Importálja adatait (5.3 és újabb verzió) - LabCollector

Keresés a Tudásbázisban kulcsszó szerint

Ön itt van:
← Minden téma
MINDEN felhasználó számára elérhető, kivéve a felhasználói és látogatói szintű engedélyeket

 Készítse elő LabCollector adatbázis. Az adatok importálása előtt konfigurálnia kell az adatokat importáló modult a szükséges mezők létrehozásával és a lehetséges értékek hozzáadásával, ahol szükséges. Lásd a mi KB-Egyéni mező létrehozása 5.2v az egyéni mezők létrehozásával kapcsolatos további információkért.
Győződjön meg arról, hogy a PHP megnövelt korlátokkal rendelkezik: max_input_vars = 10000 vagy több (lásd KB-nagy fájlok importálása).

Ugrás: RENDSZERGAZDA > Adatok > Importálás és válassza ki azt a modult, ahová az adatokat importálni kívánja (modulonként egy fájl).

 Az adatimportálás csak ezzel működik CSV vagy más szöveges fájl, amely elválasztott adatokat tartalmaz (kivéve a szekvenciák és molekulák importálását), és nem közvetlenül az Excelből (kivéve, ha másolja/beilleszti adatait, lásd lent 2. pont), Access vagy más szoftverből. Adatait szöveges formátumba (DOS-os sortöréssel ellátott szövegfájl) konvertálhatja az Excelből vagy más adatbázistípusokból választott mezőhatárolókkal. Mac OS-fájlok esetén mentse azokat CSV-formátumban Windowshoz.

Törzs és sejtek – Minták – Reagensek és kellékek – Antitestek – Plazmidok – Primerek – Állatok – Berendezések – Címjegyzék – Egyedi modulok

Válasszon egyet a fenti modulok közül, és kövesse az alábbi lépéseket.

1. Az adatok importálásához különböző fájlokat használhat: két ilyen fájlt kínál a LabCollector amely tartalmazza az Ön által választott modul összes mezőjét legendás címcímkékkel vagy adatbázisnév címcímkékkel CSV formátumban; egyébként létrehozhat saját fájlt a mezők nevével a kívánt sorrendben. A mezőneveknek azonban pontosan meg kell egyeznie az egyikben szereplő nevekkel LabCollectorfájljai.
A jelmagyarázat neve a mező neve a modulrekordban, űrlapon vagy az alapértelmezett/egyéni mezők mezőinek listájában, amelyet a mezőnek megad. Az adatbázis neve elérhető az alapértelmezett/egyéni mezőkben, és mentes a speciális karakterektől.


Rendszerezze úgy a fájlt, hogy az összes importálni kívánt mezőt tartalmazza. Az első sor a mezőneveknek felel meg. Egy mező oszloponként.

Importált adatok TARTALMAZNIA KELL kapcsolódó mezők név (ha a modulját Automatikus elnevezéssel állította be, hagyja üresen az oszlopot) és tulajdonos (kivéve, ha az importált tulajdonosok felülírását választja a speciális beállításoknál – lásd alább – vagy a modul nem használja a tulajdonos mezőt, mint a Reagens és kellékek modulban).
Mentse el ezt a fájlt txt (Tab) vagy CSV (vessző vagy pontosvessző elválasztóként).

2. Töltse fel a fájlt, vagy másolja/illessze be az importálni kívánt sorokat, MINDIG úgy, hogy az első sor megfeleljen a mezőneveknek.
A másolás/beillesztés excelből nagyon egyszerű: válassza ki a beilleszteni kívánt cellákat, és másolja be a mezőbe, ne felejtse el a fejléceket!

3. Válassza ki a mezőelválasztót. Ha Excelből másol/beilleszt, válassza a TAB elválasztót.

4. Ellenőrizze adatait, mielőtt a megerősítést választaná. Hiba esetén elveheti az importálást.

Speciális beállítások:
A jobb felső sarokban jelölje be a négyzetet a beállítások szakasz megnyitásához.

V. Alapértelmezés szerint a karakterek ISO-8859-1 kódolásúak. Ez lehetővé teszi a legtöbb speciális karakter importálását, például súlyos betűket, akut, diaeréziseket, cirkumflexet tartalmazó betűket… Bizonyos nyelvekhez (pl. kínai, görög…) UTF-8-at kell használni, ha olyan szoftvert használ, amely lehetővé teszi az UTF-formátumú CSV-formátumú mentést. 8 kódolásként (például LibreOffice).

B. Ha az Excel-fájlban nincs tulajdonos/főkezelő/felelős/szerző (modultól függően – a Reagensek és kellékek és a Címjegyzék modulok nem tartalmaznak tulajdonos mezőket), vagy ha felül szeretné írni ezt a mezőt, válasszon ki egy tulajdonost a listából. A rendszergazdák bármilyen néven importálhatnak adatokat. A személyzet csak a saját nevükön importálhat. Jegyzet: Mint 5.4 verzió a Tulajdonos mező egy opcionális mező a Reagensek és kellékek részben.

C. Választhat egy várólistára való importálást. Ami a mód felhasználóját illeti, a rendszergazdának kell érvényesítenie az adatokat az ADMIN > Adatok > Várólista alatt. 

