Tėvystės ir santykių genetinio tyrimo procesas gali būti efektyvesnis naudojant mūsų LSM-Add on , kuris užtikrina mėginio/tyrimo paruošimo ir analizės proceso automatizavimą bei suteikdama patogią sąsają rezultatų analizei, LSM leidžia atlikti tėvystės genetinį tyrimą padidintu tikslumu, greičiu ir efektyvumu.

Mėginių genetinė analizė gali būti atliekama naudojant įvairius metodus, įskaitant PGR (polimerazės grandininę reakciją), RFLP (restrikcijos fragmento ilgio polimorfizmą) arba naujos kartos sekos nustatymą (NGS). Metodo pasirinkimas priklausys nuo norimo tikslumo lygio ir jūsų laboratorijoje turimų išteklių, kad ir kokį metodą pasirinktumėte, mūsų LSM priedas jums padės, nes jis gali sklandžiai integruoti su bet kokia mašina/instrumentu, kurį gali turėti jūsų laboratorija.

Šioje žinių bazėje žingsnis po žingsnio paaiškinsime, kaip sėkmingai atlikti tėvystės / santykių testą naudojant LSM:

1. Sukurkite darbą LSM
2. Įveskite paciento įrašus
3. Norėdami įvesti analizės rezultatus, naudokite analizatoriaus priedą
4. Atsisiųskite ataskaitą
5. Pavyzdys

Žingsnis 1: Sukurkite darbą LSM

Pirmas žingsnis – sukurti darbo vietą LSM. Norėdami tai padaryti, tiesiog atlikite toliau nurodytus veiksmus.

• Atviras LabCollector ir eikite į LSM priedą
• Spustelėkite "darbas“ esantį viršutiniame dešiniajame kampe, tada „Pridėti darbą“ išskleidžiamajame meniu, kad sukurtumėte naują darbą.
• Pasirinkite "Tėvystės/santykių testas“. Atminkite, kad visada galite sukurti modelį, skirtą bet kokio tipo testams. Norėdami tai padaryti, tiesiog eikite į Administratorius -> Parinktys -> Modeliai (kaip parodyta žemiau esančioje ekrano kopijoje).

• Tada galite įvesti modelio pavadinimą, jo aprašymą, numatytąjį pavyzdžio tipą ir pasirinkti pavyzdžio / užduoties parametrus, kuriuos norite rodyti pavyzdžio / darbo formoje. Baigę spustelėkite „pateikti“, tada eikite į Administratorius -> Sąranka -> Darbo užklausosIr paspauskite Įgalinti modelius (kaip parodyta žemiau).

• Tada sukurti modeliai bus rodomi tiesiogiai darbas išskleidžiamasis meniu.

• Pasirinkę atitinkamą darbą, kurį norite sukurti, tiesiog užpildykite visus reikalingus duomenis, tokius kaip darbo numeris, darbo data, aprašymas, užsakovo vardas ir kita reikalinga informacija.

Žingsnis 2: Įveskite paciento įrašus

• Sukūrę užduotį, kitas veiksmas – įvesti atitinkamus paciento įrašus (šį veiksmą taip pat galite atlikti prieš kurdami užduotį). Pirmiausia įsitikinkite, kad sukuriate kiekvieno paciento įrašus atitinkamoje ribose LabCollector modulis.
• Pavyzdžiui, galite atidaryti paciento modulis ir pereikite prie naujo įrašo kūrimo spustelėdami mygtuką esantis viršutiniame dešiniajame kampe.

• Tada įveskite visą reikiamą informaciją apie kiekvieną pacientą, dalyvaujantį tėvystės / santykių teste, įskaitant tokią informaciją kaip vardas, gimimo data, lytis ir kiti svarbūs duomenys.
• Grįžkite į LSM ir susiekite ką tik sukurtus paciento įrašus su užduotimi, kurią anksčiau įtraukėte atlikdami 1 veiksmą, pasirinkdami juos atvejo įrašų sąraše (kaip parodyta toliau esančioje ekrano kopijoje).

• Iš anksto pasirinkite papildomus duomenis, pvz., „tariamų“ pacientų santykių tipą („tėvas“, „senelis“, „teta“, ...), jų etninę kilmę, imties tipą ir kt.

Žingsnis 3: Norėdami įvesti analizės rezultatus, naudokite analizatoriaus priedą

• Įvedę paciento įrašus, kitas veiksmas yra analizės rezultatams įvesti naudoti analizatoriaus priedą. Analizatoriaus priedas leidžia įvesti Excel arba CSV failus, sugeneruotus analizę atlikusio įrenginio. Norėdami naudoti priedą, atlikite šiuos veiksmus:
• Atidarykite analizatoriaus priedą LabCollector
• Pasirinkite atitinkamą aplanką, tada importuokite Excel arba CSV failą su analizės rezultatais.

• Tada „I-Collector“ automatiškai įves parametrų reikšmes į atitinkamus langelius, TP (išbandytas asmuo), R1 (susijęs 1)ir R2 (susijęs 2).

• „I-Collector“ taip pat patvirtins darbo procesą ir sugeneruos ataskaitą, kurią galėsite atsisiųsti PDF formatu.

Žingsnis 4: Atsisiųskite ataskaitą

Paskutinis veiksmas yra atsisiųsti ataskaitą, kurioje bus nurodyta santykių procentinė dalis ir visi kiti svarbūs rezultatai. Norėdami atsisiųsti ataskaitą, atlikite šiuos veiksmus:

• Spustelėkite krumpliaračio piktogramą šalia darbo, kurio ataskaitą norite atsisiųsti.
• Paspauskite "ataskaita"Skirtukas.
• Pasirinkite ataskaitos tipą, kurį norite atsisiųsti.
• Atsisiųskite ir peržiūrėkite ataskaitą.

Pavyzdys:

Norėdami geriau iliustruoti, kaip atlikti tėvystės / santykių testą naudojant LSM, panagrinėkime pavyzdį:

Tarkime, kad Džonas ir Marija yra tariami Džeko tėvai, o laboratorija gavo kiekvieno iš jų DNR mėginius. Vartotojas turi sukurti įrašus, skirtus Jonui, Marijai ir Džekui LabCollector, įskaitant vardą, pavardę, gimimo datą, lytį ir bet kokią kitą svarbią informaciją. Vartotojas taip pat turėtų susieti įrašus su LSM ir iš anksto pasirinkti tariamų santykių tipą, šiuo atveju tėvą ir motiną.

Kitas žingsnis – analizuoti DNR mėginius naudojant genetinį analizatorių ir sugeneruoti Excel/CSV failą su rezultatais. Tada vartotojas turėtų įkelti failą į analizatorių, o duomenys bus automatiškai įvesti į atitinkamus skirtukus / dėklus I-collector dėka.

Tarkime, kad laboratorija išanalizavo 15 lokusų ir rado šiuos alelius:

Sistema automatiškai apskaičiuos ryšio tarp Džeko ir Džono / Marijos tikimybę ir sugeneruos atitinkamą ataskaitą.

Tada vartotojas gali atsisiųsti ataskaitą, kurioje rodomas Džeko ir Džono/Marijos santykių procentas, kartu su kita svarbia informacija, tokia kaip analizuoti lokusai, rasti aleliai ir skaičiavimui naudojami statistiniai parametrai (pvz., alelių dažnis, Hardy- Weinbergo pusiausvyra ir kt.). Ataskaitoje taip pat gali būti bet kokių papildomų pastabų ar komentarų, kuriuos pridėjo naudotojas.