Kuidas luua PCR näidismanifesti faili torusorteerija lisandmooduli abil? - LabCollector

Otsige teadmistebaasist märksõna järgi

Sa oled siin:
← Kõik teemad
KOKKUVÕTE:

PCR-seadmes peate määrama plaadi kaardi, et tagada proovide asukoha õige nimetus. Olenevalt sellest genereeritakse pärast PCR-i käitamist iga proovi jaoks tulemuste fail. Selle protsessi lihtsustamiseks saate meie torusorteerija lisandmooduli abil luua manifesti näidisfaili, millel on käitatavate PCR-proovide plaadikaart.

Järgige allolevat sammu ja looge manifesti näidisfail:

1. Laadige üles näidismalli fail

2. Genereeri manifestifaili näidis

  • A. Kasti/plaadikaardi kasutamine rakenduses Storage.
  • B. Proovi vastuvõtmise kasutamine

1. Laadige üles näidismalli fail

  • Torusorteerija lisandmoodulis peate minema "Seadistamine" ja seejärel "Halda malle".
  • Siin saate oma malli jaoks üles laadida CSV- või TXT-faili. 

  • Näpunäiteid/näpunäiteid
    Käitamise malli leiate oma PCR-seadmest. Vajadusel saame aidata teil malli vastavalt teie vajadustele kohandada.
  • Samuti võite klõpsata suvandil „Leia abi”, et näha manifesti näidisfaili loomise valikuid. See kuvab teile hüpikakna, mis võimaldab teil näha, milliseid silte saate manifesti näidisfailis kasutada.
  • See üleslaaditud fail sisaldab teavet nagu alloleval pildil olev näide. Asendiveerg määrab proovide asukoha plaadil. Ülejäänud veerud sõltuvad PCR-protokollist ja teie MACHINE'i nõuetest.
    Soovi korral saate faili avada CSV-vormingus, kuid kui soovite näha seda allolevas vormingus, peate CSV-faili piiritlema.
    *Palun lugege meie teadmistebaasi kuidas CSV-d piiritleda.

  • Kui teil on duplikaadid, saate kaevu asukohta korrata. Nagu näete ülaltoodud näitepildil. 
  • Nende räsimärgendite positsioon võetakse automaatselt asukohast LabCollector salvestussüsteem. Seda osa selgitatakse järgmises jaotises.
  • Kui olete malli värskendanud ja torusorteerijasse üles laadinud, saate seda malli hõlpsalt kasutada kõigi PCR-i proovide jaoks.
  • Saate üles laadida mitu malli ja erineva suurusega PCR-i (nt 96 või 384) ning liita plaate torusorteri abil.

