Kaip pradėti nuo Sequences modulio? - LabCollector

Ieškokite žinių bazės pagal raktinį žodį

Tu esi čia:
← Visos temos
SANTRAUKA:

Galite patikrinti mūsų žinių bazę kaip apskritai atrodo modulis.

Norėdami pasiekti sekų modulį, atlikite šiuos veiksmus:

1. Atidarykite Sequences modulį

2. Atidarykite įrašą

1. Atidarykite Sequences modulį

  • 1. Ši sritis parodys jums pavadinimas modulio, search parinktys ir leidžia pridėti a naujas įrašas.
      - 1.1 Parinktis „Importuoti GenBank duomenis“ padeda jums pridėti sekas tiesiai iš „GenBank“ svetainės. *Patikrinkite mūsų KB kaip importuoti duomenis į plazmidės modulį, sekų procesas paaiškintas KB.
      - 1.2 Parinktis „Blast nauja seka“ padeda susprogdinti arba „Megablast“ seką.
    * Patikrinkite mūsų žinių bazę kaip ieškoti LabCollector.
  • 2,   parinktys leidžia eksportuoti visus paieškos rezultatus HTML, CSV, EXCEL, PDF formatu. Taip pat galite pasirinkti lauką, kurį norite eksportuoti.
        Kas yra, skaitykite mūsų žinių bazėje laukai ir įrašai.
        Šios parinktis leidžia įsiminti visus įrašus, kuriuos galima naudoti toliau LabCollector.
  • 3. Iš pradžių įrašai paprastai nebus rodomi. Turite spustelėti paieškos piktogramą su tuščiu paieškos laukeliu ir galėsite matyti visus įrašus.

2. Atidarykite įrašą

  • Kai spustelėsite konkretų įrašą, pamatysite toliau pateiktas parinktis.

  • A. Čia bus rodomas įrašo pavadinimas ir informacija.
  • B. Čia bus rodomos įrašo redagavimo parinktys. Skaitykite mūsų žinių bazę įrašų redagavimo parinktys.
  • C. Čia bus rodomi su įrašu susiję laukai. Kas yra, skaitykite mūsų žinių bazėje srityse.
  • D. Šioje vertikalioje juostoje rasite su įrašu susijusias parinktis.
          

    Ši piktograma parodys įrašą, kaip parodyta aukščiau esančiame paveikslėlyje.
    Ši parinktis parodys visus susijusius įrašus. Pavyzdžiui, jei turite tėvų ir vaikų pavyzdžius. Tada čia bus rodomi visi vaikų pavyzdžiai. arba jei šiam įrašui sukūrėte nuorodą kituose moduliuose, tada visi susiję įrašai bus matomi čia.
    Ši parinktis rodo seką (5′-3′) ir tiesinį sekos žemėlapį su visomis anotacijomis FASTA rodinyje, GB formatu ir formatuotu rodiniu.
    Ši parinktis padeda tvarkyti sekos komentarus. Pavyzdžiui, jei tai yra plazmidės seka, galite pridėti anotacijų, pavyzdžiui, kai kurias restrikcijos vietas arba promotoriaus sritis. Čia galite stebėti konkretaus komentaro pradžią / pabaigą ir orientaciją (atgal / pirmyn). Tai reiškia, kad importuodami arba kurdami plazmidę galite pasirinkti, kurias pastabas norite matyti arba ištrinti. Jei importuosite šią seką į plazmidės modulį, šias anotacijas matysite plazmidės žemėlapyje.
    Ši parinktis siūlo NCBI Blast įrankius, kuriuose galite atlikti BLAST LabCollector, išorinės svetainės
    Ši parinktis leidžia redaguoti seką. Kai įkeliate susietą failą, galite redaguoti sekos pagrindus.

    Analizės skirtuką galite pamatyti čia. Tai gali parodyti analizės vertę per dienas ar valandas. Čia galite pridėti pasirinktus pasirinktinius laukus.
    *Perskaitykite mūsų žinių bazę kaip pridėti pasirinktinius laukus analizės skirtuke.

    Įrašą galite susieti su Elektroninės laboratorijos užrašų knygele (ELN yra priedas LabCollector). Galite susieti įrašą su konkrečiu eksperimentu, kuris buvo atliktas naudojant įrašo elementą. Tai padeda turėti nuorodą, kur buvo panaudotas įrašo elementas ir vėliau gauti rezultatai.
    Ši piktograma sujungia jus su darbo eigos (WF) priedu LabCollector. WF priedas yra tas, kuriame galite sudaryti savo proceso schemą, kurioje kiekvienas veiksmas reikalauja vadovo patvirtinimo. Jei įrašas naudojamas WF priede, čia galėsite matyti jo būseną WF.
  • E. Čia galite ieškoti pradmenų modulyje Primers, kurie hibridizuojasi (papildomas DNR/RNR poravimas) su tam tikru plazmidės nukleotidu 3′ gale. Galite pasirinkti nukleotidų, kuriuose norite ieškoti pradmenų, skaičių. Kai spustelėsite „Do“, naršyklė atidarys pradmenų modulį ir parodys papildomų pradmenų sąrašą.
  • F. Čia galite pamatyti visas nuorodas, kurias sukūrėte įrašui. Šios nuorodos yra į kitus įrašus kituose moduliuose LabCollector. Pavyzdžiui, jei turite tam tikros bakterijų padermės plazmidę. Tada galite prijungti plazmidės įrašą iš plazmidės modulio prie bakterijų įrašo padermėse ir ląstelėse modulio. Galite pridėti nuorodą iš LabCollector spustelėję parinktį „Pridėti nuorodą“ ir paspaudę „Atidaryti medžio peržiūrą“ galite pamatyti su įrašais susietas nuorodas. 

Susijusios temos: