Pripravite se LabCollector zbirka podatkov. Pred uvozom podatkov morate konfigurirati modul, v katerega uvažate podatke, tako da ustvarite polja, ki jih potrebujete, in po potrebi dodate možne vrednosti. Oglejte si naše KB-Ustvari polje po meri 5.2v za več informacij o ustvarjanju polj po meri.
Zagotovite, da ima vaš PHP povečane omejitve: max_input_vars = 10000 ali več (glej KB-Uvoz velikih datotek).

Za uvoz podatkov sledite spodnjim korakom:-

1.Ustvarjanje polja CSV za uvoz podatkov

• 1. način: Pridobivanje imena polj
• 2. način: Pridobivanje imen privzetih polj in polj po meri

2. Uvozite podatke v module

• A) Uvoz polja po meri, ki se povezuje z drugimi moduli
• B) Uvoz podatkov za oznako genotipa
• C) Uvažanje podatkov za zaporedja
• D) Uvoz podatkov za kemijske strukture
• E) Uvoz podatkov za dokumente in R&S
• F) Uvoz podatkov za reagente in potrebščine

3. Napake pri uvozu podatkov in njihova rešitev

Pomembne točke, ki si jih morate zapomniti za uvozni podatkovni modul:

• Uvoz podatkov deluje samo s CSV ali drugo besedilno datoteko z ločenimi podatki (kliknite povezavo, da preverite našo KB v razmejitev podatkov)
• Shranite datoteko CSV v txt (Tab) ali CSV (vejica ali podpičje kot ločilo). (Kliknite povezavo, da preverite našo KB o tem, kako shraniti Format CSV)
• Svoje podatke lahko pretvorite v besedilno obliko (besedilna datoteka s prelomom vrstice DOS) z ločili polj po vaši izbiri iz Excela ali drugih vrst podatkovnih baz.
• Za datoteke Mac OS jih shranite kot CSV za format Windows.
• Vsa obvezna polja (s *) prisoten v modulu v LabCollector je treba vključiti. (Glejte spodnjo sliko pod Ime polja–>Metoda 1)
• Ne spajajte celic v CSV. Upoštevane bodo kot ločene celice in povzročile bodo napako
• V vaši datoteki CSV so naslovi stolpcev (imena stolpcev) mora biti enako kot imena polj (SKRBNIK->PODATKI->PODROČJA naročilo in izberite modul, ki ga želite videti, ali preuredite polja za). [Preverjanje/urejanje Imena polj je opisano spodaj] * Prosimo, preverite naš KB, da vidite v čem so polja LabCollector.
• Imena polj lahko prenesete, da jih kopirate in prilepite v datoteko CSV (kot naslove stolpcev), ki jih želite uvoziti. (prikazano v Razdelek 2-Uvoz podatkov v module spodaj).
• Eno ime polja mora biti en stolpec.
• Minimalne zahteve za uvoz: Uvoženi podatki MORA VSEBOVATI področja, povezana z Ime (če ste svoj modul nastavili s samodejnim poimenovanjem, pustite stolpec prazen) in Lastnik (razen če izberete prepisovanje uvoženih lastnikov v naprednih možnostih – glejte drugo sliko pod razdelkom A – ali če modul ne uporablja polja lastnika kot v modulu Reagent & Supplies).
  * za prehod na Samodejno poimenovanje pojdite na ADMIN ->DRUGO->MOŽNOSTI SNEMANJA
• Vsak uvožen zapis ima lahko kodo projekta. Vsaka uporabljena koda projekta mora že obstajati v LabCollector za pravilen uvoz. (za upravljanje projektnih kod pojdite na ORODJE->UPRAVLJAJTE PROJEKTNE KODE)
• Polja po meri, kot je npr Nalaganje baze podatkov in Nalaganje mape na disk ni mogoče uvoziti. Uporabite brezplačen dodatek Nalaganje datoteke polja po meri.
• Datum mora biti oblikovan kot llll-mm-dd ali ll-mm-dd, za več podrobnosti preberite Vrednost datuma oblikovanja KB.

1. Ustvarjanje polja CSV za uvoz podatkov

• Za uvoz podatkov morate najprej ustvariti datoteko CSV.
• Opombe: Ustvarite lahko datoteko excel in jo nato pretvorite v CSV tako, da jo ločite. 
  * Prosimo, preberite naš KB, če želite izvedeti več o kako razmejiti svoj CSV za uvoz podatkov.
• Če želite ustvariti CSV, potrebujete vsa imena polj znotraj vašega modula. * Prosimo, preverite naš KB, da vidite v čem so polja LabCollector.
• Obstajata 2 vrsti polj LabCollector- privzeto in po meri. 
• Privzeta polja so privzeto prisotna v vseh modulih. 
• Polja po meri so tista, ki jih lahko ustvarite glede na svoje zahteve.
• Za uvoz podatkov mora biti ime stolpca v datoteki CSV (ali excel). Enako kot ime polja, ki ga želite uvoziti, da preverite in preuredite imena polj, obstajajo trije načini. Vsi so podrobno razloženi spodaj.

  • Metoda 1: Pridobivanje imena polj

  • Pojdite na modul po vaši izbiri in kliknite »Dodaj nov zapis«.
  • Na primer: – V modulu po meri PCR kliknite na.
  • Videli boste vsa imena polj. To lahko uporabite kot imena stolpcev v CSV, kot je prikazano spodaj.
    *Ne pozabite, da so obvezna polja pomembna za uvoz.
    

• • 2. način: Pridobivanje imen privzetih polj in polj po meri

  • a) Najdete Privzeta imena polj , ki ga bo ADMIN -> PODATKI -> PRIVZETA POLJA za modul po vaši izbiri.
    

  • b) Najdete Imena polj po meri , ki ga bo ADMIN -> PODATKI -> POLJA PO MERI za modul po vaši izbiri.
    - Polja po meri lahko ustvari vsak uporabnik. Spodaj je slika iz že ustvarjenih polj po meri.
       * Za več informacij si oglejte našo KB kako ustvariti polja po meri.
    
    

2. Uvozite podatke v module

• Na splošno lahko podatke uvozite tako, da ustvarite CSV s pravilnimi imeni polj modula in uporabite funkcijo uvoza podatkov.
• Spodaj smo razložili primer z modulom po meri, imenovanim »PCR«.
  * Prosimo, preverite naš KB na kako ustvariti modul po meri.
• Ko ustvarite svoj CSV z vsemi podrobnostmi (v spodnjem primeru podrobnosti za modul PCR), lahko zdaj obiščete LabCollector ADMIN->PODATKI->UVOZ
  
• Spodnja stran bo prikazana z več možnostmi.
  Ne pozabite klikniti »Napredne možnosti”, če želite urediti posebne funkcije. (Zelene puščice)
  
• Ta možnost vam omogoča prenos imen polj, ki so v zbirki podatkov ali v LabCollector sistem.
  – Prenesete lahko imena legend ali imena baz podatkov. Legenda in imena baze podatkov so prikazana na slikah pod 2. metodo.
  - Ime legende je ime polja v zapisu modula, obrazcu ali na seznamu polj v območjih privzetih/po meri polj, ki jih dodelite polju.
  - Ime baze podatkove je na voljo v območjih privzetih polj/polj po meri in je izvzet iz posebnih znakov.
• Lahko naložite datoteko CSV ali kopirate in prilepite podatke iz datoteke CSV.
  - Naloži: Moraš razmejite podatke v vašem CSV še en KB z 'vejico' (,) ali podpičjem (;). Za angleški Microsoft office je vejica (,) in za francoski Microsoft office podpičje (;).
  - Kopiraj prilepi: Kopirajte območje CSV skupaj z naslovi stolpcev in ga prilepite.
• V to možnost lahko prilepite vsebino datoteke CSV.
• Izberite ločilo polj. To je znak, ki ga uporabljamo za ločevanje (ločevanje) vrednosti med seboj.
  – Če kopirate/prilepite iz Excela, izberite ločilo TAB.
  – Če ste naložili, je to vejica (za angleški jezik CSV) in podpičje (za francoski jezik CSV).
  *Napredne možnosti bodo prikazane, če je zgoraj desno označeno polje poleg možnosti »Napredna možnost«. (zelene puščice na zgornji sliki)
• Privzeto so znaki kodirani z ISO-8859-1. To vam omogoča uvoz večine posebnih znakov, kot so črke z resnico, akutom, diarezo, cirkumfleksom itd.
  UTF-8 je treba uporabiti za nekatere jezike (npr. kitajščino, grščino ...), če uporabljate programsko opremo, ki vam omogoča shranjevanje v CSV z UTF-8 kot kodiranjem (na primer LibreOffice).
• Izberete lahko, ali ste stolpce ločili z dvopičjem (:) ali tabulatorjem (│)
• Če vaša datoteka excel nima lastnika/glavnega operaterja/odgovorne osebe/avtorja (odvisno od modula – modula Reagenti & Supplies in Address Book nimata polj lastnika) ali če želite prepisati to polje, izberite eno lastnik na seznamu.
  Opombe:*Administratorji lahko uvozijo podatke pod poljubnim imenom.
  Opombe:*Osebje lahko uvaža samo pod svojim imenom.
  * Oglejte si naš KB na različna dovoljenja na ravni uporabnika v LabCollector.
  
• .Na predlogi, ki jo prenesete v 1. koraku, boste imeli poklicane stolpce ID škatle/ime škatle, položaj v škatli, prostornina.
  Opombe:* V naslovu stolpca/glavi BOX ID/BOX ime se mora uporabnik odločiti, ali bo dodal informacije SAMO za enega od njih in NE za oba.
  Opombe:*To deluje SAMO v glavnem pomnilniku. Zato ne bo deloval za modul reagentov in zalog.
  • ID škatle: predstavlja ID škatle za shranjevanje in
  • Ime škatle: Predstavlja ime škatle za shranjevanje.
  • Položaj v škatli: predstavlja položaj cevi v vaši škatli (z uporabo koordinat ali številskih položajev) 
    – Če izberete številske položaje 1,2,3 itd., da določite lokacije vaše škatle za shranjevanje, morate označiti polje, kot je spodaj.
    
    – Če izberete A1, B1 itd., da določite lokacije vaše škatle za shranjevanje, pustite polje nepotrjeno.
    Opombe:* Če morate dodati več cevi, da ločite lokacije z vejico, med uvozom datoteke pazite, da izberete pravilno ločilo CSV. (4. korak zgoraj)
• Tukaj lahko označite, da izberete samodejno zaznavanje že zapolnjenih skladiščnih mest, da ne bi vnesli podvojenih vnosov.
  - Opombe:* To nastavitev lahko aktivirate tudi tako, da obiščete LABCOLLECTOR -> ADMIN -> DRUGO -> NASTAVITE SPLOŠNE NASTAVITVE, LOGOTIP, IMENA MODULOV ITD PODATKE -> UVOZNO SKLADIŠČENJE PREVERJANJE
  
  
•  Lahko ga uvozite na čakalni seznam. Kar zadeva raven UPORABNIKA za uvoz podatkov, mora skrbnik potrditi podatke pod ADMIN -> PODATKI -> ČAKALNA LISTA preden ga je mogoče naložiti.
  * Oglejte si naš KB na različna dovoljenja na ravni uporabnika v LabCollector.
• Če ste svojo opremo konfigurirali z možnostjo samodejnega shranjevanja, lahko do tega pomnilnika dostopate neposredno tukaj. Nimate izbire škatle/lokacije, LabCollector samodejno dodeli ves prostor za shranjevanje.
• Če je vse v redu, kliknite nadaljujte s korakom 2 in kliknite potrdi.
  

A) Uvoz polja po meri, ki se povezuje z drugimi moduli

• Če imate polje po meri, ki vam omogoča vstavljanje povezave do katerega koli modula, in želite uvoziti podatke iz CSV ter določiti modul, ki ga morate povezati z vašim zapisom.
   * Za več informacij si oglejte našo KB kako ustvariti polja po meri.
  * Prosimo, preverite naš KB, da vidite v čem so polja LabCollector.
  * Prosimo, preverite naš KB, da vidite v čem so zapisi LabCollector.
• Ko ustvarite polje po meri v modulu po vaši izbiri in želite, da se poveže z drugim modulom. Če navedemo poseben primer, recimo, da imate modul po meri z imenom 'Pacient' in želite povezati podrobnosti o pacientu z njegovimi vzorci v modulu 'Vzorec'.
• V zgornjih scenarijih pojdite na ADMIN -> PODATKI -> POLJA PO MERI -> NOVO TEREN In imeli boste 2 možnosti za ustvarjanje takšnega polja po meri z vrsto polja
  – 1) Povezava: kjer lahko povežete poljuben zapis 
        
  – 2) Polje za samodokončanje: tukaj se lahko povežete z modulom z uporabo določenega imena zapisa.
       
• Za primer smo ustvarili obe vrsti polj in želeli smo, da se povežejo z vzorcem, imenovanim »mBRS10000000_C015«, ki je specifično ime zapisa. 
  – Torej lahko (1-povezava) dodate povezavo tako, da izberete zapis ali pa preprosto (2-samodejno izpolni polje) vnesite določeno ime zapisa in samodejno bo ustvaril povezavo za vas.
   
