Institut de biologie
de Lille

Objectif

L'unité UMR 8199 Génomique et Maladies Métaboliques est dirigée par le Professeur Froguel. Cette unité compte environ 60 personnes. L'UMR 8199 est équipée de plusieurs nouvelles générations de séquenceurs et d'une plateforme de puces à ADN. La recherche se concentre sur deux grands domaines : l’obésité et le diabète.

"Notre projet qui nous a décidé à acquérir un LIMS était d’identifier des variantes de codage rares associées au risque de diabète de type 2 et d’obésité. Nous avons également souhaité caractériser l'effet fonctionnel de ces variants sur la physiopathologie de ces maladies. À l’aide du séquençage de nouvelle génération (NGS), nous prévoyons d’analyser les régions codantes de 850 gènes candidats au diabète et à l’obésité chez plus de 10,000 5 personnes. Ce projet durera 2 ans avec un financement de sources publiques et industrielles. La phase de séquençage initiale durera XNUMX ans. Notre objectif en achetant un LIMS était l'acquisition d'un progiciel qui répond aux exigences de qualité et permet le suivi des échantillons, gestion des utilisateurs, des instruments, de l'inventaire, du matériel utilisé, des documents et fichiers informatiques. »

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Solution

"Nous avons apprécié de nombreuses fonctionnalités fournies avec la version Standard LabCollector, comme le module équipement, qui permet de lister tous nos équipements et de gérer leur maintenance passée et future, et la gestion des stocks, qui permet de gérer nos commandes de réactifs et le stockage des échantillons en centralisant tout ce dont nous avons besoin en un seul endroit. »

Résultats

Points positifs de LabCollector:

  • Moins chèr que les autres fournisseurs
  • Une entreprise française rend la communication rapide et simple
  • Licence perpétuelle
  • Système non fermé, évolutif et entièrement développé pour notre projet (utilisant un workflow Illumina-NGS)
  • Contient des modules supplémentaires pour la gestion des équipements et des stocks
  • Récupération de données de différents équipements par analyse

Moins cher que les autres concurrents

"Enfin et surtout le bon prix de LabCollector la valeur qu'il apportait à notre flux de travail quotidien en laboratoire était un point très positif, étant moins cher que les autres concurrents. LabCollector se distingue également de la concurrence par sa politique tarifaire, car il s'agit d'une licence perpétuelle par rapport à une location annuelle couramment proposée sur le marché LIMS, ce qui en fait une offre solide même à long terme. Nous avons également apprécié de nombreuses fonctionnalités fournies avec le Standard LabCollector, comme le module équipement, qui permet de lister tous nos équipements et de gérer leur maintenance passée et future, et la gestion des stocks, qui permet de gérer nos commandes de réactifs et le stockage des échantillons en centralisant tout ce dont nous avons besoin en un seul endroit. »

LabCollector Équipe de soutien

"Durant notre projet et la période de mise en œuvre de LabCollector dans notre laboratoire, le LabCollector Le support nous a aidé à résoudre certains problèmes auxquels nous avons été confrontés, tels que la saturation de notre stockage de données sur notre serveur local, nous avons ensuite rapidement déplacé les dossiers de ciblage vers un pilote plus grand. Un autre point est que lors de la mise en œuvre d'un LIMS, il n'est pas facile de savoir ce que nous voulions au départ en ce qui concerne l'analyse des données de l'équipement et de comprendre comment cela fonctionnerait avec le LIMS, car il peut être difficile de le modifier au cours du projet. LabCollector le support était là pour nous conseiller à ce sujet, et l'analyse des données devient beaucoup plus efficace. »

Intégration et automatisation des instruments

"LabCollector a su répondre à nos demandes et bien plus encore. Nous avons vraiment apprécié la facilité de communication avec le support, ainsi que le fait d'être une entreprise française qui a rendu l'ensemble du processus plus fluide. L'une des caractéristiques les plus fortes de LabCollector c'est offrir de l'extrême la flexibilité et un système évolutif étant capable de s'adapter au flux de travail Illumina-NGS, ainsi que de proposer la liaison d'instruments pour récupérer nos résultats à partir des nombreux équipements, nous disposons notamment du séquenceur Illumina HiSeq. Nous pouvons alors récupérer nos résultats automatiquement à l'intérieur LabCollector cela a rendu notre travail plus simple et productif, un point très important lorsque nous gérons un grand projet NGS comme le nôtre. » - Directeur de laboratoire

« Nous disposions déjà d'un LIMS pour gérer les échantillons d'ADN en banque, mais il n'offrait pas les fonctionnalités que l'on retrouve dans LabCollector. »