2. Genereeri manifestifaili näidis

A. Kasti/plaadikaardi kasutamine rakenduses Storage

  • In LabCollector salvestusruumis saate luua kaste või plaate kindlates positsioonides olevate näidistega ja saate neid kasutada manifesti näidisfailide loomiseks. Saate luua taldrikuid või karpe ja lisada vastavatesse kohtadesse konkreetseid näidiseid. 
    *Kastide või plaatide loomiseks lugege teabebaasi kuidas seadistada LabCollector Ladustamine.
    *Palun vaadake meie teadmistebaasi aadressil kuidas luua mudelkaste.
  • Näpunäiteid/näpunäiteid
    Saate anda plaadile nime kuupäeva järgi, hoida need eraldatuna või luua laboris võltsitud asukoha, et salvestada kõik plaadid, mida kavatsete kasutada, et saaksite need pärast kustutada. 
    Hoolimata sellest, et salvestusbrauseris võivad kastidel olla kujuteldavad kastid või plaadid, mis on mõeldud ainult manifesti näidisfailide loomiseks. 
    Näidismanifestifaile saate luua ka näidisvastuvõtu lisandmooduli abil. Sama protsessi selgitatakse allpool jaotises 2, osa B.
  • Kui olete loonud oma PCR jaoks kasti/plaadi kindlates kohtades olevate proovidega, blokeerite ka kontrollproovide süvendid. Nii ei jää proovid nendesse kohtadesse isegi kogemata.
  • Hoiatus
    Kui loote PCR-i jaoks plaadi mudeli ja soovite reservuaarid blokeerida, on see võimalik ainult mudeliga BOX ja mitte plaadi mudel.
  • Positsiooni blokeerimiseks peate lihtsalt valima lahtrid, klõpsates +-märgil, ja värskendama kasti nagu allpool kirjeldatud samme.
    Kui soovite eemaldada blokeeritud positsioonid, võite klõpsata ka käsul 3Tühjenda kõik blokeeritud positsioonid ja värskendage mudelit.
  • Näidismanifestifaili loomiseks torusorteerija abil minge lisandmoodulisse ja klõpsake avalehel nuppu „Loo manifesti näidisfail”. 
  • Näete allolevat lehte, kust peate leidma kasti/plaadi nime, mille olete varem loonud; Saate isegi mitu plaati kokku lisada, klõpsates väikesel + märgil. Kui olete kasti/plaadi välja valinud 
  • Kui klõpsate järgmisele, näete kasti või plaadi sees teavet näidiste kohta;
    1. saate valida manifesti näidisfaili rippmenüüst (see, mille laadisite üles ülaltoodud jaotises 1),
    2. Segaplaadid võimaldab valida mitu plaati ja segada proovide asukohti neis enda valitud eraldajaga. Näiteks kui segate, näete
      Plaat_1 Asend A1 koos plaadiga_2 Asend A1 või 
      Plaat_1 positsioon A2 koos plaadiga_2 asend A2 jne.
    3. Teil võib olla vahepealne päis, mis tähendab, et kui valite mitu plaati neid segamata, korratakse plaate mallis. Need valikud võimaldavad päised olla iga plaadi vahel, et need üksteisest eraldada. Kui te seda valikut ei vali, ei kuvata iga plaadi päiseid mallide vahel.
    4. ja klõpsake nuppu Loo manifesti fail.
      *Plaadi tühjad kohad näevad tühjad ja nende veeruriiuli/aluse all on kommentaar “Ei leitud”.
      Räsimärgi positsioon täidetakse manifesti näidismalli näidise nimega.
  • Kui klõpsate nuppu Loo manifesti fail, näete hüpikakent faili txt-vormingus salvestamiseks. Samuti saate txt-faili avada või faili nime muuta, muutes faili salvestamise ajal laiendi .txt laiendiks .csv.
  • See on fail, mille peate käivitamiseks käsitsi PCR-seadmesse üle kandma.

B. Proovi vastuvõtmise kasutamine

  • Saate luua kaste/plaate otse näidise vastuvõtmise lisandmooduli sees.
  • Näidisvastuvõtmisel saate konfigureerida oma projekti sätteid. Siin saate valida mudelikasti, mille loote ADMIN -> STORAGE -> HALDA SALVELU-> MUDELID.
    *Palun lugege meie teadmistebaasi kuidas konfigureerida proovi vastuvõtmist.
  • Saate luua paketi, milles saate luua plaadi.
    *Palun lugege meie teadmistebaasi  kuidas paketti luua ja seda töödelda.
    *Palun lugege meie teadmistebaasi kuidas plaate proovide vastuvõtmisel töödelda.
  • Saate skannida proovide vöötkoodi, et lisada proove erinevatesse kaevudesse, mida soovite.
    *Kui sul on kast, siis saad mudeli tegemisel blokeerida kontrollnäidiste asukohad, kui need on alati samasse kohta pandud. Selgitatud ülaltoodud jaotises 2.
  • Saate selle kasti salvestada kujuteldavasse või võltsitud ruumi ja seadmetesse ning kasutada seda manifesti näidisfaili loomiseks. Nagu jaotises 3 A kirjeldatud protsess.
  • Seejärel tuleb loodud manifesti näidisfail käsitsi masinasse üle kanda.

Seotud teemad: