POVZETEK:

Molekularni urejevalnik je prisoten v modulu Kemija in ELN.

Z urejevalnikom kemije lahko ustvarite kemijsko strukturo in jo shranite kot zapis. Omogoča vam tudi urejanje strukture kemijske molekule, ki je že prisotna v kemijskem modulu.

v ELN (Electronic Lab Notebook) dodatek, lahko ga uporabite za izdelavo 2D kemičnih struktur, ki jih je mogoče preprosto vstaviti ELN 'vsebina' ali pa jo lahko shranite kot predlogo za kemijo v ELN.

Za uporabo urejevalnika kemijskih molekul sledite spodnjim korakom:

1. Urednik za kemijo

1.1. Kemijski modul

1.2. ELN

2. Orodja v urejevalniku kemije

1. Urednik za kemijo

• Kot je opisano v uvodu, lahko urejevalnik kemije najdete tako v modulih kemije kot v modulu ELN dodatka.

• 1.1. Kemijski modul

  • Urejevalnik kemije v kemijskem modulu lahko uporabljate na dva načina.
    • Prvi način je iti na a MODUL KEMIJA -> NOV REKORD -> MOLEKULARNI PODATKI -> STRUKTURA -> NARIŠI MOLEKULO.
      – Urejevalnik kemije bo odprl spodnjo stran, ki je podrobno opisana v razdelku 2.
      
      

    • Drugi način je, da greste na a MODUL KEMIJA -> UREJANJE ZAPISA (že obstaja) -> MOLEKULARNI PODATKI -> NARIŠI MOLEKULO.
      – Urejevalnik kemije bo odprl spodnjo stran, ki je podrobno opisana v razdelku 2.
      

• 1.2. ELN

  • Če želite preveriti privzeta polja za vsak modul, pojdite na DOMOV -> KNJIGA / POSKUS ALI STRAN (PO VAŠI IZBIRI) -> VSEBINA -> EDIT.
    

  • Ko kliknete ikono »Dodaj molekule in reakcije«, se odpre stran s spodnjimi možnostmi.
    

  • Morate klikniti možnost »Novo«, da odprete urejevalnik kemije, ki je opisan spodaj.

2. Orodja v urejevalniku kemije

• Možnost A: sredinsko platno

  • To je platno, kjer boste videli molekulo, ki jo ustvarjate.

• Možnost B: Zgornja orodna vrstica

• Tu so različne možnosti:
  • Možnosti razveljavitve in ponovitve za ponovno sledenje dejanj.
  • Da pripeljete/nastavite svojo molekulo na sredino platna. 
  • Preklopi oznake R/S. (S & R se uporabljata za poimenovanje enantiomerov kiralne spojine. Nanaša se na levoročnost-S ali desnoročnost-R molekule.)
    – Predstavljajte si na primer ogljikov atom s kiralnim središčem, vezanim na 4 atome.
    – Vsak atom, povezan s kiralnim atomom C, ima prednost, kjer je 1 najvišja in 4 najnižja.
    – Prednost je dana glede na atomsko število, višje kot je atomsko število, višja je prednost.
    

  • Ta možnost je, da počistite vse na platnu.
  • Ta možnost ustvari obliko Mol in Smiles za molekule. Lahko ga kopirate in shranite za prihodnjo uporabo.

    – Uvoz gumb omogoča lepljenje datotek MOL, SMILES ali InChI molekule. 
    – izvoz gumb omogoča kopiranje formata MOL ali SMILES molekule, ki ste jo ustvarili.
    – InChI (mednarodni kemijski identifikator); SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification je linearni zapis molekule); MOL (MDL Molfile vsebuje informacije o atomih, vezeh, povezljivosti in koordinatah molekule.) Spodnja slika na primer prikazuje molekulo benzena in različne formate, v katerih jo je mogoče predstaviti.
    

• • Ta možnost vam pove o programski opremi in njeni različici.
  • Ta možnost 2D upodobitve/čiščenja vam omogoča, da spremenite, kako je usmerjena vaša molekula.
    

  • Ta možnost iskanja po kemijskem slovarju vam pomaga uvoziti strukturo molekule. 
    – Uredite lahko tudi strukturo, ki ste jo uvozili.
    

• Možnost C: Prav orodna vrstica

• Tu so različne možnosti:
  • Izbira pravokotnika in lasa. To so različne vrste izbranih orodij.
    - Izbira pravokotnika: izberite atome in vezi s pravokotnim izbirnim območjem
    - Izberi laso: izberite atome in vezi tako, da prostoročno narišete izbirno območje
  • Izbiro lahko izbrišete z DEL tipko ali z orodjem za brisanje .
    
  •  Ta možnost naboja omogoča povečanje (+) ali zmanjšanje (-) naboja atomov.
  • Omogoča vam, da strukturi svoje molekule dodate izotop.
  • Fragmenti vam omogočajo, da imate vnaprej pripravljeno strukturo benzena , ciklopentan , ciklopropan , ciklobutan , cikloheksan , cikloheptan .
  • To omogoča ustvarjanje verige ogljikovih atomov.

• Možnost D: levo orodna vrstica

  • Ta orodna vrstica vam omogoča tudi izbiro med številnimi elementi, ki jih lahko uporabite za ustvarjanje novega elementa ali spreminjanje obstoječega.
  • Atomi, ki so prisotni, so vodik, žveplo, fosfor, florin, kisik, dušik in ogljik.
    
  • Tukaj lahko dodate element po meri. Element, ki ni definiran, skupaj z vodikovimi atomi, številom težkih atomov (D) ali številom obročnih atomov (R).
    – Težki atomi so na primer C, N, O, S, F, Cl, Br itd.
    – Atomi obroča so tisti, ki sestavljajo del obroča.
  • Orodna vrstica ponuja različne vrste vezi enojne, dvojne, trojne, gor.
    

• Možnost E: Dodaj

  • Ko končate z ustvarjanjem spojine, jo lahko dodate in vključite v svojo reakcijo ter vstavite v svojo vsebino v ELN knjiga, poskus ali kemija.
  • Lahko ga tudi shranite kot predlogo, kot je prikazano v spodnjem videu.
    * Za dostop do kemijskih predlog v ELN lahko greš na ADMIN -> PREDLOGA -> OGLED/UREJANJE PREDLOGE REAKCIJE.
    * Ne pozabite, da si lahko ogledate in uredite reakcijsko predlogo, odvisno od dovoljenj, ki vam jih je podelil superskrbnik ali skrbnik. Če želite izvedeti več o tem, preverite našo KB ELN dovoljenja.
     

Povezane teme:

• Preberite naše priročnik vklopljen LabCollector.
• Preverite naš KB na ELN predlogo.
• Preberite o tem, kako ELN Potek dela.
• Več o kako ustvariti knjigo, poskus in stran
• Preberite naše KB, da boste vedeli, kako uporabljati urejevalnik obogatenega besedila in ELN.
• Preverite našo KB za branje o tem, kaj je v poskusu in ELN.
• Preberi kaj je v knjigi in ELN.