensa i potrošnog materijala.
3. epogreške pri uvozu podataka i njihovo rješenje
- Prilikom uvoza podataka možete naići na mnogo grešaka.
- Molimo pročitajte našu KB da biste vidjeli na koje pogreške možete naići prilikom uvoza podataka i kako ih riješiti.
Povezane teme:
- Pogledajte naš KB-Stvori prilagođeno polje 5.2v za više informacija o stvaranju prilagođenih polja.
- Osigurajte da vaš PHP ima povećana ograničenja: max_input_vars = 10000ili više (vidi KB-Uvoz velikih datoteka).
- *Pročitajte našu KB da biste saznali više kako uzorci i povezano skladištenje.
- *Pročitajte našu KB da biste saznali više kako razgraničiti vaš CSV za uvoz podataka.
- *Pročitajte našu KB da biste saznali više kako riješiti pogreške tijekom uvoza podataka.
- *Pročitajte našu KB da biste saznali više kako uvesti i upravljati svojim reagensima i potrošnim materijalom v5.3.