• Recimo, ko želite uvoziti podatke za takšno polje.
• (1-povezava) V svoj CSV lahko dodate ime zapisa ki bo vaš uvoženi predmet samodejno povezal z ustreznim modulom.
  – Na primer, če želite svoje zapise Primer povezati z določenim zapisom v vzorčnem modulu.
• (2-samodejno izpolni polje) V svoj CSV lahko dodate ime določenega zapisa.

B) Uvoz podatkov za oznako genotipa

• Moduli, kot so sevi in ​​celice, imajo živali privzeto polje, imenovano "genotip".
• To polje običajno aktivirate tako, da obiščete PRIVZETA POLJA -> SPLOŠNE MOŽNOSTI -> SISTEM OZNAČEVANJA GENOTIPOV 
• Zapomniti si morate le, da morajo biti oznake genotipa ločene s presledkom.

C) Uvažanje podatkov za zaporedja

• Datoteko sekvenc lahko uvozite v formatu fasta. Na primer kot spodaj:
• >FN598458.1 Nekultivirani filofaringidni ciliatni delni gen 18S rRNA, klon GM2_C8
  ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGCATATGCTTGTCTTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGTTA
  TACAAGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATTTATTTGACGATTGCCTTATATGGATAA
  CCGAGGGAAACTTCAGCTAATACATGCTTGTCATTTGACGTATTTATTAGTTCCACCGATGGCTTAGGCC
  TTTTGATGATTCATGATAACTGATCGAAGCGATTTCGCTACGTCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTCT
  GATTGTAGTGTATTGGACTACAATGGCTATTACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGA
  GCCTGAGAAACGGCTACTATGTCTACGGATAGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTGTAAATCACAGAG
• Ko je datoteka naložena, izberete vrsto DNA, RNA ali proteina. Izbrati morate tudi lastnika zaporedij uvoza (privzeto je oseba, povezana s prijavo v račun).
  
• Izberite za nadaljevanje na korak 2, ko je vse v redu.
  

D) Uvoz podatkov za kemijske strukture

• Če želite uvoziti kemične datoteke, jih lahko uvozite v obliki datotek MOL, SDF in CDX.
• Za format datoteke MOL in SDF je vaša datoteka lahko oblikovana z naslovnimi vrsticami. Dodate lahko tudi oznake, če jih potrebujete.
  
• Za datoteko CDX lahko naložite več datotek ali datoteko ZIP.
  

E) Uvoz podatkov za dokumente

• Dokumente lahko naložite tudi z uporabo CSV.
• Lahko naložite datoteko CSV ali kopirate in prilepite elemente v datoteko CSV.
• Za kopiranje in lepljenje ne pozabite dodati stolpca izvirno_ime_datoteke ki vsebuje natančno ime dokumenta, ki ga želite uvoziti v uvozno datoteko ali prilepite vrstice, kot je prikazano v spodnjem primeru.
• Ne pozabite dodati datotečne pripone tudi pod original_file_name, kot je prikazano na spodnji sliki (npr. če gre za pdf, pišite pod izvirnim imenom IF_Microtubule. Pdf).
• Nato naložite uvozno datoteko IN vse dokumente, ki jih želite uvoziti (več datotek, kot je spodaj, ali zip).
  
• Ko je vse v redu, lahko nadaljujete na 2. korak:
  
• Rezultat v modulu dokumenta po uvozu.
  

F) Uvoz podatkov za reagente in potrebščine

• Modul za reagente in zaloge je zelo uporaben za ustvarjanje popisa za laboratorijske zaloge in kemikalije ali ustvarjanje pufrov itd.
• Preberite KB naprej kako uvoziti podatke v modul reagenta in potrošnega materiala.

3. Enapake pri uvozu podatkov in njihova rešitev

• Pri uvozu podatkov lahko naletite na veliko napak.
• Za ogled preberite našo KB na katere napake lahko naletite pri uvozu podatkov in kako te napake odpraviti.

Povezane teme:

• Oglejte si našo KB-Ustvari polje po meri 5.2v za več informacij o ustvarjanju polj po meri.
• Zagotovite, da ima vaš PHP povečane omejitve: max_input_vars = 10000ali več (glej KB-Uvoz velikih datotek).
• * Prosimo, preberite naš KB, če želite izvedeti več o kako do vzorcev in povezanega shranjevanja.
• * Prosimo, preberite naš KB, če želite izvedeti več o kako razmejiti svoj CSV za uvoz podatkov.
• * Prosimo, preberite naš KB, če želite izvedeti več o kako odpraviti napake med uvozom podatkov.
• * Prosimo, preberite naš KB, če želite izvedeti več o kako uvoziti in upravljati svoj reagent in zaloge v5.3.