D. Ha a berendezését automatikus tárolási lehetőséggel konfigurálta, akkor közvetlenül itt érheti el ezt a tárolót. Nem választhatja ki a dobozt/helyet, LabCollector automatikusan hozzárendeli az összes tárhelyet.

A 2. lépésben lehetősége van az importálás eredményének ellenőrzésére a végső érvényesítés előtt.

  • Ha nincs hiba a fájlban, megerősítheti az importálást.

  • Ha elfelejtette a tulajdonos oszlopot, vagy elfelejtett kiválasztani egy tulajdonost a Speciális beállítások alatti kiválasztási listában, ezt a hibaüzenetet kapja

  • Ha olyan tulajdonost használ, aki nem szerepel a labortagok listáján, vagy hibázik, akkor ezt a hibaüzenetet kapja

  • Ha elfelejtette a név oszlopot, vagy rossz mezőelválasztót választott, ez a hibaüzenet jelenik meg

  • Ha a modulja úgy van beállítva Az ismétlődések blokkolása Az ADMIN > Beállítások > Records opciók alatt, és kétszer importálja ugyanazt a nevet, ezt az üzenetet fogja kapni

  • A jelölőnégyzet és a kiválasztási lista importálható. Az értéknek meg kell egyeznie a pontos értékekkel LabCollector. Ha az importfájlban használt érték helytelen, ezt az üzenetet kapja. Ha az importálást választja, a rendszer nem importálja a rossz értéket.

  • Több kijelölő lista és jelölőnégyzet mezőtípusok több értéket is tartalmazhatnak. Az értéknek meg kell egyeznie a pontos értékekkel LabCollector és | (CTRL+ALT+6) vagy kettőspont (:). Ne hagyjon szóközt az elválasztó előtt és után. Ha az importfájlban használt érték helytelen, az alábbi üzenet jelenik meg. Ha az importálást választja, a rendszer nem importálja a rossz értéket.

  • A „Link ide” és az automatikus kitöltési mezők importálhatók. A „Link ide” mezőben a fájl értékének meg kell egyeznie a rekord nevével LabCollector és | (CTRL+ALT+6) vagy kettőspont (:). Ne hagyjon szóközt az elválasztó előtt és után. Ha az importfájlban használt érték hibás, a rendszer nem importálja a rossz értéket. Az automatikus kiegészítés mező egy szövegmező, ha a rekord neve létezik, akkor hivatkozás jön létre; ha nem, akkor a szöveg elérhető

  • Új verzió 5.41! Az importáló rendszer lehetővé teszi az Opcionális egyedi kódmező és az egyéni mező egyediségének észlelését aktivált egyediség opció mellett.

 Minden importált rekordnak lehet projektkódja. Minden használt projektkódnak már léteznie kell a következőben LabCollector a helyes behozatal érdekében.

 Egyedi mezők, mint pl Adatbázis feltöltés és a Lemezmappa feltöltése nem importálható. Kérjük, használja az ingyenes kiegészítőt Egyedi mezőfájl feltöltése.

 A dátumot ééé-hh-nn vagy éé-hh-nn formátumban kell megadni, további részletekért olvassa el a KB-Formázási dátum értéke.


Genotípus

A genotípus címkéket szóközzel kell elválasztani.

Sorozatok


Közvetlenül feltöltheti a .FASTA fájlt (nem .fas) a következő formátumban:

>FN598458.1 Nem tenyésztett filofaringid csillós részleges 18S rRNS gén, GM2_C8 klón
ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGCATATGCTTGTCTTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGTTA
TACAAGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATTTATTTGACGATTGCCTTATATGGATAA
CCGAGGGAAACTTCAGCTAATACATGCTTGTCATTTGACGTATTTATTAGTTCCACCGATGGCTTAGGCC
TTTTGATGATTCATGATAACTGATCGAAGCGATTTCGCTACGTCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTCT
GATTGTAGTGTATTGGACTACAATGGCTATTACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGA
GCCTGAGAAACGGCTACTATGTCTACGGATAGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTGTAAATCACAGAG

és válasszon DNS, RNS vagy Protein típust. Ezenkívül ki kell választania az importálási sorozatok tulajdonosát (alapértelmezés szerint a fiók bejelentkezéséhez társított személyt).

Ha továbblép a 2. lépésre, a következőket kapja:

Megjegyzés: A sorozatokat a GenBankból is importálhatja a következőn keresztül Sorozatok modult.


Kémiai szerkezetek
MOL és SDF fájlformátum esetén a fájlt 3 fejlécsorral vagy opcionális címkékkel kell formázni (jelezze meg a címkék számát)

CDX fájlformátum esetén több fájlt vagy ZIP-fájlt is feltölthet.

2. lépés eredménye:


dokumentumok
Töltse fel a fájlt a többi modulhoz hasonlóan. Dokumentumait is társíthatja az iratokhoz.


Adja hozzá az oszlopot eredeti_fájl_neve tartalmazza az importálni kívánt dokumentum pontos nevét az importfájlba, vagy illesszen be sorokat az alábbi példa szerint.
Ezután töltse fel az importfájlt ÉS az összes importálni kívánt dokumentumot (több fájl az alábbiak szerint vagy egy zip).

A 2. lépésben ellenőrizheti a dokumentumok nevét.

Eredmény az adatbázisban az importálás után: