Kako započeti s modulom Sequences? - LabCollector

Pretražite bazu znanja po ključnoj riječi

Ti si ovdje:
← Sve teme
SAŽETAK:

Možete provjeriti našu bazu znanja na kako modul općenito izgleda.

Slijedite ove korake za pristup modulu Sekvence:

1. Otvorite modul Sekvence

2. Otvorite zapis

1. Otvorite modul Sekvence

  • 1. Ovo područje će vam pokazati ime modula, traži opcije i omogućuju vam dodavanje a novi rekord.
      - 1.1 Opcija "Uvezi GenBank podatke" pomaže vam da dodate sekvence izravno sa stranice GenBank. *Provjerite naš KB na kako uvesti podatke u modul plazmida, postupak za sekvence objašnjen je u KB-u.
      - 1.2 Opcija "Razruši novu sekvencu" pomaže vam da raznesete ili Megablast sekvencu.
    * Provjerite našu bazu znanja kako tražiti u LabCollector.
  • 2,   opcije vam omogućuju izvoz svih rezultata pretraživanja u HTML, CSV, EXCEL, PDF format. Također možete odabrati polje koje želite izvesti.
        Pročitajte našu bazu znanja o tome što su polja i ploče.
        Korištenje električnih romobila ističe opcija vam omogućuje da zapamtite sve zapise koji se mogu dalje koristiti LabCollector.
  • 3. Zapisi se u početku uglavnom neće prikazati. Potrebno je kliknuti na ikonu pretraživanja s praznim poljem za pretraživanje i moći ćete vidjeti sve zapise.

2. Otvorite zapis

  • Kada kliknete na određeni zapis, vidjet ćete opcije u nastavku.

  • A. Ovdje će se pojaviti naziv zapisa i detalji.
  • B. Ovdje će se prikazati opcije za uređivanje zapisa. Pročitajte našu bazu znanja mogućnosti uređivanja zapisa.
  • C. Ovdje će se prikazati polja koja se odnose na zapis. Pročitajte našu bazu znanja o tome što su Polja.
  • D. Ova okomita traka pružit će vam opcije vezane uz zapis.
          

    		 Ova ikona će prikazati zapis kao što se vidi na gornjoj slici.
    Ova opcija će prikazati sve povezane zapise. Na primjer, ako imate uzorke roditelja i djeteta. Tada će svi uzorci djece biti prikazani ovdje. ili ako ste kreirali vezu za ovaj zapis u drugim modulima, tada će svi povezani zapisi biti vidljivi ovdje.
    Ova vam opcija prikazuje sekvencu (5′-3′) i linearnu kartu sekvence sa svim komentarima u FASTA prikazu, GB formatu i formatiranom prikazu.
    Ova vam opcija pomaže u upravljanju komentarima niza. Na primjer, ako se radi o nizu plazmida, tada možete dodati bilješke poput nekih restrikcijskih mjesta ili promotorskih regija. Ovdje možete vidjeti početak/kraj i orijentaciju (natrag/naprijed) određene napomene. To znači da kada uvozite ili stvarate plazmid, možete odabrati koje bilješke želite vidjeti ili izbrisati. Ako uvezete ovu sekvencu u modul plazmida, vidjet ćete ove bilješke na mapi plazmida.
    Ova vam opcija nudi NCBI Blast alate u kojima možete izvesti BLAST LabCollector, vanjske stranice
    Ova vam opcija omogućuje uređivanje niza. Kada učitate pridruženu datoteku, možete uređivati ​​baze sekvenci.

    Tablicu analize možete vidjeti ovdje. To vam može pokazati vrijednost analize tijekom dana ili sati. Ovdje možete dodati prilagođena polja po vašem izboru.
    *Pročitajte našu bazu znanja kako dodati prilagođena polja u karticu analize.
    Zapis možete povezati s elektroničkom laboratorijskom bilježnicom (ELN je dodatak u LabCollector). Zapis možete povezati s određenim eksperimentom koji je izveden pomoću stavke zapisa. To vam pomaže da imate vezu do mjesta gdje je stavka zapisa korištena i rezultata dobivenih nakon toga.
    Ova vas ikona povezuje s dodatkom Workflow (WF). LabCollector. WF dodatak je onaj u kojem možete napraviti dijagram toka svog procesa gdje svaki korak zahtijeva potvrdu nadzornika. Ako se zapis koristi u WF dodatku, ovdje ćete moći vidjeti njegov status u WF-u.
  • E. Ovdje možete pretraživati ​​početnice u modulu Primeri koji hibridiziraju (komplementarno uparivanje DNA/RNA) s određenim nukleotidom plazmida na 3′ kraju. Možete odabrati broj nukleotida koje želite pretraživati ​​za početnice. Kada kliknete na "Do", preglednik će otvoriti modul početnih razreda i pokazati vam popis komplementarnih početnih razreda.
  • F. Ovdje možete vidjeti sve poveznice koje ste izradili za evidenciju. Ove veze su na druge zapise u drugim modulima u LabCollector. Na primjer, ako imate plazmid za određeni bakterijski soj. Zatim možete povezati plazmidni zapis iz plazmidnog modula s bakterijskim zapisom u modulu sojeva i stanica. Možete dodati vezu iz LabCollector klikom na opciju “Dodaj poveznicu” i klikom na opciju “Otvori stablo” možete vidjeti poveznice povezane sa zapisima. 

Povezane teme: